RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hspa12aQ8K0U4 675 aa5.7□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 SptssaQ8R207 71 aa5.7□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Exosc2Q8VBV3 293 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1260Q8VGN9 310 aa5.7□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rpusd4Q9CWX4 377 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q9DAE8 263 aa5.7□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tbl1xQ9QXE7 527 aa5.7□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pfdn5Q9WU28 154 aa5.7□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Arpc1bQ9WV32 372 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ndufa7Q9Z1P6 113 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dock10Q8BZN6 2150 aa5.7□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm5678A0A1B0GRG8 277 aa5.7□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kdf1A2A9F4 397 aa5.7□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 4931429L15RikE9PVU2 379 aa5.7□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr555E9Q547 315 aa5.7□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr773F6VS78 311 aa5.7□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn1r204I7HIK1 302 aa5.7□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 G530012D18RikJ3QK25 139 aa5.7□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pitx3O35160 302 aa5.7□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cd74P04441 279 aa5.7□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 VegfdP97946 358 aa5.7□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1340Q3KPC7 315 aa5.7□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm5127Q3UQH6 212 aa5.7□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm12253Q5NC48 229 aa5.7□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr142Q60881 305 aa5.7□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PcolceQ61398 468 aa5.7□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ceacam10Q61400 265 aa5.7□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dll1Q61483 722 aa5.7□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp975Q6NVD6 525 aa5.7□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cdk3Q80YP0 303 aa5.7□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn1r217Q8R270 298 aa5.7□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pla2g16Q8R3U1 162 aa5.7□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1393Q8VFA7 311 aa5.7□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr772Q8VGC5 311 aa5.7□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Defb7Q91V70 71 aa5.7□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem128Q9CZB9 163 aa5.7□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Barx1Q9ER42 254 aa5.7□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 GrinaQ9ESF4 345 aa5.7□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dusp13Q9QYJ7 198 aa5.7□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fbxl17Q9QZN1 701 aa5.7□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 NpffQ9WVA8 114 aa5.7□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cldn14Q9Z0S3 239 aa5.7□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dchs1E9PVD3 3291 aa5.7□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trav12-1A0N8R1 115 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm13769A2ATW2 309 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AsmtD3KU66 387 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Saa1P05366 122 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pdcd6P12815 191 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cxcl1P12850 96 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cdx1P18111 268 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Eif4e1bQ3UTA9 244 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rab35Q6PHN9 201 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp455Q7M6X9 461 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr921Q7TRC0 313 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prrg4Q8BGN6 226 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Plcxd3Q8BLJ3 321 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm10600Q8BQ57 223 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 YbeyQ8CAV0 164 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Plxnb1Q8CJH3 2119 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sco2Q8VCL2 255 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1377Q8VGH1 307 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mrpl21Q9D1N9 209 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Wbp2nlQ9D529 359 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PifoQ9D9W1 207 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MioxQ9QXN5 285 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Igkv14-126A0A075B5K0 117 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1124A2AT86 318 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm4950D3YUM8 205 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam170bE9PXT9 378 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm10097J3KMK7 105 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 A630095N17RikJ3KMM7 116 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr893K7N678 312 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Chek1O35280 476 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ercc1P07903 298 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hist1h2bmP10854 126 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rab19P35294 217 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Klk1b26P36369 261 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 RorcP51450 516 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gsc2P56916 198 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vamp2P63044 116 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trav8d-1Q5R1H8 112 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Oas1bQ60856 376 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ifna15Q61718 190 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 SordQ64442 357 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hist1h2bhQ64478 126 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hist2h2bbQ64525 126 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hist1h2bcQ6ZWY9 126 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1290Q7TQX8 312 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1137Q7TR40 310 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr782Q7TRI2 314 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 BC049730Q810N3 246 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 SargQ8BI29 606 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Angptl6Q8R0Z6 457 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 SpartQ8R1X6 671 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Thyn1Q91YJ3 226 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 FrkQ922K9 512 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ms4a6dQ99N07 247 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Chst1Q9EQC0 411 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dnase2bQ9QY48 354 aa5.69□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pde4dipQ80YT7 2224 aa5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.9 ms