Protein–RNA interactions for Protein: P07903

Ercc1, DNA excision repair protein ERCC-1, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc1P07903 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ercc1P07903 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Ercc1P07903 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ercc1P07903 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ercc1P07903 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Ercc1P07903 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ercc1P07903 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ercc1P07903 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ercc1P07903 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ercc1P07903 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ercc1P07903 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ercc1P07903 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ercc1P07903 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ercc1P07903 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ercc1P07903 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ercc1P07903 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ercc1P07903 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ercc1P07903 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ercc1P07903 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ercc1P07903 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ercc1P07903 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ercc1P07903 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ercc1P07903 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ercc1P07903 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ercc1P07903 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ercc1P07903 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ercc1P07903 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ercc1P07903 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ercc1P07903 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ercc1P07903 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ercc1P07903 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ercc1P07903 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ercc1P07903 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ercc1P07903 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ercc1P07903 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ercc1P07903 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ercc1P07903 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ercc1P07903 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ercc1P07903 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ercc1P07903 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ercc1P07903 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ercc1P07903 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ercc1P07903 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ercc1P07903 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ercc1P07903 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ercc1P07903 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ercc1P07903 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ercc1P07903 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ercc1P07903 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ercc1P07903 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ercc1P07903 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ercc1P07903 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ercc1P07903 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ercc1P07903 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ercc1P07903 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ercc1P07903 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ercc1P07903 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ercc1P07903 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ercc1P07903 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ercc1P07903 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ercc1P07903 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ercc1P07903 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ercc1P07903 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ercc1P07903 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ercc1P07903 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ercc1P07903 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ercc1P07903 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ercc1P07903 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ercc1P07903 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ercc1P07903 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ercc1P07903 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ercc1P07903 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ercc1P07903 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ercc1P07903 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ercc1P07903 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ercc1P07903 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ercc1P07903 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ercc1P07903 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ercc1P07903 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ercc1P07903 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ercc1P07903 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ercc1P07903 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ercc1P07903 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ercc1P07903 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ercc1P07903 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ercc1P07903 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ercc1P07903 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ercc1P07903 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ercc1P07903 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ercc1P07903 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ercc1P07903 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ercc1P07903 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ercc1P07903 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ercc1P07903 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ercc1P07903 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ercc1P07903 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ercc1P07903 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ercc1P07903 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ercc1P07903 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ercc1P07903 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 6.9 ms