RNA–Protein interactions for RNA: YKL111C

YKL111C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKL111C, Length 336 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL111CYKL111C FDC1Q03034 503 aa3.03□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C PPN1Q04119 674 aa3.03□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C HLR1Q04429 423 aa3.03□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C RKI1Q12189 258 aa3.03□□□□□ -1.92
YKL111CYKL111C SSB1P11484 613 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C STE4P18851 423 aa3.02□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C MRC1P25588 1096 aa3.02□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C PLC1P32383 869 aa3.02□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C GMH1P36125 273 aa3.02□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C SSB2P40150 613 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C YSH1Q06224 779 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C ARR3Q06598 404 aa3.02□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C TRE2Q08693 809 aa3.02□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C BMS1Q08965 1183 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C YPR027CQ12079 277 aa3.02□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C LAM4P38800 1345 aa3.01□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C HMG2P12684 1045 aa3.01□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C CDC43P18898 376 aa3.01□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C COX11P19516 300 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C DMC1P25453 334 aa3.01□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C DGR2P32330 852 aa3.01□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C ELF1P36053 145 aa3.01□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C FLO10P36170 1169 aa3.01□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C MRPL7P36519 292 aa3.01□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C EHT1P38295 451 aa3.01□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C SRP68P38687 599 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C ENP2P48234 707 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C RNR4P49723 345 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C YGR054WP53235 642 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C PEF1P53238 335 aa3.01□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C FOL1P53848 824 aa3.01□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C ECM38Q05902 660 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C YOR378WQ08902 515 aa3.01□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C PHO5P00635 467 aa3□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C YEL076C-AP0CX16 216 aa3□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C YLR464WP0CX17 216 aa3□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C ABF1P14164 731 aa3□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C GFA1P14742 717 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C SEC15P22224 910 aa3□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C NTH1P32356 751 aa3□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C TFC4P33339 1025 aa3□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C YHR033WP38690 423 aa3□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C YEL076CP39971 216 aa3□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C YEL020CP39994 560 aa3□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C EAF5P39995 279 aa3□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C LRO1P40345 661 aa3□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C DIP5P53388 608 aa3□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C TGL2P54857 326 aa3□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C EFR3Q03653 782 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C UFO1Q04511 668 aa3□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C YCG1Q06680 1035 aa3□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C DIN7Q12086 430 aa3□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C RTK1Q12100 620 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C BNR1P40450 1375 aa3□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C LEU2P04173 364 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C ADY2P25613 283 aa2.99□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C APL3P38065 1025 aa2.99□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C MUP3P38734 546 aa2.99□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C YIL166CP40445 542 aa2.99□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C MAD2P40958 196 aa2.99□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C SPC105P53148 917 aa2.99□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C RPS15Q01855 142 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C MTD1Q02046 320 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C ARO10Q06408 635 aa2.99□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C CWC2Q12046 339 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C HOP1P20050 605 aa2.98□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C HCA4P20448 770 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C KCC4P25389 1037 aa2.98□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C PAC2P39937 518 aa2.98□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C PUS4P48567 403 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C MNT2P53059 558 aa2.98□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C PEX14P53112 341 aa2.98□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C SLD3P53135 668 aa2.98□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C YDR179W-AQ03983 463 aa2.98□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C PEX15Q08215 383 aa2.98□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C SLX4Q12098 748 aa2.98□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C CWH43P25618 953 aa2.97□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C CNE1P27825 502 aa2.97□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C YPT10P38146 199 aa2.97□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C PPE1P38796 400 aa2.97□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C RIX1P38883 763 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C EMP65P40085 556 aa2.97□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C PEA2P40091 420 aa2.97□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C PMT6P42934 759 aa2.97□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C ASN1P49089 572 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C YGL117WP53133 265 aa2.97□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C SPC98P53540 846 aa2.97□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C YNL034WP53963 612 aa2.97□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C YNL018CP53976 612 aa2.97□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C USA1Q03714 838 aa2.97□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C GIS1Q03833 894 aa2.97□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C ARG7Q04728 441 aa2.97□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C AIM41Q12032 185 aa2.97□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C VPS5Q92331 675 aa2.97□□□□□ -1.93
YKL111CYKL111C URA3P03962 267 aa2.96□□□□□ -1.94
YKL111CYKL111C TPK2P06245 380 aa2.96□□□□□ -1.94
YKL111CYKL111C TUB1P09733 447 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
YKL111CYKL111C VPS33P20795 691 aa2.96□□□□□ -1.94
YKL111CYKL111C ARG1P22768 420 aa2.96□□□□□ -1.94
YKL111CYKL111C YMC1P32331 307 aa2.96□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.7 ms