Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Z3

Ssxb2, Synovial sarcoma, X member B2, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb2Q8C5Z3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30,48■■■□□ 2,47
Ssxb2Q8C5Z3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Ssxb2Q8C5Z3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Ssxb2Q8C5Z3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Ssxb2Q8C5Z3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Ssxb2Q8C5Z3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,36■■□□□ 1,97
Ssxb2Q8C5Z3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27,13■■□□□ 1,93
Ssxb2Q8C5Z3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26,49■■□□□ 1,83
Ssxb2Q8C5Z3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Ssxb2Q8C5Z3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Ssxb2Q8C5Z3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26,34■■□□□ 1,81
Ssxb2Q8C5Z3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Ssxb2Q8C5Z3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26,12■■□□□ 1,77
Ssxb2Q8C5Z3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Ssxb2Q8C5Z3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Ssxb2Q8C5Z3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25,93■■□□□ 1,74
Ssxb2Q8C5Z3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Ssxb2Q8C5Z3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Ssxb2Q8C5Z3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Ssxb2Q8C5Z3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25,63■■□□□ 1,69
Ssxb2Q8C5Z3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Ssxb2Q8C5Z3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Ssxb2Q8C5Z3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Ssxb2Q8C5Z3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Ssxb2Q8C5Z3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Ssxb2Q8C5Z3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25,29■■□□□ 1,64
Ssxb2Q8C5Z3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Ssxb2Q8C5Z3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Ssxb2Q8C5Z3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Ssxb2Q8C5Z3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Ssxb2Q8C5Z3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Ssxb2Q8C5Z3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Ssxb2Q8C5Z3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25,06■■□□□ 1,6
Ssxb2Q8C5Z3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25,02■■□□□ 1,6
Ssxb2Q8C5Z3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24,9■■□□□ 1,58
Ssxb2Q8C5Z3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Ssxb2Q8C5Z3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Ssxb2Q8C5Z3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Ssxb2Q8C5Z3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Ssxb2Q8C5Z3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,71■■□□□ 1,55
Ssxb2Q8C5Z3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Ssxb2Q8C5Z3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Ssxb2Q8C5Z3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24,55■■□□□ 1,52
Ssxb2Q8C5Z3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Ssxb2Q8C5Z3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Ssxb2Q8C5Z3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24,34■■□□□ 1,49
Ssxb2Q8C5Z3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Ssxb2Q8C5Z3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
Ssxb2Q8C5Z3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,19■■□□□ 1,46
Ssxb2Q8C5Z3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24,16■■□□□ 1,46
Ssxb2Q8C5Z3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Ssxb2Q8C5Z3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Ssxb2Q8C5Z3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24,11■■□□□ 1,45
Ssxb2Q8C5Z3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Ssxb2Q8C5Z3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Ssxb2Q8C5Z3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Ssxb2Q8C5Z3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Ssxb2Q8C5Z3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1,43
Ssxb2Q8C5Z3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Ssxb2Q8C5Z3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,98■■□□□ 1,43
Ssxb2Q8C5Z3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
Ssxb2Q8C5Z3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,43
Ssxb2Q8C5Z3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
Ssxb2Q8C5Z3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
Ssxb2Q8C5Z3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23,85■■□□□ 1,41
Ssxb2Q8C5Z3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23,84■■□□□ 1,41
Ssxb2Q8C5Z3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23,84■■□□□ 1,41
Ssxb2Q8C5Z3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,81■■□□□ 1,4
Ssxb2Q8C5Z3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,81■■□□□ 1,4
Ssxb2Q8C5Z3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23,8■■□□□ 1,4
Ssxb2Q8C5Z3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,78■■□□□ 1,4
Ssxb2Q8C5Z3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
Ssxb2Q8C5Z3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,77■■□□□ 1,4
Ssxb2Q8C5Z3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
Ssxb2Q8C5Z3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
Ssxb2Q8C5Z3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Ssxb2Q8C5Z3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Ssxb2Q8C5Z3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23,7■■□□□ 1,38
Ssxb2Q8C5Z3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Ssxb2Q8C5Z3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Ssxb2Q8C5Z3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23,61■■□□□ 1,37
Ssxb2Q8C5Z3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Ssxb2Q8C5Z3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Ssxb2Q8C5Z3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Ssxb2Q8C5Z3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23,43■■□□□ 1,34
Ssxb2Q8C5Z3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23,42■■□□□ 1,34
Ssxb2Q8C5Z3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Ssxb2Q8C5Z3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,4■■□□□ 1,34
Ssxb2Q8C5Z3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
Ssxb2Q8C5Z3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Ssxb2Q8C5Z3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
Ssxb2Q8C5Z3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
Ssxb2Q8C5Z3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
Ssxb2Q8C5Z3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,32
Ssxb2Q8C5Z3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23,32■■□□□ 1,32
Ssxb2Q8C5Z3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Ssxb2Q8C5Z3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Ssxb2Q8C5Z3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Ssxb2Q8C5Z3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,24■■□□□ 1,31
Ssxb2Q8C5Z3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
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