Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD3

Dchs1, Protocadherin-16, mousemouse

Predictions only

Length 3,291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dchs1E9PVD3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35,61■■■■□ 3,29
Dchs1E9PVD3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
Dchs1E9PVD3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,57■■■□□ 2,8
Dchs1E9PVD3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31,29■■■□□ 2,6
Dchs1E9PVD3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,35■■■□□ 2,45
Dchs1E9PVD3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
Dchs1E9PVD3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Dchs1E9PVD3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Dchs1E9PVD3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,82■■■□□ 2,36
Dchs1E9PVD3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Dchs1E9PVD3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29,51■■■□□ 2,32
Dchs1E9PVD3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29,33■■■□□ 2,29
Dchs1E9PVD3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29,22■■■□□ 2,27
Dchs1E9PVD3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Dchs1E9PVD3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Dchs1E9PVD3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Dchs1E9PVD3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,94■■■□□ 2,22
Dchs1E9PVD3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Dchs1E9PVD3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Dchs1E9PVD3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28,49■■■□□ 2,15
Dchs1E9PVD3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28,43■■■□□ 2,14
Dchs1E9PVD3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Dchs1E9PVD3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Dchs1E9PVD3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Dchs1E9PVD3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,83■■■□□ 2,05
Dchs1E9PVD3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,77■■■□□ 2,04
Dchs1E9PVD3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Dchs1E9PVD3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,67■■■□□ 2,02
Dchs1E9PVD3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27,65■■■□□ 2,02
Dchs1E9PVD3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Dchs1E9PVD3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27,59■■■□□ 2,01
Dchs1E9PVD3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Dchs1E9PVD3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Dchs1E9PVD3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27,33■■□□□ 1,97
Dchs1E9PVD3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Dchs1E9PVD3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,23■■□□□ 1,95
Dchs1E9PVD3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Dchs1E9PVD3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27,16■■□□□ 1,94
Dchs1E9PVD3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Dchs1E9PVD3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27,09■■□□□ 1,93
Dchs1E9PVD3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,07■■□□□ 1,92
Dchs1E9PVD3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Dchs1E9PVD3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27,04■■□□□ 1,92
Dchs1E9PVD3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1,91
Dchs1E9PVD3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26,98■■□□□ 1,91
Dchs1E9PVD3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26,86■■□□□ 1,89
Dchs1E9PVD3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Dchs1E9PVD3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26,81■■□□□ 1,88
Dchs1E9PVD3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Dchs1E9PVD3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26,79■■□□□ 1,88
Dchs1E9PVD3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Dchs1E9PVD3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Dchs1E9PVD3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26,7■■□□□ 1,86
Dchs1E9PVD3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Dchs1E9PVD3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26,63■■□□□ 1,85
Dchs1E9PVD3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Dchs1E9PVD3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26,53■■□□□ 1,84
Dchs1E9PVD3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26,53■■□□□ 1,84
Dchs1E9PVD3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Dchs1E9PVD3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Dchs1E9PVD3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,8
Dchs1E9PVD3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26,31■■□□□ 1,8
Dchs1E9PVD3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26,26■■□□□ 1,79
Dchs1E9PVD3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26,24■■□□□ 1,79
Dchs1E9PVD3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26,24■■□□□ 1,79
Dchs1E9PVD3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Dchs1E9PVD3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Dchs1E9PVD3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Dchs1E9PVD3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26,03■■□□□ 1,76
Dchs1E9PVD3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Dchs1E9PVD3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Dchs1E9PVD3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25,97■■□□□ 1,75
Dchs1E9PVD3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Dchs1E9PVD3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Dchs1E9PVD3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25,94■■□□□ 1,74
Dchs1E9PVD3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Dchs1E9PVD3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25,92■■□□□ 1,74
Dchs1E9PVD3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Dchs1E9PVD3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Dchs1E9PVD3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Dchs1E9PVD3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Dchs1E9PVD3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25,71■■□□□ 1,71
Dchs1E9PVD3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25,69■■□□□ 1,7
Dchs1E9PVD3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Dchs1E9PVD3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
Dchs1E9PVD3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Dchs1E9PVD3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Dchs1E9PVD3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Dchs1E9PVD3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25,57■■□□□ 1,68
Dchs1E9PVD3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Dchs1E9PVD3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Dchs1E9PVD3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25,54■■□□□ 1,68
Dchs1E9PVD3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Dchs1E9PVD3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Dchs1E9PVD3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25,5■■□□□ 1,67
Dchs1E9PVD3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Dchs1E9PVD3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Dchs1E9PVD3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Dchs1E9PVD3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Dchs1E9PVD3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms