Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX19

Pigl, N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol de-N-acetylase, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PiglQ5SX19 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
PiglQ5SX19 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PiglQ5SX19 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PiglQ5SX19 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PiglQ5SX19 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PiglQ5SX19 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PiglQ5SX19 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PiglQ5SX19 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PiglQ5SX19 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PiglQ5SX19 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PiglQ5SX19 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PiglQ5SX19 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PiglQ5SX19 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PiglQ5SX19 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PiglQ5SX19 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PiglQ5SX19 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PiglQ5SX19 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PiglQ5SX19 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PiglQ5SX19 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PiglQ5SX19 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PiglQ5SX19 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PiglQ5SX19 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PiglQ5SX19 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PiglQ5SX19 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PiglQ5SX19 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PiglQ5SX19 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PiglQ5SX19 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PiglQ5SX19 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PiglQ5SX19 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PiglQ5SX19 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PiglQ5SX19 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PiglQ5SX19 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PiglQ5SX19 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PiglQ5SX19 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PiglQ5SX19 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PiglQ5SX19 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PiglQ5SX19 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PiglQ5SX19 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PiglQ5SX19 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PiglQ5SX19 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PiglQ5SX19 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PiglQ5SX19 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PiglQ5SX19 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PiglQ5SX19 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PiglQ5SX19 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PiglQ5SX19 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PiglQ5SX19 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PiglQ5SX19 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PiglQ5SX19 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PiglQ5SX19 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PiglQ5SX19 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PiglQ5SX19 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PiglQ5SX19 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PiglQ5SX19 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PiglQ5SX19 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PiglQ5SX19 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PiglQ5SX19 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PiglQ5SX19 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PiglQ5SX19 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PiglQ5SX19 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PiglQ5SX19 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PiglQ5SX19 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PiglQ5SX19 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PiglQ5SX19 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PiglQ5SX19 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PiglQ5SX19 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PiglQ5SX19 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PiglQ5SX19 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PiglQ5SX19 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PiglQ5SX19 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PiglQ5SX19 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PiglQ5SX19 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PiglQ5SX19 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PiglQ5SX19 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PiglQ5SX19 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PiglQ5SX19 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PiglQ5SX19 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PiglQ5SX19 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PiglQ5SX19 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PiglQ5SX19 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PiglQ5SX19 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PiglQ5SX19 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PiglQ5SX19 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PiglQ5SX19 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PiglQ5SX19 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PiglQ5SX19 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PiglQ5SX19 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PiglQ5SX19 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PiglQ5SX19 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PiglQ5SX19 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PiglQ5SX19 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PiglQ5SX19 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PiglQ5SX19 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PiglQ5SX19 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PiglQ5SX19 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PiglQ5SX19 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PiglQ5SX19 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PiglQ5SX19 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PiglQ5SX19 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PiglQ5SX19 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms