RNA–Protein interactions for RNA: YLR224W

YLR224W, Transcript of F-box protein and component of SCF ubiquitin ligase complexes, yeast

Gene YLR224W, Length 1,110 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR224W	YLR224W	MRC1	P25588	1096 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	CTP1	P38152	299 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	YBR071W	P38243	211 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	COS111	P38308	924 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	NIT2	P47016	307 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	MPS3	P47069	682 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	NMA2	P53204	395 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	3.61	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	3.61	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.61	□□□□□ -1.83	not detected
YLR224W	YLR224W	PRE4	P30657	266 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	3.6	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	MIT1	P40002	666 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	YGR151C	P53287	111 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	TIM50	Q02776	476 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	TUP1	P16649	713 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	SPO11	P23179	398 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	FUB1	P25659	250 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	KHA1	P40309	873 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	YJR120W	P47157	116 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	COG6	P53959	839 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	FDC1	Q03034	503 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	HLR1	Q04429	423 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	YDL086W	Q07505	273 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	AFT2	Q08957	416 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
YLR224W	YLR224W	DGR2	P32330	852 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	HXT4	P32467	576 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	ELF1	P36053	145 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	YHR033W	P38690	423 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	EMP65	P40085	556 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	PRM2	P40534	656 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	PEX14	P53112	341 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	SPC105	P53148	917 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	OSW1	Q08692	278 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	LAM4	P38800	1345 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	KAR1	P11927	433 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	KCC4	P25389	1037 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	MTC7	P32633	139 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	GMH1	P36125	273 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	APL3	P38065	1025 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	YMC2	P38087	329 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	3.57	□□□□□ -1.84	not detected
YLR224W	YLR224W	PEA2	P40091	420 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	MON2	P48563	1636 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	INO80	P53115	1489 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	SLD3	P53135	668 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	SNF12	P53628	566 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	IZH3	Q07959	543 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	PEX15	Q08215	383 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	RKI1	Q12189	258 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	HMG2	P12684	1045 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	STE12	P13574	688 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	ATP12	P22135	325 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	PAC2	P39937	518 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	TMN3	P40071	706 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	FTR1	P40088	404 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	DIP5	P53388	608 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	UFO1	Q04511	668 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	YCG1	Q06680	1035 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	AIM41	Q12032	185 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	PHO5	P00635	467 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	PLC1	P32383	869 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	TFC4	P33339	1025 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	CDS1	P38221	457 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	EHT1	P38295	451 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	MUP3	P38734	546 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	PMT6	P42934	759 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	IRC5	P43610	853 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	HOL1	P53389	586 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	SPC98	P53540	846 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	FOL1	P53848	824 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	PHM6	Q05637	104 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	VPS5	Q92331	675 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	RPN13	O13563	156 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	YLR464W	P0CX17	216 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	YMC1	P32331	307 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	YEL076C	P39971	216 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	YEL025C	P39991	1188 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	PEF1	P53238	335 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	SEC5	P89102	971 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		3.54	□□□□□ -1.84

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 47.8 ms