RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeastyeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CYK3YDL117W DNF2Q12675 1612 aa5.31□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W MET6P05694 767 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W STE12P13574 688 aa5.31□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W RAD57P25301 460 aa5.31□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W GYP6P32806 458 aa5.31□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W YTA12P40341 825 aa5.31□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W FOX2Q02207 900 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W UTP14Q04500 899 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W GFD1Q04839 188 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W SMC5Q08204 1093 aa5.31□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W PUS7Q08647 676 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W YDL109CQ12103 647 aa5.31□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W ENO2P00925 437 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W TRP3P00937 484 aa5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W RPS7AP26786 190 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W NTH2P35172 780 aa5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W NOP4P37838 685 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W CCT6P39079 546 aa5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W SSO2P39926 295 aa5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W DDI1P40087 428 aa5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W YLL007CQ07799 665 aa5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W AEP3Q12089 606 aa5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W ATG29Q12092 213 aa5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W MED2Q12124 431 aa5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W TY1B-ER2Q03619 1755 aa5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W TY1B-MR1Q04214 1755 aa5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W TY1B-NL1Q12112 1755 aa5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W TY1B-GR1Q12141 1755 aa5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W TY1B-BLQ12490 1755 aa5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W CDC19P00549 500 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W ENO1P00924 437 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W EFT1P32324 842 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W CNS1P33313 385 aa5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W UBP11P36026 717 aa5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W COS111P38308 924 aa5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W YBR225WP38321 900 aa5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W TIF4631P39935 952 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W THO1P40040 218 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W PCL7P40186 285 aa5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W EPL1P43572 832 aa5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W HFM1P51979 1187 aa5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W YGL117WP53133 265 aa5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W RSC4Q02206 625 aa5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W MMT1Q03218 510 aa5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W YDR131CQ03899 556 aa5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W YDR514CQ04408 483 aa5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W ARP9Q05123 467 aa5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W ATG23Q06671 453 aa5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W DIB1Q06819 143 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W NEW1Q08972 1196 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W MNL2Q12205 849 aa5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W HMS1Q12398 434 aa5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W STU1P38198 1513 aa5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W HOM2P13663 365 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W PTP1P25044 335 aa5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W SWI4P25302 1093 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W ICL1P28240 557 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W GLG1P36143 616 aa5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W MAL33P38157 468 aa5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W MSG5P38590 489 aa5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W NDE1P40215 560 aa5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W NEO1P40527 1151 aa5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W ZIM17P42844 174 aa5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W LOC1P43586 204 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W MNT4P53745 580 aa5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W CNM67P53865 581 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W GTR1Q00582 310 aa5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W REC102Q02721 264 aa5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W YMR010WQ03687 405 aa5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W CTI6Q08923 506 aa5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W TYW1Q08960 810 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W LAP2Q10740 671 aa5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W YOR131CQ12486 218 aa5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W SET6Q12529 373 aa5.3□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W RAD1P06777 1100 aa5.29□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W CMD1P06787 147 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W PUT4P15380 627 aa5.29□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W VMA2P16140 517 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W UBC1P21734 215 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W SCJ1P25303 377 aa5.29□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W NAM9P27929 486 aa5.29□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W CRP1P38845 465 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W AST2P39945 430 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W SHQ1P40486 507 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W PKP1P40530 394 aa5.29□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W EMP47P43555 445 aa5.29□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W BNA1P47096 177 aa5.29□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W RFX1P48743 811 aa5.29□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W MAL13P53338 473 aa5.29□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W ZRG17P53735 605 aa5.29□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W PGA2P53903 129 aa5.29□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W PRO2P54885 456 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W YEH2Q07950 538 aa5.29□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W SGT1Q08446 395 aa5.29□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W DSE3Q08729 430 aa5.29□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W ARP7Q12406 477 aa5.29□□□□□ -1.56
CYK3YDL117W AHC1Q12433 566 aa5.29□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 31.6 ms