Protein–RNA interactions for Protein: P35294

Rab19, Ras-related protein Rab-19, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab19P35294 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rab19P35294 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rab19P35294 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rab19P35294 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rab19P35294 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rab19P35294 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Rab19P35294 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Rab19P35294 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rab19P35294 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rab19P35294 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab19P35294 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab19P35294 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab19P35294 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab19P35294 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab19P35294 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab19P35294 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab19P35294 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab19P35294 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab19P35294 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab19P35294 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab19P35294 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab19P35294 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab19P35294 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Rab19P35294 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rab19P35294 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rab19P35294 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rab19P35294 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rab19P35294 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rab19P35294 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rab19P35294 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rab19P35294 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rab19P35294 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rab19P35294 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rab19P35294 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab19P35294 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab19P35294 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab19P35294 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rab19P35294 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab19P35294 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab19P35294 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab19P35294 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab19P35294 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab19P35294 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab19P35294 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab19P35294 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab19P35294 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab19P35294 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab19P35294 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab19P35294 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab19P35294 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab19P35294 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab19P35294 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab19P35294 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab19P35294 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab19P35294 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab19P35294 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab19P35294 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab19P35294 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab19P35294 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab19P35294 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab19P35294 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab19P35294 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab19P35294 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab19P35294 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab19P35294 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab19P35294 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab19P35294 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab19P35294 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab19P35294 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab19P35294 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab19P35294 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab19P35294 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab19P35294 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab19P35294 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rab19P35294 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab19P35294 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rab19P35294 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab19P35294 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab19P35294 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab19P35294 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab19P35294 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab19P35294 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab19P35294 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab19P35294 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab19P35294 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab19P35294 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab19P35294 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rab19P35294 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab19P35294 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab19P35294 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab19P35294 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab19P35294 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab19P35294 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab19P35294 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab19P35294 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab19P35294 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab19P35294 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rab19P35294 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab19P35294 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab19P35294 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms