Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Gsc2P56916 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28,39■■■□□ 2,14
Gsc2P56916 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,7■■■□□ 2,03
Gsc2P56916 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,03
Gsc2P56916 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26,83■■□□□ 1,89
Gsc2P56916 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Gsc2P56916 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Gsc2P56916 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Gsc2P56916 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Gsc2P56916 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Gsc2P56916 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Gsc2P56916 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Gsc2P56916 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Gsc2P56916 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Gsc2P56916 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25,62■■□□□ 1,69
Gsc2P56916 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Gsc2P56916 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25,51■■□□□ 1,68
Gsc2P56916 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Gsc2P56916 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Gsc2P56916 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Gsc2P56916 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25,14■■□□□ 1,62
Gsc2P56916 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Gsc2P56916 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Gsc2P56916 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Gsc2P56916 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Gsc2P56916 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Gsc2P56916 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24,75■■□□□ 1,55
Gsc2P56916 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Gsc2P56916 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Gsc2P56916 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24,69■■□□□ 1,54
Gsc2P56916 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Gsc2P56916 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Gsc2P56916 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,64■■□□□ 1,54
Gsc2P56916 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Gsc2P56916 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,54■■□□□ 1,52
Gsc2P56916 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Gsc2P56916 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24,4■■□□□ 1,5
Gsc2P56916 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
Gsc2P56916 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24,38■■□□□ 1,49
Gsc2P56916 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Gsc2P56916 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Gsc2P56916 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Gsc2P56916 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,24■■□□□ 1,47
Gsc2P56916 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24,18■■□□□ 1,46
Gsc2P56916 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Gsc2P56916 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24,13■■□□□ 1,45
Gsc2P56916 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Gsc2P56916 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,94■■□□□ 1,42
Gsc2P56916 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
Gsc2P56916 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Gsc2P56916 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
Gsc2P56916 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,88■■□□□ 1,41
Gsc2P56916 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23,88■■□□□ 1,41
Gsc2P56916 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Gsc2P56916 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
Gsc2P56916 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,79■■□□□ 1,4
Gsc2P56916 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Gsc2P56916 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
Gsc2P56916 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Gsc2P56916 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Gsc2P56916 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Gsc2P56916 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Gsc2P56916 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Gsc2P56916 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,66■■□□□ 1,38
Gsc2P56916 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Gsc2P56916 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Gsc2P56916 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23,59■■□□□ 1,37
Gsc2P56916 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23,52■■□□□ 1,36
Gsc2P56916 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Gsc2P56916 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Gsc2P56916 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,48■■□□□ 1,35
Gsc2P56916 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,35
Gsc2P56916 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Gsc2P56916 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Gsc2P56916 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
Gsc2P56916 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Gsc2P56916 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Gsc2P56916 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23,29■■□□□ 1,32
Gsc2P56916 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Gsc2P56916 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Gsc2P56916 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Gsc2P56916 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Gsc2P56916 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Gsc2P56916 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,15■■□□□ 1,3
Gsc2P56916 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Gsc2P56916 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,12■■□□□ 1,29
Gsc2P56916 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,1■■□□□ 1,29
Gsc2P56916 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Gsc2P56916 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Gsc2P56916 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Gsc2P56916 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Gsc2P56916 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Gsc2P56916 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,25
Gsc2P56916 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22,88■■□□□ 1,25
Gsc2P56916 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22,87■■□□□ 1,25
Gsc2P56916 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Gsc2P56916 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Gsc2P56916 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
Gsc2P56916 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Gsc2P56916 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22,75■■□□□ 1,23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7,5 ms