RNA–Protein interactions for RNA: YGR129W

SYF2, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF2, Length 648 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF2	YGR129W	PPE1	P38796	400 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	YJR061W	P40355	935 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	NUP84	P52891	726 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	PUN1	Q06991	263 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	YOR387C	Q08910	206 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	SLP1	Q12232	587 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	SNF5	P18480	905 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	STE13	P33894	931 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	DSE1	P40077	573 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	FTR1	P40088	404 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	SMC3	P47037	1230 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	VEL1	P53058	206 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	PSK2	Q08217	1101 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	SFA1	P32771	386 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	DUN1	P39009	513 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	TED1	P40533	473 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	GUF1	P46943	645 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	IML2	P47031	731 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	CTF18	P49956	741 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	FLC3	P53121	802 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	YGR266W	P53326	701 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	RSC2	Q06488	889 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	SPO21	Q12411	609 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	GAL10	P04397	699 aa		6.18	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	RAD3	P06839	778 aa		6.18	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	IME1	P21190	360 aa		6.18	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	OMA1	P36163	345 aa		6.18	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	GEM1	P39722	662 aa		6.18	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	LCB2	P40970	561 aa		6.18	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	PPT1	P53043	513 aa		6.18	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	PEX13	P80667	386 aa		6.18	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	6.17	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	6.17	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	6.17	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	RFC5	P38251	354 aa		6.17	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	6.17	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	CDC1	P40986	491 aa		6.17	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	UFE1	P41834	346 aa		6.17	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	YJR054W	P47114	497 aa		6.17	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	6.17	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	NPY1	P53164	384 aa		6.17	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	6.17	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	FAR11	P53917	953 aa		6.17	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	DON1	Q05610	365 aa		6.17	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	NBP2	Q12163	236 aa		6.17	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	MSN1	P22148	382 aa		6.16	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	COQ2	P32378	372 aa		6.16	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	XRS2	P33301	854 aa		6.16	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	PFS1	P38872	237 aa		6.16	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	GIP2	P40036	548 aa		6.16	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	6.16	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	6.16	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	6.16	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	6.16	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	YLR456W	Q06199	204 aa		6.16	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	6.16	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	LCB4	Q12246	624 aa		6.16	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	GIS3	Q12418	502 aa		6.16	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	6.15	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	6.15	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	RRT12	P25381	491 aa		6.15	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	6.15	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	6.15	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	SWI3	P32591	825 aa		6.15	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	SGE1	P33335	543 aa		6.15	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	HSP78	P33416	811 aa		6.15	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	ERV46	P39727	415 aa		6.15	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	YIL165C	P40446	119 aa		6.15	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	RSM25	P40496	264 aa		6.15	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	COG8	Q04632	607 aa		6.15	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	DDC1	Q08949	612 aa		6.15	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	ELG1	Q12050	791 aa		6.15	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		6.15	□□□□□ -1.42
SYF2	YGR129W	HFA1	P32874	2273 aa		6.14	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		6.14	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	COX3	P00420	269 aa		6.14	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	6.14	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	6.14	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	6.14	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	VBA3	P25594	458 aa		6.14	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	RSC6	P25632	483 aa		6.14	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	6.14	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	VBA5	P36172	582 aa		6.14	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	ECM13	P38195	257 aa		6.14	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	SAK1	P38990	1142 aa		6.14	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	LTP1	P40347	161 aa		6.14	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	COQ5	P49017	307 aa		6.14	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	PEX14	P53112	341 aa		6.14	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	NRM1	P53718	249 aa		6.14	□□□□□ -1.43
SYF2	YGR129W	TIM8	P57744	87 aa		6.14	□□□□□ -1.43

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