RNA–Protein interactions for RNA: YMR219W

ESC1, Transcript of Protein localized to the nuclear periphery, yeast

Gene ESC1, Length 4,977 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ESC1	YMR219W	FMP25	Q08023	583 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	ALR1	Q08269	859 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	SRF1	Q12516	437 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	AI3	P03877	415 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.69	□□□□□ -1.98	not detected
ESC1	YMR219W	SIR3	P06701	978 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	GYP6	P32806	458 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	TRM2	P33753	639 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	STB6	P36085	766 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	YHL012W	P38709	493 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	ERP2	P39704	215 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	ZRG8	P40021	1076 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	PAC11	P40960	533 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	MDE1	P47095	244 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	ATG1	P53104	897 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	MRM2	P53123	320 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	PHM6	Q05637	104 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	YEH2	Q07950	538 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	FUS1	P11710	512 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	POL3	P15436	1097 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	YME1	P32795	747 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	LSB6	P42951	607 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	NET1	P47035	1189 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	NNF1	P47149	201 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	RIM21	P48565	533 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	MAL11	P53048	616 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	YGR125W	P53273	1036 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	ARP9	Q05123	467 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	YPQ2	Q06328	317 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	NSE1	Q07913	336 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	AAD15	Q08361	143 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	TSR3	Q12094	313 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	AIM7	Q12156	149 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	PMA2	P19657	947 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	FUB1	P25659	250 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	SWC5	P38326	303 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	SFB3	P38810	929 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	YPT11	P48559	417 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	COS6	P53344	381 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	DON1	Q05610	365 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	COA4	Q05809	96 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	EAF1	Q06337	982 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	TFC6	Q06339	672 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	CRN1	Q06440	651 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	ARV1	Q06541	321 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	EMP46	Q12396	444 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	COQ4	O13525	335 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	CIT2	P08679	460 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	KIN1	P13185	1064 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	KSS1	P14681	368 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	IDI1	P15496	288 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	ALG1	P16661	449 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	DAP2	P18962	818 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	DBF2	P22204	572 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	GSY2	P27472	705 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	RRF1	P38771	230 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	FAR7	P43592	221 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	RFX1	P48743	811 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	VPS16	Q03308	798 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	SND1	Q04007	877 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	CSC1	Q06538	782 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	SIL1	Q08199	421 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	GRE2	Q12068	342 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	HNM1	P19807	563 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	CLN2	P20438	545 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	SPS22	P25380	463 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	MNN2	P38069	597 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	HSE1	P38753	452 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	GIC1	P38785	314 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	DYS1	P38791	387 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	SSO2	P39926	295 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	MNT3	P40549	630 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	DOT5	P40553	215 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	SWP82	P43554	623 aa		2.68	□□□□□ -1.98

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