RNA–Protein interactions for RNA: YHR087W

RTC3, Transcript of Protein of unknown function involved in RNA metabolism, yeast

Gene RTC3, Length 336 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RTC3	YHR087W	POL3	P15436	1097 aa		15.78	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	CBF1	P17106	351 aa		15.78	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	FUB1	P25659	250 aa		15.78	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	SLD2	P34252	453 aa		15.78	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	YHL026C	P38740	315 aa		15.78	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	FMP10	P40098	244 aa		15.78	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	15.78	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	YGL140C	P53120	1219 aa		15.78	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	15.78	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	VPS54	Q12071	889 aa		15.78	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	15.77	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	SLY1	P22213	666 aa		15.77	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	15.77	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	15.77	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	LYS9	P38999	446 aa		15.77	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	YIL054W	P40524	105 aa		15.77	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	GCV2	P49095	1034 aa		15.77	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	ALT2	P52892	507 aa		15.77	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	15.77	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	SKY1	Q03656	742 aa		15.77	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	YMR027W	Q04371	470 aa		15.77	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	PIG1	Q06216	648 aa		15.77	■□□□□ 0.12
RTC3	YHR087W	GPI10	P30777	616 aa		15.76	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	FRE1	P32791	686 aa		15.76	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	SRB2	P34162	210 aa		15.76	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	15.76	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	RDH54	P38086	958 aa		15.76	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	RAD26	P40352	1085 aa		15.76	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	ATG36	P46983	293 aa		15.76	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	YNL034W	P53963	612 aa		15.76	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	YNL018C	P53976	612 aa		15.76	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	CDC73	Q06697	393 aa		15.76	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	FMP25	Q08023	583 aa		15.76	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	APC5	Q08683	685 aa		15.76	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	YRR1	Q12172	810 aa		15.76	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	NCA2	Q12374	616 aa		15.76	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	MRPL25	P23369	157 aa		15.75	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	VPS3	P23643	1011 aa		15.75	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	URK1	P27515	501 aa		15.75	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	MEI4	P29467	408 aa		15.75	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	BIO2	P32451	375 aa		15.75	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	SQT1	P35184	431 aa		15.75	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	DRE2	P36152	348 aa		15.75	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	DUG2	P38149	878 aa		15.75	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	MET13	P53128	600 aa		15.75	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	COG6	P53959	839 aa		15.75	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	MDM38	Q08179	573 aa		15.75	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	YOR022C	Q12204	715 aa		15.75	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	RRD2	Q12461	358 aa		15.75	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	AVL9	Q12500	764 aa		15.75	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	GAC1	P28006	793 aa		15.74	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	15.74	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	15.74	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	15.74	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	ASG7	P46993	209 aa		15.74	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	HEH2	Q03281	663 aa		15.74	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	LAA1	P39526	2014 aa		15.73	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	CLB1	P24868	471 aa		15.73	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	15.73	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	15.73	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	MSR1	P38714	643 aa		15.73	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	FLC2	P39719	783 aa		15.73	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	SAE2	P46946	345 aa		15.73	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	POL31	P46957	487 aa		15.73	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	MUB1	Q03162	620 aa		15.73	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	TAF9	Q05027	157 aa		15.73	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	TPK1	P06244	397 aa		15.72	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	15.72	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	15.72	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	MGT1	P26188	188 aa		15.72	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	SET3	P36124	751 aa		15.72	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	STB4	P50104	949 aa		15.72	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	STP1	Q00947	519 aa		15.72	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	YML119W	Q03208	357 aa		15.72	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	TAF10	Q12030	206 aa		15.72	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	RIF1	P29539	1916 aa		15.72	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	KIP2	P28743	706 aa		15.71	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	SYN8	P31377	255 aa		15.71	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	DSN1	P40568	576 aa		15.71	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	SLG1	P54867	378 aa		15.71	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	FAR8	Q05040	523 aa		15.71	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	YDL073W	Q07454	984 aa		15.71	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	SDH5	Q08230	162 aa		15.71	■□□□□ 0.11
RTC3	YHR087W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	15.7	■□□□□ 0.1
RTC3	YHR087W	KAR4	P25583	335 aa		15.7	■□□□□ 0.1
RTC3	YHR087W	YSW1	P38280	609 aa		15.7	■□□□□ 0.1
RTC3	YHR087W	SAW1	P39735	261 aa		15.7	■□□□□ 0.1
RTC3	YHR087W	RSM26	P47141	266 aa		15.7	■□□□□ 0.1
RTC3	YHR087W	ZIP2	P53061	704 aa		15.7	■□□□□ 0.1
RTC3	YHR087W	MPC54	Q08550	464 aa		15.7	■□□□□ 0.1
RTC3	YHR087W	THI21	Q08975	551 aa		15.7	■□□□□ 0.1
RTC3	YHR087W	GAL80	P04387	435 aa		15.69	■□□□□ 0.1
RTC3	YHR087W	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	15.69	■□□□□ 0.1
RTC3	YHR087W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	15.69	■□□□□ 0.1
RTC3	YHR087W	YCR015C	P25616	317 aa		15.69	■□□□□ 0.1
RTC3	YHR087W	HEL1	P36113	551 aa		15.69	■□□□□ 0.1
RTC3	YHR087W	ESL1	P40456	1118 aa		15.69	■□□□□ 0.1
RTC3	YHR087W	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	15.69	■□□□□ 0.1
RTC3	YHR087W	PFD1	P46988	109 aa		15.69	■□□□□ 0.1
RTC3	YHR087W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	15.69	■□□□□ 0.1

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