Protein–RNA interactions for Protein: Q7M750

Opalin, Opalin, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OpalinQ7M750 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28,95■■■□□ 2,22
OpalinQ7M750 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
OpalinQ7M750 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
OpalinQ7M750 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
OpalinQ7M750 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
OpalinQ7M750 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
OpalinQ7M750 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25,6■■□□□ 1,69
OpalinQ7M750 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
OpalinQ7M750 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,17■■□□□ 1,62
OpalinQ7M750 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25,02■■□□□ 1,6
OpalinQ7M750 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24,93■■□□□ 1,58
OpalinQ7M750 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
OpalinQ7M750 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
OpalinQ7M750 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24,78■■□□□ 1,56
OpalinQ7M750 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24,73■■□□□ 1,55
OpalinQ7M750 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
OpalinQ7M750 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
OpalinQ7M750 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
OpalinQ7M750 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
OpalinQ7M750 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
OpalinQ7M750 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24,31■■□□□ 1,48
OpalinQ7M750 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
OpalinQ7M750 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
OpalinQ7M750 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
OpalinQ7M750 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
OpalinQ7M750 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24,13■■□□□ 1,45
OpalinQ7M750 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
OpalinQ7M750 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
OpalinQ7M750 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
OpalinQ7M750 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
OpalinQ7M750 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
OpalinQ7M750 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
OpalinQ7M750 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
OpalinQ7M750 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
OpalinQ7M750 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
OpalinQ7M750 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
OpalinQ7M750 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
OpalinQ7M750 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
OpalinQ7M750 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23,64■■□□□ 1,37
OpalinQ7M750 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,61■■□□□ 1,37
OpalinQ7M750 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23,6■■□□□ 1,37
OpalinQ7M750 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
OpalinQ7M750 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
OpalinQ7M750 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
OpalinQ7M750 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23,5■■□□□ 1,35
OpalinQ7M750 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23,45■■□□□ 1,34
OpalinQ7M750 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
OpalinQ7M750 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,33■■□□□ 1,33
OpalinQ7M750 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23,29■■□□□ 1,32
OpalinQ7M750 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,29■■□□□ 1,32
OpalinQ7M750 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
OpalinQ7M750 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
OpalinQ7M750 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
OpalinQ7M750 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
OpalinQ7M750 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
OpalinQ7M750 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
OpalinQ7M750 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
OpalinQ7M750 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1,27
OpalinQ7M750 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
OpalinQ7M750 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22,94■■□□□ 1,26
OpalinQ7M750 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,91■■□□□ 1,26
OpalinQ7M750 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
OpalinQ7M750 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22,84■■□□□ 1,25
OpalinQ7M750 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
OpalinQ7M750 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
OpalinQ7M750 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
OpalinQ7M750 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22,73■■□□□ 1,23
OpalinQ7M750 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22,71■■□□□ 1,23
OpalinQ7M750 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
OpalinQ7M750 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
OpalinQ7M750 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
OpalinQ7M750 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
OpalinQ7M750 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
OpalinQ7M750 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,58■■□□□ 1,21
OpalinQ7M750 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22,58■■□□□ 1,21
OpalinQ7M750 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,54■■□□□ 1,2
OpalinQ7M750 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22,54■■□□□ 1,2
OpalinQ7M750 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,53■■□□□ 1,2
OpalinQ7M750 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22,5■■□□□ 1,19
OpalinQ7M750 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22,49■■□□□ 1,19
OpalinQ7M750 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
OpalinQ7M750 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
OpalinQ7M750 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22,47■■□□□ 1,19
OpalinQ7M750 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22,45■■□□□ 1,18
OpalinQ7M750 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22,44■■□□□ 1,18
OpalinQ7M750 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,44■■□□□ 1,18
OpalinQ7M750 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
OpalinQ7M750 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
OpalinQ7M750 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22,43■■□□□ 1,18
OpalinQ7M750 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
OpalinQ7M750 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,17
OpalinQ7M750 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
OpalinQ7M750 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22,33■■□□□ 1,17
OpalinQ7M750 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22,31■■□□□ 1,16
OpalinQ7M750 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,31■■□□□ 1,16
OpalinQ7M750 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
OpalinQ7M750 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
OpalinQ7M750 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
OpalinQ7M750 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22,27■■□□□ 1,16
OpalinQ7M750 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34,1 ms