Protein–RNA interactions for Protein: P05366

Saa1, Serum amyloid A-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa1P05366 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28,95■■■□□ 2,22
Saa1P05366 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Saa1P05366 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Saa1P05366 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,76■■■□□ 2,04
Saa1P05366 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26,91■■□□□ 1,9
Saa1P05366 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Saa1P05366 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Saa1P05366 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Saa1P05366 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Saa1P05366 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Saa1P05366 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Saa1P05366 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26,02■■□□□ 1,76
Saa1P05366 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Saa1P05366 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Saa1P05366 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Saa1P05366 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25,71■■□□□ 1,71
Saa1P05366 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Saa1P05366 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25,57■■□□□ 1,68
Saa1P05366 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Saa1P05366 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Saa1P05366 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Saa1P05366 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Saa1P05366 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Saa1P05366 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Saa1P05366 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Saa1P05366 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Saa1P05366 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Saa1P05366 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Saa1P05366 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24,93■■□□□ 1,58
Saa1P05366 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Saa1P05366 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Saa1P05366 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24,8■■□□□ 1,56
Saa1P05366 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,79■■□□□ 1,56
Saa1P05366 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24,78■■□□□ 1,56
Saa1P05366 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Saa1P05366 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Saa1P05366 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Saa1P05366 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,6■■□□□ 1,53
Saa1P05366 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24,41■■□□□ 1,5
Saa1P05366 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Saa1P05366 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Saa1P05366 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Saa1P05366 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,34■■□□□ 1,49
Saa1P05366 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24,28■■□□□ 1,48
Saa1P05366 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Saa1P05366 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
Saa1P05366 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Saa1P05366 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24,15■■□□□ 1,46
Saa1P05366 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Saa1P05366 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Saa1P05366 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Saa1P05366 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Saa1P05366 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,91■■□□□ 1,42
Saa1P05366 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23,89■■□□□ 1,41
Saa1P05366 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Saa1P05366 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Saa1P05366 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23,83■■□□□ 1,41
Saa1P05366 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Saa1P05366 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Saa1P05366 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Saa1P05366 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
Saa1P05366 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,76■■□□□ 1,39
Saa1P05366 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,74■■□□□ 1,39
Saa1P05366 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
Saa1P05366 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Saa1P05366 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,38
Saa1P05366 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,61■■□□□ 1,37
Saa1P05366 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Saa1P05366 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Saa1P05366 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Saa1P05366 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Saa1P05366 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Saa1P05366 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23,42■■□□□ 1,34
Saa1P05366 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Saa1P05366 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,35■■□□□ 1,33
Saa1P05366 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Saa1P05366 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Saa1P05366 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Saa1P05366 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Saa1P05366 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Saa1P05366 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Saa1P05366 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,3
Saa1P05366 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23,1■■□□□ 1,29
Saa1P05366 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,05■■□□□ 1,28
Saa1P05366 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Saa1P05366 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Saa1P05366 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Saa1P05366 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Saa1P05366 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Saa1P05366 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Saa1P05366 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Saa1P05366 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Saa1P05366 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22,93■■□□□ 1,26
Saa1P05366 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Saa1P05366 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Saa1P05366 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Saa1P05366 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22,89■■□□□ 1,25
Saa1P05366 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22,85■■□□□ 1,25
Saa1P05366 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Saa1P05366 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22,81■■□□□ 1,24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms