Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJE0

Gfral, GDNF family receptor alpha-like, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GfralQ6SJE0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
GfralQ6SJE0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
GfralQ6SJE0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GfralQ6SJE0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
GfralQ6SJE0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
GfralQ6SJE0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GfralQ6SJE0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
GfralQ6SJE0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GfralQ6SJE0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GfralQ6SJE0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GfralQ6SJE0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GfralQ6SJE0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
GfralQ6SJE0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GfralQ6SJE0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GfralQ6SJE0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GfralQ6SJE0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GfralQ6SJE0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
GfralQ6SJE0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GfralQ6SJE0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
GfralQ6SJE0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GfralQ6SJE0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GfralQ6SJE0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GfralQ6SJE0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GfralQ6SJE0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GfralQ6SJE0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GfralQ6SJE0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GfralQ6SJE0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GfralQ6SJE0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GfralQ6SJE0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GfralQ6SJE0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GfralQ6SJE0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GfralQ6SJE0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GfralQ6SJE0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GfralQ6SJE0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GfralQ6SJE0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GfralQ6SJE0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GfralQ6SJE0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GfralQ6SJE0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GfralQ6SJE0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GfralQ6SJE0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GfralQ6SJE0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GfralQ6SJE0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GfralQ6SJE0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GfralQ6SJE0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GfralQ6SJE0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GfralQ6SJE0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GfralQ6SJE0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GfralQ6SJE0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GfralQ6SJE0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GfralQ6SJE0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GfralQ6SJE0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GfralQ6SJE0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GfralQ6SJE0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GfralQ6SJE0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
GfralQ6SJE0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GfralQ6SJE0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GfralQ6SJE0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GfralQ6SJE0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GfralQ6SJE0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GfralQ6SJE0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GfralQ6SJE0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GfralQ6SJE0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GfralQ6SJE0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GfralQ6SJE0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GfralQ6SJE0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GfralQ6SJE0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GfralQ6SJE0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GfralQ6SJE0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GfralQ6SJE0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GfralQ6SJE0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GfralQ6SJE0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GfralQ6SJE0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GfralQ6SJE0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GfralQ6SJE0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GfralQ6SJE0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GfralQ6SJE0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GfralQ6SJE0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GfralQ6SJE0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GfralQ6SJE0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GfralQ6SJE0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GfralQ6SJE0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GfralQ6SJE0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GfralQ6SJE0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GfralQ6SJE0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GfralQ6SJE0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GfralQ6SJE0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GfralQ6SJE0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GfralQ6SJE0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GfralQ6SJE0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GfralQ6SJE0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GfralQ6SJE0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GfralQ6SJE0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GfralQ6SJE0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GfralQ6SJE0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GfralQ6SJE0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GfralQ6SJE0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GfralQ6SJE0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GfralQ6SJE0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GfralQ6SJE0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GfralQ6SJE0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms