RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rhebl1Q9D8T3 184 aa10.73□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ypel1Q9ESC7 118 aa10.73□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Suclg1Q9WUM5 346 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SonQ9QX47 2444 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Csmd1Q923L3 3564 aa10.73□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igkv13-84A0A140T8N3 115 aa10.73□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igkv5-37A0A140T8N4 115 aa10.73□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm14692A2BH01 229 aa10.73□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klri1B2KG20 248 aa10.73□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 H2-DMaP28078 261 aa10.73□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hist1h1bP43276 223 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TspoP50637 169 aa10.73□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rab2aP53994 212 aa10.73□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Oas1bQ60856 376 aa10.73□□□□□ -0.69
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Galnt14Q8BVG5 550 aa10.73□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1239Q8VGM8 305 aa10.73□□□□□ -0.69
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ndufb8Q9D6J5 186 aa10.73□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plekha2Q9ERS5 425 aa10.73□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fbxl17Q9QZN1 701 aa10.73□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ighv1-76A0A0G2JFE9 117 aa10.72□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd46O88174 365 aa10.72□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PomcP01193 235 aa10.72□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PtafrQ62035 341 aa10.72□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bpifb3Q80ZU7 473 aa10.72□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mr1Q8HWB0 341 aa10.72□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MrgprfQ8VCJ6 343 aa10.72□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mus81Q91ZJ0 551 aa10.72□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4933407L21RikQ9D476 131 aa10.72□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pfdn5Q9WU28 154 aa10.72□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DeddQ9Z1L3 318 aa10.72□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dopey1Q8BL99 2399 aa10.72□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trav12-1A0N8R1 115 aa10.72□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wdr86D3Z757 380 aa10.72□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm12830F6XVH0 157 aa10.72□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Chek1O35280 476 aa10.72□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Saa1P05366 122 aa10.72□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hoxa5P09021 270 aa10.72□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rab5cP35278 216 aa10.72□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 EnsaP60840 121 aa10.72□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rhox4gQ2MDF7 205 aa10.72□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rhox4dQ2MDG0 205 aa10.72□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rhox4eQ504P9 205 aa10.72□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tff3Q62395 81 aa10.72□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp455Q7M6X9 461 aa10.72□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 C030005K15RikQ8BQN9 115 aa10.72□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpr84Q8CIM5 396 aa10.72□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hspa12aQ8K0U4 675 aa10.72□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RhovQ8VDU1 236 aa10.72□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 FrkQ922K9 512 aa10.72□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spsb1Q9D5L7 273 aa10.72□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rhox4bQ9JI43 205 aa10.72□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atoh7Q9Z2E5 149 aa10.72□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trbv5A0A0B4J1G9 113 aa10.71□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ighv1-67A0A0G2JFN9 117 aa10.71□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Samt1A2BED8 237 aa10.71□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm15140A2BEE3 237 aa10.71□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm21863J3KMP8 111 aa10.71□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1181Q7TR18 311 aa10.71□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr921Q7TRC0 313 aa10.71□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q80W69 301 aa10.71□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mef2cQ8CFN5 474 aa10.71□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam110aQ8R184 296 aa10.71□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Exosc2Q8VBV3 293 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Egln1Q91YE3 400 aa10.71□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stard4Q99JV5 224 aa10.71□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrrc29A0A1B0GQY9 621 aa10.71□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp334A2A4U6 679 aa10.71□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GzmbP04187 247 aa10.71□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pdcd6P12815 191 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Evx1P23683 416 aa10.71□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vamp2P63044 116 aa10.71□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 UbdP63072 162 aa10.71□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ShbgP97497 403 aa10.71□□□□□ -0.69
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 A230072I06RikQ3UUJ8 172 aa10.71□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PiglQ5SX19 252 aa10.71□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tbr1Q64336 681 aa10.71□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PnlipQ6P8U6 465 aa10.71□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GfralQ6SJE0 393 aa10.71□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 OpalinQ7M750 143 aa10.71□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1000Q7TR99 314 aa10.71□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm10600Q8BQ57 223 aa10.71□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 FarsaQ8C0C7 508 aa10.71□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ssxb2Q8C5Z3 165 aa10.71□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SpartQ8R1X6 671 aa10.71□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r4Q8R2D3 297 aa10.71□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr469Q8VF66 314 aa10.71□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sval1Q9D2X6 151 aa10.71□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sun5Q9DA32 373 aa10.71□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd5lQ9QWK4 352 aa10.71□□□□□ -0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DspE9Q557 2883 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tcrg-C4A0A075B6C7 190 aa10.71□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lce6aD3YV94 81 aa10.71□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm15440D3Z3P4 90 aa10.71□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P18532 116 aa10.71□□□□□ -0.7
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