Protein–RNA interactions for Protein: P53994

Rab2a, Ras-related protein Rab-2A, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab2aP53994 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rab2aP53994 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Rab2aP53994 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rab2aP53994 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rab2aP53994 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Rab2aP53994 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Rab2aP53994 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rab2aP53994 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab2aP53994 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab2aP53994 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab2aP53994 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab2aP53994 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rab2aP53994 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rab2aP53994 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rab2aP53994 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rab2aP53994 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rab2aP53994 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rab2aP53994 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rab2aP53994 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab2aP53994 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab2aP53994 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab2aP53994 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab2aP53994 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab2aP53994 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab2aP53994 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab2aP53994 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab2aP53994 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab2aP53994 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rab2aP53994 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rab2aP53994 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rab2aP53994 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rab2aP53994 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab2aP53994 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rab2aP53994 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Rab2aP53994 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rab2aP53994 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rab2aP53994 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab2aP53994 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rab2aP53994 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rab2aP53994 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rab2aP53994 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab2aP53994 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab2aP53994 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rab2aP53994 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab2aP53994 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab2aP53994 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rab2aP53994 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab2aP53994 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab2aP53994 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab2aP53994 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab2aP53994 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rab2aP53994 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rab2aP53994 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rab2aP53994 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab2aP53994 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab2aP53994 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab2aP53994 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab2aP53994 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab2aP53994 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab2aP53994 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab2aP53994 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab2aP53994 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab2aP53994 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab2aP53994 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab2aP53994 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab2aP53994 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab2aP53994 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rab2aP53994 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab2aP53994 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab2aP53994 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab2aP53994 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab2aP53994 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab2aP53994 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab2aP53994 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab2aP53994 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab2aP53994 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab2aP53994 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab2aP53994 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab2aP53994 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab2aP53994 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab2aP53994 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rab2aP53994 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab2aP53994 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab2aP53994 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab2aP53994 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab2aP53994 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab2aP53994 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab2aP53994 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab2aP53994 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab2aP53994 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab2aP53994 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab2aP53994 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab2aP53994 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab2aP53994 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab2aP53994 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab2aP53994 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab2aP53994 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab2aP53994 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab2aP53994 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab2aP53994 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms