Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5K0

Igkv14-126, Immunoglobulin kappa variable 14-126 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv14-126A0A075B5K0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32,33■■■□□ 2,77
Igkv14-126A0A075B5K0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Igkv14-126A0A075B5K0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
Igkv14-126A0A075B5K0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Igkv14-126A0A075B5K0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Igkv14-126A0A075B5K0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,87■■■□□ 2,21
Igkv14-126A0A075B5K0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28,65■■■□□ 2,18
Igkv14-126A0A075B5K0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28,1■■■□□ 2,09
Igkv14-126A0A075B5K0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Igkv14-126A0A075B5K0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27,86■■■□□ 2,05
Igkv14-126A0A075B5K0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27,74■■■□□ 2,03
Igkv14-126A0A075B5K0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Igkv14-126A0A075B5K0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27,4■■□□□ 1,98
Igkv14-126A0A075B5K0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Igkv14-126A0A075B5K0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Igkv14-126A0A075B5K0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Igkv14-126A0A075B5K0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27,04■■□□□ 1,92
Igkv14-126A0A075B5K0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Igkv14-126A0A075B5K0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Igkv14-126A0A075B5K0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Igkv14-126A0A075B5K0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Igkv14-126A0A075B5K0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Igkv14-126A0A075B5K0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Igkv14-126A0A075B5K0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,88
Igkv14-126A0A075B5K0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Igkv14-126A0A075B5K0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26,72■■□□□ 1,87
Igkv14-126A0A075B5K0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Igkv14-126A0A075B5K0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Igkv14-126A0A075B5K0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Igkv14-126A0A075B5K0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Igkv14-126A0A075B5K0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26,38■■□□□ 1,81
Igkv14-126A0A075B5K0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26,34■■□□□ 1,81
Igkv14-126A0A075B5K0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Igkv14-126A0A075B5K0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Igkv14-126A0A075B5K0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26,26■■□□□ 1,79
Igkv14-126A0A075B5K0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Igkv14-126A0A075B5K0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Igkv14-126A0A075B5K0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Igkv14-126A0A075B5K0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Igkv14-126A0A075B5K0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25,9■■□□□ 1,74
Igkv14-126A0A075B5K0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Igkv14-126A0A075B5K0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25,74■■□□□ 1,71
Igkv14-126A0A075B5K0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Igkv14-126A0A075B5K0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Igkv14-126A0A075B5K0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Igkv14-126A0A075B5K0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Igkv14-126A0A075B5K0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Igkv14-126A0A075B5K0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25,55■■□□□ 1,68
Igkv14-126A0A075B5K0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Igkv14-126A0A075B5K0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Igkv14-126A0A075B5K0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Igkv14-126A0A075B5K0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Igkv14-126A0A075B5K0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,44■■□□□ 1,66
Igkv14-126A0A075B5K0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25,39■■□□□ 1,66
Igkv14-126A0A075B5K0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Igkv14-126A0A075B5K0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25,3■■□□□ 1,64
Igkv14-126A0A075B5K0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Igkv14-126A0A075B5K0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Igkv14-126A0A075B5K0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Igkv14-126A0A075B5K0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25,19■■□□□ 1,62
Igkv14-126A0A075B5K0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25,18■■□□□ 1,62
Igkv14-126A0A075B5K0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Igkv14-126A0A075B5K0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Igkv14-126A0A075B5K0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Igkv14-126A0A075B5K0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Igkv14-126A0A075B5K0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25,08■■□□□ 1,61
Igkv14-126A0A075B5K0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25,08■■□□□ 1,61
Igkv14-126A0A075B5K0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25,07■■□□□ 1,6
Igkv14-126A0A075B5K0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Igkv14-126A0A075B5K0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25,04■■□□□ 1,6
Igkv14-126A0A075B5K0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25■■□□□ 1,59
Igkv14-126A0A075B5K0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Igkv14-126A0A075B5K0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24,93■■□□□ 1,58
Igkv14-126A0A075B5K0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Igkv14-126A0A075B5K0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Igkv14-126A0A075B5K0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Igkv14-126A0A075B5K0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Igkv14-126A0A075B5K0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24,68■■□□□ 1,54
Igkv14-126A0A075B5K0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24,67■■□□□ 1,54
Igkv14-126A0A075B5K0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24,66■■□□□ 1,54
Igkv14-126A0A075B5K0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24,61■■□□□ 1,53
Igkv14-126A0A075B5K0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Igkv14-126A0A075B5K0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Igkv14-126A0A075B5K0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Igkv14-126A0A075B5K0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Igkv14-126A0A075B5K0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Igkv14-126A0A075B5K0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Igkv14-126A0A075B5K0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Igkv14-126A0A075B5K0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Igkv14-126A0A075B5K0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,49■■□□□ 1,51
Igkv14-126A0A075B5K0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,46■■□□□ 1,51
Igkv14-126A0A075B5K0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24,46■■□□□ 1,51
Igkv14-126A0A075B5K0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Igkv14-126A0A075B5K0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Igkv14-126A0A075B5K0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,39■■□□□ 1,49
Igkv14-126A0A075B5K0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Igkv14-126A0A075B5K0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Igkv14-126A0A075B5K0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24,36■■□□□ 1,49
Igkv14-126A0A075B5K0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Igkv14-126A0A075B5K0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58,3 ms