RNA–Protein interactions for RNA: YMR178W

YMR178W, Transcript of Protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR178W, Length 825 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR178WYMR178W MRH1Q12117 320 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W YEL076C-AP0CX16 216 aa5.38□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W YLR464WP0CX17 216 aa5.38□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W TUP1P16649 713 aa5.38□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W GLG1P36143 616 aa5.38□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W CRG1P38892 291 aaRIP-Chip data5.38□□□□□ -1.55not detected
YMR178WYMR178W YJL206CP39529 758 aa5.38□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W YEL076CP39971 216 aa5.38□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W FTR1P40088 404 aa5.38□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W NMA2P53204 395 aa5.38□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W HOL1P53389 586 aa5.38□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W SQS1P53866 767 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W TIM50Q02776 476 aa5.38□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W MSS1P32559 526 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W CDS1P38221 457 aa5.37□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W KSP1P38691 1029 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W EAF5P39995 279 aa5.37□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W PEX8P53248 589 aa5.37□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W YSH1Q06224 779 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W AIM41Q12032 185 aa5.37□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W TMA7Q3E764 64 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W HMG2P12684 1045 aa5.36□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W ELF1P36053 145 aa5.36□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W IRC5P43610 853 aa5.36□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W DIP5P53388 608 aa5.36□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W YNL034WP53963 612 aa5.36□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W YNL018CP53976 612 aa5.36□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W FDC1Q03034 503 aa5.36□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W IOC4Q04213 475 aa5.36□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W YCG1Q06680 1035 aa5.36□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W IRC10Q08118 586 aa5.36□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W YOR378WQ08902 515 aa5.36□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W MPD2Q99316 277 aa5.36□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W MTC7P32633 139 aa5.35□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W RMA1P36001 430 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W APL3P38065 1025 aa5.35□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W UBS1P38290 277 aa5.35□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W CCT7P42943 550 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W STU2P46675 888 aa5.35□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W MTD1Q02046 320 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W IZH3Q07959 543 aa5.35□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W DMC1P25453 334 aa5.34□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W GMH1P36125 273 aa5.34□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W EHT1P38295 451 aa5.34□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W PPE1P38796 400 aa5.34□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W BDH2P39713 417 aa5.34□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W MDR1P53258 950 aa5.34□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W SPC98P53540 846 aa5.34□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W HLR1Q04429 423 aa5.34□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W SLX4Q12098 748 aa5.34□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W RKI1Q12189 258 aa5.34□□□□□ -1.55
YMR178WYMR178W LAM4P38800 1345 aa5.33□□□□□ -1.56
YMR178WYMR178W STL1P39932 569 aa5.33□□□□□ -1.56
YMR178WYMR178W YIL092WP40497 633 aa5.33□□□□□ -1.56
YMR178WYMR178W PEF1P53238 335 aa5.33□□□□□ -1.56
YMR178WYMR178W TGL2P54857 326 aa5.33□□□□□ -1.56
YMR178WYMR178W VPS5Q92331 675 aa5.33□□□□□ -1.56
YMR178WYMR178W KCC4P25389 1037 aa5.32□□□□□ -1.56
YMR178WYMR178W TDP1P38319 544 aa5.32□□□□□ -1.56
YMR178WYMR178W YEL025CP39991 1188 aa5.32□□□□□ -1.56
YMR178WYMR178W YGR054WP53235 642 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
YMR178WYMR178W NUR1Q12066 484 aa5.32□□□□□ -1.56
YMR178WYMR178W TAF3Q12297 353 aa5.32□□□□□ -1.56
YMR178WYMR178W GFA1P14742 717 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
YMR178WYMR178W NIC96P34077 839 aa5.31□□□□□ -1.56
YMR178WYMR178W YDL183CP48569 320 aa5.31□□□□□ -1.56
YMR178WYMR178W VPS73P53142 486 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
YMR178WYMR178W UFO1Q04511 668 aa5.31□□□□□ -1.56
YMR178WYMR178W BMS1Q08965 1183 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
YMR178WYMR178W PHO3P24031 467 aa5.3□□□□□ -1.56
YMR178WYMR178W CWH43P25618 953 aa5.3□□□□□ -1.56
YMR178WYMR178W TAH11P47112 604 aa5.3□□□□□ -1.56
YMR178WYMR178W MNT2P53059 558 aa5.3□□□□□ -1.56
YMR178WYMR178W SNF12P53628 566 aa5.3□□□□□ -1.56
YMR178WYMR178W MFM1Q02783 413 aa5.3□□□□□ -1.56
YMR178WYMR178W TRS23Q03784 219 aa5.3□□□□□ -1.56
YMR178WYMR178W RTK1Q12100 620 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
YMR178WYMR178W HOS1Q12214 470 aa5.3□□□□□ -1.56
YMR178WYMR178W PCK1P10963 549 aa5.29□□□□□ -1.56
YMR178WYMR178W SAW1P39735 261 aa5.29□□□□□ -1.56
YMR178WYMR178W THI6P41835 540 aa5.29□□□□□ -1.56
YMR178WYMR178W PMT6P42934 759 aa5.29□□□□□ -1.56
YMR178WYMR178W EFR3Q03653 782 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
YMR178WYMR178W CEF1Q03654 590 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
YMR178WYMR178W PSF3Q12146 194 aa5.29□□□□□ -1.56
YMR178WYMR178W MSL5Q12186 476 aaKnown RBP RIP-Chip data5.29□□□□□ -1.56not detected
YMR178WYMR178W TUF1P02992 437 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
YMR178WYMR178W SEC12P11655 471 aa5.28□□□□□ -1.56
YMR178WYMR178W DHR2P36009 735 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
YMR178WYMR178W MRPL7P36519 292 aa5.28□□□□□ -1.56
YMR178WYMR178W QRI1P43123 477 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
YMR178WYMR178W YJR008WP47085 338 aa5.28□□□□□ -1.56
YMR178WYMR178W DAK1P54838 584 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
YMR178WYMR178W NGL2Q03264 515 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
YMR178WYMR178W YOL057WQ08225 711 aa5.28□□□□□ -1.56
YMR178WYMR178W MDM20Q12387 796 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
YMR178WYMR178W URA3P03962 267 aa5.27□□□□□ -1.57
YMR178WYMR178W SST2P11972 698 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
YMR178WYMR178W YJL193WP39542 402 aa5.27□□□□□ -1.57
YMR178WYMR178W SSP120P39931 234 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 52.7 ms