Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2X6

Sval1, Colon SVA-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sval1Q9D2X6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Sval1Q9D2X6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,51■■□□□ 1,99
Sval1Q9D2X6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Sval1Q9D2X6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27,15■■□□□ 1,94
Sval1Q9D2X6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26,78■■□□□ 1,88
Sval1Q9D2X6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Sval1Q9D2X6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Sval1Q9D2X6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Sval1Q9D2X6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Sval1Q9D2X6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Sval1Q9D2X6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Sval1Q9D2X6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Sval1Q9D2X6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Sval1Q9D2X6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Sval1Q9D2X6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Sval1Q9D2X6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Sval1Q9D2X6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25,04■■□□□ 1,6
Sval1Q9D2X6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Sval1Q9D2X6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Sval1Q9D2X6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24,83■■□□□ 1,56
Sval1Q9D2X6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Sval1Q9D2X6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24,72■■□□□ 1,55
Sval1Q9D2X6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Sval1Q9D2X6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Sval1Q9D2X6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Sval1Q9D2X6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Sval1Q9D2X6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,38■■□□□ 1,49
Sval1Q9D2X6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24,32■■□□□ 1,48
Sval1Q9D2X6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Sval1Q9D2X6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24,21■■□□□ 1,47
Sval1Q9D2X6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,21■■□□□ 1,47
Sval1Q9D2X6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Sval1Q9D2X6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Sval1Q9D2X6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Sval1Q9D2X6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24,13■■□□□ 1,45
Sval1Q9D2X6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Sval1Q9D2X6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24,08■■□□□ 1,45
Sval1Q9D2X6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Sval1Q9D2X6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24,05■■□□□ 1,44
Sval1Q9D2X6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Sval1Q9D2X6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Sval1Q9D2X6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Sval1Q9D2X6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Sval1Q9D2X6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Sval1Q9D2X6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23,83■■□□□ 1,41
Sval1Q9D2X6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Sval1Q9D2X6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,76■■□□□ 1,39
Sval1Q9D2X6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Sval1Q9D2X6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Sval1Q9D2X6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Sval1Q9D2X6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Sval1Q9D2X6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Sval1Q9D2X6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Sval1Q9D2X6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Sval1Q9D2X6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Sval1Q9D2X6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Sval1Q9D2X6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Sval1Q9D2X6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Sval1Q9D2X6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,32
Sval1Q9D2X6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,31■■□□□ 1,32
Sval1Q9D2X6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Sval1Q9D2X6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,28■■□□□ 1,32
Sval1Q9D2X6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Sval1Q9D2X6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,23■■□□□ 1,31
Sval1Q9D2X6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Sval1Q9D2X6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Sval1Q9D2X6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Sval1Q9D2X6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23,07■■□□□ 1,28
Sval1Q9D2X6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Sval1Q9D2X6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Sval1Q9D2X6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Sval1Q9D2X6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Sval1Q9D2X6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Sval1Q9D2X6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Sval1Q9D2X6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Sval1Q9D2X6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22,92■■□□□ 1,26
Sval1Q9D2X6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22,91■■□□□ 1,26
Sval1Q9D2X6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Sval1Q9D2X6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,9■■□□□ 1,26
Sval1Q9D2X6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22,87■■□□□ 1,25
Sval1Q9D2X6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22,85■■□□□ 1,25
Sval1Q9D2X6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22,85■■□□□ 1,25
Sval1Q9D2X6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Sval1Q9D2X6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
Sval1Q9D2X6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22,78■■□□□ 1,24
Sval1Q9D2X6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Sval1Q9D2X6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Sval1Q9D2X6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,72■■□□□ 1,23
Sval1Q9D2X6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22,71■■□□□ 1,23
Sval1Q9D2X6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,68■■□□□ 1,22
Sval1Q9D2X6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
Sval1Q9D2X6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
Sval1Q9D2X6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
Sval1Q9D2X6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
Sval1Q9D2X6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,61■■□□□ 1,21
Sval1Q9D2X6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22,61■■□□□ 1,21
Sval1Q9D2X6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
Sval1Q9D2X6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
Sval1Q9D2X6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
Sval1Q9D2X6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,57■■□□□ 1,2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24,4 ms