Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gsc2P56916 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Gsc2P56916 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Gsc2P56916 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Gsc2P56916 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Gsc2P56916 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gsc2P56916 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gsc2P56916 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gsc2P56916 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gsc2P56916 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gsc2P56916 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gsc2P56916 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gsc2P56916 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gsc2P56916 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gsc2P56916 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Gsc2P56916 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gsc2P56916 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
Gsc2P56916 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gsc2P56916 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gsc2P56916 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gsc2P56916 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Gsc2P56916 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gsc2P56916 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gsc2P56916 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gsc2P56916 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gsc2P56916 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gsc2P56916 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gsc2P56916 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gsc2P56916 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gsc2P56916 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Gsc2P56916 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gsc2P56916 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gsc2P56916 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gsc2P56916 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gsc2P56916 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gsc2P56916 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gsc2P56916 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gsc2P56916 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gsc2P56916 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gsc2P56916 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gsc2P56916 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gsc2P56916 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gsc2P56916 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gsc2P56916 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gsc2P56916 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gsc2P56916 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gsc2P56916 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gsc2P56916 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Gsc2P56916 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gsc2P56916 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gsc2P56916 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gsc2P56916 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gsc2P56916 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Gsc2P56916 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gsc2P56916 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gsc2P56916 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gsc2P56916 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gsc2P56916 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gsc2P56916 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gsc2P56916 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gsc2P56916 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gsc2P56916 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gsc2P56916 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gsc2P56916 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Gsc2P56916 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gsc2P56916 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gsc2P56916 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gsc2P56916 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gsc2P56916 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gsc2P56916 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gsc2P56916 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gsc2P56916 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gsc2P56916 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gsc2P56916 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gsc2P56916 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gsc2P56916 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gsc2P56916 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gsc2P56916 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gsc2P56916 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gsc2P56916 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gsc2P56916 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gsc2P56916 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gsc2P56916 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gsc2P56916 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gsc2P56916 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gsc2P56916 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gsc2P56916 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gsc2P56916 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gsc2P56916 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gsc2P56916 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gsc2P56916 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gsc2P56916 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gsc2P56916 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gsc2P56916 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gsc2P56916 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gsc2P56916 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gsc2P56916 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gsc2P56916 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gsc2P56916 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gsc2P56916 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms