Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU1

Rhov, Rho-related GTP-binding protein RhoV, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhovQ8VDU1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28,95■■■□□ 2,22
RhovQ8VDU1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
RhovQ8VDU1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
RhovQ8VDU1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,89■■□□□ 1,9
RhovQ8VDU1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
RhovQ8VDU1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
RhovQ8VDU1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
RhovQ8VDU1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25,95■■□□□ 1,74
RhovQ8VDU1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
RhovQ8VDU1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25,75■■□□□ 1,71
RhovQ8VDU1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
RhovQ8VDU1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
RhovQ8VDU1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25,25■■□□□ 1,63
RhovQ8VDU1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
RhovQ8VDU1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25,14■■□□□ 1,61
RhovQ8VDU1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
RhovQ8VDU1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24,96■■□□□ 1,59
RhovQ8VDU1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
RhovQ8VDU1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
RhovQ8VDU1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
RhovQ8VDU1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
RhovQ8VDU1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
RhovQ8VDU1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
RhovQ8VDU1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
RhovQ8VDU1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
RhovQ8VDU1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
RhovQ8VDU1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
RhovQ8VDU1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24,41■■□□□ 1,5
RhovQ8VDU1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
RhovQ8VDU1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
RhovQ8VDU1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,24■■□□□ 1,47
RhovQ8VDU1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24,24■■□□□ 1,47
RhovQ8VDU1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
RhovQ8VDU1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
RhovQ8VDU1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
RhovQ8VDU1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
RhovQ8VDU1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
RhovQ8VDU1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
RhovQ8VDU1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
RhovQ8VDU1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
RhovQ8VDU1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23,82■■□□□ 1,4
RhovQ8VDU1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23,82■■□□□ 1,4
RhovQ8VDU1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
RhovQ8VDU1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
RhovQ8VDU1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
RhovQ8VDU1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23,77■■□□□ 1,4
RhovQ8VDU1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,73■■□□□ 1,39
RhovQ8VDU1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
RhovQ8VDU1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
RhovQ8VDU1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23,65■■□□□ 1,38
RhovQ8VDU1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23,65■■□□□ 1,38
RhovQ8VDU1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
RhovQ8VDU1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,38
RhovQ8VDU1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
RhovQ8VDU1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
RhovQ8VDU1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
RhovQ8VDU1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
RhovQ8VDU1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,22■■□□□ 1,31
RhovQ8VDU1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
RhovQ8VDU1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,16■■□□□ 1,3
RhovQ8VDU1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
RhovQ8VDU1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
RhovQ8VDU1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
RhovQ8VDU1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23,08■■□□□ 1,29
RhovQ8VDU1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23■■□□□ 1,27
RhovQ8VDU1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
RhovQ8VDU1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22,97■■□□□ 1,27
RhovQ8VDU1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
RhovQ8VDU1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
RhovQ8VDU1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,93■■□□□ 1,26
RhovQ8VDU1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,91■■□□□ 1,26
RhovQ8VDU1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,91■■□□□ 1,26
RhovQ8VDU1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
RhovQ8VDU1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
RhovQ8VDU1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
RhovQ8VDU1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,87■■□□□ 1,25
RhovQ8VDU1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22,83■■□□□ 1,24
RhovQ8VDU1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,82■■□□□ 1,24
RhovQ8VDU1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
RhovQ8VDU1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
RhovQ8VDU1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22,78■■□□□ 1,24
RhovQ8VDU1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
RhovQ8VDU1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22,76■■□□□ 1,23
RhovQ8VDU1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22,76■■□□□ 1,23
RhovQ8VDU1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
RhovQ8VDU1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,75■■□□□ 1,23
RhovQ8VDU1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
RhovQ8VDU1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
RhovQ8VDU1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
RhovQ8VDU1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22,67■■□□□ 1,22
RhovQ8VDU1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,63■■□□□ 1,21
RhovQ8VDU1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
RhovQ8VDU1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
RhovQ8VDU1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
RhovQ8VDU1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
RhovQ8VDU1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
RhovQ8VDU1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
RhovQ8VDU1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
RhovQ8VDU1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
RhovQ8VDU1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
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