RNA–Protein interactions for RNA: YDR069C

DOA4, Transcript of Ubiquitin hydrolase, yeastyeast

Gene DOA4, Length 2,781 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DOA4YDR069C TY1B-OLQ12273 1755 aa3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C TY1B-PLQ12414 1755 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C PDE2P06776 526 aa3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C SPE2P21182 396 aa3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C MSB1P21339 1137 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C MSH2P25847 964 aa3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C MEI4P29467 408 aa3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C NIP1P32497 812 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C SMI1P32566 505 aa3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C ABD1P32783 436 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C PXA2P34230 853 aa3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C RCN1P36054 211 aa3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C YKR015CP36111 568 aa3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C VPS51P36116 164 aa3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C PMC1P38929 1173 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C MPT5P39016 859 aaKnown RBP RIP-Chip data3.3□□□□□ -1.88not detected
DOA4YDR069C PIK1P39104 1066 aa3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C BUD16P39988 312 aa3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C CCT5P40413 562 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C CTH1P47976 325 aa3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C TEL2P53038 688 aa3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C SPC105P53148 917 aa3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C YGR054WP53235 642 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C ALF1P53904 254 aa3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C TFB2Q02939 513 aa3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C COX20Q04935 205 aa3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C MCM21Q06675 368 aa3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C MLH2Q07980 695 aa3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C FAP7Q12055 197 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C SEY1Q99287 776 aa3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C KRE5P22023 1365 aa3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C IPP1P00817 287 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C SIR3P06701 978 aa3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C DAP2P18962 818 aa3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C NPL6P32832 435 aa3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C ATO2P32907 282 aa3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C PMT1P33775 817 aa3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C YKL107WP34251 309 aa3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C SPP381P38282 291 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C VMA22P38784 181 aa3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C TDA11P38854 504 aa3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C DSS1P39112 969 aa3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C GPB2P39717 880 aa3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C MKT1P40850 830 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C YJL049WP47048 450 aa3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C CCT8P47079 568 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C VHS3Q08438 674 aa3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C GET4Q12125 312 aa3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C SNT2P53127 1403 aa3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C RAP1P11938 827 aa3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C PGI1P12709 554 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C STF2P16965 84 aa3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C GRX1P25373 110 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C JNM1P36224 373 aa3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C GRX7P38068 203 aa3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C POP7P38291 140 aa3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C VTC2P43585 828 aa3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C ROK1P45818 564 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C DAS1P47005 663 aa3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C YJL045WP47052 634 aa3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C EGD1Q02642 157 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C RBA50Q04418 439 aa3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C EAF1Q06337 982 aa3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C ATG13Q06628 738 aa3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C BDF2Q07442 638 aa3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C ADY3Q07732 790 aa3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C DIS3Q08162 1001 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C SSF2Q12153 453 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C ARP6Q12509 438 aa3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C ADE8P04161 214 aa3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C SES1P07284 462 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C GCN3P14741 305 aa3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C GLK1P17709 500 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C UBC1P21734 215 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C DAL7P21826 554 aa3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C KIN3P22209 435 aa3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C OCA4P25366 362 aa3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C AGP1P25376 633 aa3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C SBA1P28707 216 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C ANP1P32629 500 aa3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C PIN4P34217 668 aaKnown RBP RIP-Chip data3.29□□□□□ -1.88not detected
DOA4YDR069C RRF1P38771 230 aa3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C REV7P38927 245 aa3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C STN1P38960 494 aa3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C YER186CP40101 306 aa3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C AXL1P40851 1208 aa3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C HAM1P47119 197 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C KAP114P53067 1004 aa3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C COG6P53959 839 aa3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C NAN1Q02931 896 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C PPM1Q04081 328 aa3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C SEC10Q06245 871 aa3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C DTD1Q07648 150 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C YOR131CQ12486 218 aa3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C COQ4O13525 335 aa3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C SBP1P10080 294 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C ACE2P21192 770 aa3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C VPS3P23643 1011 aa3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C TFC4P33339 1025 aa3.29□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C ABZ1P37254 787 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
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