Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZN1

Fbxl17, F-box/LRR-repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxl17Q9QZN1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Fbxl17Q9QZN1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26,91■■□□□ 1,9
Fbxl17Q9QZN1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,71■■□□□ 1,87
Fbxl17Q9QZN1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Fbxl17Q9QZN1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Fbxl17Q9QZN1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26,17■■□□□ 1,78
Fbxl17Q9QZN1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Fbxl17Q9QZN1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Fbxl17Q9QZN1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Fbxl17Q9QZN1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Fbxl17Q9QZN1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Fbxl17Q9QZN1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Fbxl17Q9QZN1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Fbxl17Q9QZN1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Fbxl17Q9QZN1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Fbxl17Q9QZN1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Fbxl17Q9QZN1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Fbxl17Q9QZN1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Fbxl17Q9QZN1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24,47■■□□□ 1,51
Fbxl17Q9QZN1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
Fbxl17Q9QZN1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24,07■■□□□ 1,44
Fbxl17Q9QZN1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
Fbxl17Q9QZN1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Fbxl17Q9QZN1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Fbxl17Q9QZN1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Fbxl17Q9QZN1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Fbxl17Q9QZN1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Fbxl17Q9QZN1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23,71■■□□□ 1,39
Fbxl17Q9QZN1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23,7■■□□□ 1,39
Fbxl17Q9QZN1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Fbxl17Q9QZN1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,68■■□□□ 1,38
Fbxl17Q9QZN1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Fbxl17Q9QZN1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,66■■□□□ 1,38
Fbxl17Q9QZN1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Fbxl17Q9QZN1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Fbxl17Q9QZN1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Fbxl17Q9QZN1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Fbxl17Q9QZN1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23,34■■□□□ 1,33
Fbxl17Q9QZN1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,32■■□□□ 1,32
Fbxl17Q9QZN1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Fbxl17Q9QZN1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Fbxl17Q9QZN1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23,26■■□□□ 1,31
Fbxl17Q9QZN1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23,25■■□□□ 1,31
Fbxl17Q9QZN1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,21■■□□□ 1,31
Fbxl17Q9QZN1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Fbxl17Q9QZN1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Fbxl17Q9QZN1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23,19■■□□□ 1,3
Fbxl17Q9QZN1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Fbxl17Q9QZN1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Fbxl17Q9QZN1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Fbxl17Q9QZN1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Fbxl17Q9QZN1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Fbxl17Q9QZN1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Fbxl17Q9QZN1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
Fbxl17Q9QZN1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22,84■■□□□ 1,25
Fbxl17Q9QZN1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
Fbxl17Q9QZN1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22,77■■□□□ 1,24
Fbxl17Q9QZN1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,76■■□□□ 1,23
Fbxl17Q9QZN1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,75■■□□□ 1,23
Fbxl17Q9QZN1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
Fbxl17Q9QZN1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,68■■□□□ 1,22
Fbxl17Q9QZN1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
Fbxl17Q9QZN1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
Fbxl17Q9QZN1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,64■■□□□ 1,21
Fbxl17Q9QZN1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,64■■□□□ 1,21
Fbxl17Q9QZN1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
Fbxl17Q9QZN1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
Fbxl17Q9QZN1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,21
Fbxl17Q9QZN1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,2
Fbxl17Q9QZN1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,55■■□□□ 1,2
Fbxl17Q9QZN1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22,51■■□□□ 1,19
Fbxl17Q9QZN1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Fbxl17Q9QZN1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
Fbxl17Q9QZN1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22,46■■□□□ 1,19
Fbxl17Q9QZN1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
Fbxl17Q9QZN1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22,45■■□□□ 1,18
Fbxl17Q9QZN1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
Fbxl17Q9QZN1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
Fbxl17Q9QZN1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22,4■■□□□ 1,18
Fbxl17Q9QZN1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
Fbxl17Q9QZN1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,32■■□□□ 1,16
Fbxl17Q9QZN1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22,3■■□□□ 1,16
Fbxl17Q9QZN1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
Fbxl17Q9QZN1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,25■■□□□ 1,15
Fbxl17Q9QZN1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Fbxl17Q9QZN1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Fbxl17Q9QZN1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
Fbxl17Q9QZN1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22,21■■□□□ 1,15
Fbxl17Q9QZN1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
Fbxl17Q9QZN1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22,2■■□□□ 1,14
Fbxl17Q9QZN1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
Fbxl17Q9QZN1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
Fbxl17Q9QZN1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Fbxl17Q9QZN1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
Fbxl17Q9QZN1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
Fbxl17Q9QZN1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,09■■□□□ 1,13
Fbxl17Q9QZN1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,08■■□□□ 1,12
Fbxl17Q9QZN1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Fbxl17Q9QZN1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Fbxl17Q9QZN1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8,5 ms