RNA–Protein interactions for RNA: YER115C

SPR6, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene SPR6, Length 576 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPR6	YER115C	SOH1	P38633	127 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	YER130C	P39959	443 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	DSE1	P40077	573 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	CHS6	P40955	746 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	CPR7	P47103	393 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	YNR061C	P53747	219 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	TOF2	Q02208	771 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	GCN5	Q03330	439 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	YML053C	Q04978	212 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	YPQ1	Q12010	308 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	CAN1	P04817	590 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	GPA1	P08539	472 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	PPH22	P23595	377 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	VBA3	P25594	458 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	APL1	P27351	700 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	VBA5	P36172	582 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	SIF2	P38262	535 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	ATG12	P38316	186 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	YBR225W	P38321	900 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	SSN3	P39073	555 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	AVT2	P39981	480 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	GUF1	P46943	645 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	YGR237C	P50089	785 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	YNL011C	P53980	444 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	TMN2	Q04562	672 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	YLR297W	Q05899	129 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	BSP1	Q06604	576 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	YCG1	Q06680	1035 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	AFT2	Q08957	416 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	NBP2	Q12163	236 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	CDC42	P19073	191 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	HSP78	P33416	811 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	YMC2	P38087	329 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	RRM3	P38766	723 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	PFD1	P46988	109 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	ZAP1	P47043	880 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	MND1	P53102	219 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	YNL108C	P53929	270 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	SEG1	Q04279	960 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	SPO75	Q07798	868 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	YOL075C	Q08234	1294 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	FLC1	Q08967	793 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	ECM3	Q99252	613 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPR6	YER115C	JIP3	O13555	125 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPR6	YER115C	MRC1	P25588	1096 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPR6	YER115C	MSH2	P25847	964 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPR6	YER115C	DSS4	P32601	143 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPR6	YER115C	EFM2	P38347	419 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPR6	YER115C	FHL1	P39521	936 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPR6	YER115C	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SPR6	YER115C	CDC1	P40986	491 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPR6	YER115C	HFM1	P51979	1187 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPR6	YER115C	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SPR6	YER115C	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SPR6	YER115C	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SPR6	YER115C	YAP7	Q08182	245 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPR6	YER115C	TRE1	Q08919	783 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPR6	YER115C	DDC1	Q08949	612 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPR6	YER115C	APC11	Q12157	165 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPR6	YER115C	AIM44	Q99299	758 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPR6	YER115C	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPR6	YER115C	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SPR6	YER115C	YER152C	P10356	443 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPR6	YER115C	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SPR6	YER115C	DAL2	P25335	343 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPR6	YER115C	SGE1	P33335	543 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPR6	YER115C	TOR1	P35169	2470 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPR6	YER115C	CSG2	P35206	410 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPR6	YER115C	DYS1	P38791	387 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPR6	YER115C	UFE1	P41834	346 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPR6	YER115C	SUM1	P46676	1062 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPR6	YER115C	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SPR6	YER115C	NMA2	P53204	395 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPR6	YER115C	YNR065C	P53751	1116 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPR6	YER115C	PPM1	Q04081	328 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPR6	YER115C	TAF9	Q05027	157 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPR6	YER115C	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SPR6	YER115C	HDA3	Q06623	655 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPR6	YER115C	SYT1	Q06836	1226 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPR6	YER115C	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SPR6	YER115C	MDM38	Q08179	573 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPR6	YER115C	TRS33	Q99394	268 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPR6	YER115C	FMP27	Q06179	2628 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPR6	YER115C	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SPR6	YER115C	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 25 ms