Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN9

Rab35, Ras-related protein Rab-35, mousemouse

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab35Q6PHN9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Rab35Q6PHN9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rab35Q6PHN9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rab35Q6PHN9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rab35Q6PHN9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rab35Q6PHN9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rab35Q6PHN9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Rab35Q6PHN9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Rab35Q6PHN9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rab35Q6PHN9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Rab35Q6PHN9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Rab35Q6PHN9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rab35Q6PHN9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rab35Q6PHN9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rab35Q6PHN9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rab35Q6PHN9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Rab35Q6PHN9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rab35Q6PHN9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Rab35Q6PHN9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rab35Q6PHN9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rab35Q6PHN9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rab35Q6PHN9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rab35Q6PHN9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rab35Q6PHN9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rab35Q6PHN9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rab35Q6PHN9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rab35Q6PHN9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Rab35Q6PHN9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rab35Q6PHN9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rab35Q6PHN9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rab35Q6PHN9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rab35Q6PHN9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Rab35Q6PHN9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rab35Q6PHN9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rab35Q6PHN9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rab35Q6PHN9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rab35Q6PHN9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rab35Q6PHN9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rab35Q6PHN9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rab35Q6PHN9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rab35Q6PHN9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rab35Q6PHN9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rab35Q6PHN9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rab35Q6PHN9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rab35Q6PHN9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rab35Q6PHN9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rab35Q6PHN9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rab35Q6PHN9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rab35Q6PHN9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rab35Q6PHN9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Rab35Q6PHN9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Rab35Q6PHN9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rab35Q6PHN9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rab35Q6PHN9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rab35Q6PHN9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rab35Q6PHN9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rab35Q6PHN9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rab35Q6PHN9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab35Q6PHN9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab35Q6PHN9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab35Q6PHN9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab35Q6PHN9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab35Q6PHN9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab35Q6PHN9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab35Q6PHN9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rab35Q6PHN9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab35Q6PHN9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab35Q6PHN9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab35Q6PHN9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rab35Q6PHN9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rab35Q6PHN9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rab35Q6PHN9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Rab35Q6PHN9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rab35Q6PHN9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rab35Q6PHN9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab35Q6PHN9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab35Q6PHN9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Rab35Q6PHN9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rab35Q6PHN9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rab35Q6PHN9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Rab35Q6PHN9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rab35Q6PHN9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab35Q6PHN9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab35Q6PHN9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab35Q6PHN9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab35Q6PHN9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab35Q6PHN9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab35Q6PHN9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab35Q6PHN9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab35Q6PHN9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab35Q6PHN9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab35Q6PHN9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab35Q6PHN9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab35Q6PHN9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab35Q6PHN9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab35Q6PHN9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rab35Q6PHN9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rab35Q6PHN9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab35Q6PHN9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab35Q6PHN9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
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