Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZN1

Fbxl17, F-box/LRR-repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxl17Q9QZN1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fbxl17Q9QZN1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Fbxl17Q9QZN1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fbxl17Q9QZN1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Fbxl17Q9QZN1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fbxl17Q9QZN1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Fbxl17Q9QZN1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fbxl17Q9QZN1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fbxl17Q9QZN1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fbxl17Q9QZN1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fbxl17Q9QZN1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fbxl17Q9QZN1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fbxl17Q9QZN1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fbxl17Q9QZN1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fbxl17Q9QZN1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fbxl17Q9QZN1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fbxl17Q9QZN1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fbxl17Q9QZN1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fbxl17Q9QZN1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fbxl17Q9QZN1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fbxl17Q9QZN1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Fbxl17Q9QZN1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fbxl17Q9QZN1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fbxl17Q9QZN1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fbxl17Q9QZN1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fbxl17Q9QZN1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fbxl17Q9QZN1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fbxl17Q9QZN1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Fbxl17Q9QZN1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fbxl17Q9QZN1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fbxl17Q9QZN1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Fbxl17Q9QZN1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fbxl17Q9QZN1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fbxl17Q9QZN1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fbxl17Q9QZN1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fbxl17Q9QZN1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fbxl17Q9QZN1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fbxl17Q9QZN1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Fbxl17Q9QZN1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Fbxl17Q9QZN1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fbxl17Q9QZN1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fbxl17Q9QZN1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Fbxl17Q9QZN1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fbxl17Q9QZN1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fbxl17Q9QZN1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fbxl17Q9QZN1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fbxl17Q9QZN1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Fbxl17Q9QZN1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fbxl17Q9QZN1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fbxl17Q9QZN1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fbxl17Q9QZN1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxl17Q9QZN1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fbxl17Q9QZN1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fbxl17Q9QZN1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fbxl17Q9QZN1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fbxl17Q9QZN1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fbxl17Q9QZN1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fbxl17Q9QZN1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbxl17Q9QZN1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fbxl17Q9QZN1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fbxl17Q9QZN1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fbxl17Q9QZN1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbxl17Q9QZN1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbxl17Q9QZN1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fbxl17Q9QZN1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fbxl17Q9QZN1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fbxl17Q9QZN1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fbxl17Q9QZN1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fbxl17Q9QZN1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fbxl17Q9QZN1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fbxl17Q9QZN1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Fbxl17Q9QZN1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxl17Q9QZN1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxl17Q9QZN1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxl17Q9QZN1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxl17Q9QZN1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxl17Q9QZN1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxl17Q9QZN1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxl17Q9QZN1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxl17Q9QZN1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbxl17Q9QZN1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbxl17Q9QZN1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbxl17Q9QZN1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbxl17Q9QZN1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxl17Q9QZN1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxl17Q9QZN1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxl17Q9QZN1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxl17Q9QZN1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxl17Q9QZN1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxl17Q9QZN1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxl17Q9QZN1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxl17Q9QZN1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxl17Q9QZN1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxl17Q9QZN1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxl17Q9QZN1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxl17Q9QZN1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxl17Q9QZN1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fbxl17Q9QZN1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxl17Q9QZN1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxl17Q9QZN1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms