RNA–Protein interactions for RNA: YPL060C-A

YPL060C-A, Transcript of TyA Gag protein, yeastyeast

Gene YPL060C-A, Length 3,315 nt, Biotype pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL060C-AYPL060C-A GUS1P46655 708 aaKnown RBP RIP-Chip data0.84□□□□□ -2.28not detected
YPL060C-AYPL060C-A MDV1P47025 714 aa0.84□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A BUL2Q03758 920 aaKnown RBP0.84□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A TRM13Q12383 476 aa0.84□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A AI5_ALPHAQ9ZZX1 630 aa0.84□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A PET127P32606 800 aa0.83□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A HOT13P36078 116 aa0.83□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A FAP7Q12055 197 aaPredicted RBP0.83□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A COS111P38308 924 aa0.83□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A YDR179W-AQ03983 463 aa0.83□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A DSE3Q08729 430 aa0.83□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A MSL5Q12186 476 aaKnown RBP RIP-Chip data0.83□□□□□ -2.28not detected
YPL060C-AYPL060C-A SAN1P22470 610 aa0.82□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A LSB5P25369 354 aa0.82□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A PET10P36139 283 aa0.82□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A CTF8P38877 133 aa0.82□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A NUP60P39705 539 aa0.82□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A ZIP2P53061 704 aa0.82□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A MAK10Q02197 733 aa0.82□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A GUD1Q07729 489 aa0.82□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A ZPS1Q12512 249 aa0.82□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A AAD3P25612 363 aa0.82□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A SMX3P54999 86 aaPredicted RBP0.82□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A YLR049CQ12110 428 aa0.82□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A DHH1P39517 506 aaKnown RBP0.82□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A YNL195CP40168 261 aa0.82□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A MPS3P47069 682 aa0.82□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A BPL1P48445 690 aaPredicted RBP0.82□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A UBC11P52492 156 aa0.82□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A SPO1P53541 631 aa0.82□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A NUP53Q03790 475 aa0.82□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A TOS4Q06266 489 aa0.82□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A FMP25Q08023 583 aa0.82□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A CRC1Q12289 327 aa0.82□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A DHR2P36009 735 aaPredicted RBP0.81□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A FUN12P39730 1002 aaKnown RBP0.81□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A IDS2P46958 469 aa0.81□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A TEX1P53851 422 aaKnown RBP0.81□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A YNL058CP53947 316 aa0.81□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A CEF1Q03654 590 aaPredicted RBP0.81□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A RKI1Q12189 258 aa0.81□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A Q0142Q9ZZW4 58 aa0.81□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A TUB3P09734 445 aaKnown RBP0.81□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A YUR1P26725 428 aa0.81□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A YHR097CP38809 366 aaKnown RBP0.81□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A PXA1P41909 870 aa0.81□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A SKP2P42843 763 aa0.81□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A WAR1Q03631 944 aa0.81□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A PRP16P15938 1071 aaPredicted RBP0.81□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A YBP1P38315 674 aa0.81□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A MRK1P50873 501 aa0.81□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A HDA1P53973 706 aa0.81□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A MCM21Q06675 368 aa0.81□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A PCK1P10963 549 aa0.8□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A ATE1P16639 503 aa0.8□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A GRX1P25373 110 aaKnown RBP0.8□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A YNK1P36010 153 aaKnown RBP0.8□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A MAF1P41910 395 aa0.8□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A COG2P53271 262 aa0.8□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A CPR8P53728 308 aa0.8□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A EEB1Q02891 456 aa0.8□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A NHX1Q04121 633 aa0.8□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A OSW1Q08692 278 aa0.8□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A YPK1P12688 680 aaKnown RBP0.8□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A MRPL7P36519 292 aa0.8□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A BNA3P47039 444 aaKnown RBP0.8□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A SDA1P53313 767 aaKnown RBP0.8□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A SCW10Q04951 389 aa0.8□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A GUK1P15454 187 aaKnown RBP0.79□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A PRP28P23394 588 aa0.79□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A MGM1P32266 881 aa0.79□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A PAC2P39937 518 aa0.79□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A YGR153WP48238 217 aa0.79□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A PTA1Q01329 785 aaPredicted RBP0.79□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A SHE9Q04172 456 aa0.79□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A SEC3P33332 1336 aaKnown RBP0.79□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A PDA1P16387 420 aaKnown RBP0.79□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A RPS2P25443 254 aaKnown RBP0.79□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A APL2P36000 726 aaPredicted RBP0.79□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A FMO1P38866 432 aa0.79□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A BNA2P47125 453 aa0.79□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A TAN1P53072 289 aaPredicted RBP0.79□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A YIP4P53093 235 aa0.79□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A TUP1P16649 713 aa0.79□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A NIC96P34077 839 aa0.79□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A UBA4P38820 440 aa0.79□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A SET2P46995 733 aaKnown RBP0.79□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A TDA9Q04545 1251 aa0.79□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A YML053CQ04978 212 aa0.79□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A ENV7Q12003 364 aa0.79□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A TAH18Q12181 623 aa0.79□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A HBN1Q96VH4 193 aa0.79□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A YMR084WA2P2R3 262 aa0.78□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A SSD1P24276 1250 aaKnown RBP RIP-Chip data0.78□□□□□ -2.28not detected
YPL060C-AYPL060C-A FEN2P25621 512 aaKnown RBP0.78□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A YEL025CP39991 1188 aa0.78□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A IRC8P47046 822 aa0.78□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A RFX1P48743 811 aa0.78□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A POB3Q04636 552 aaKnown RBP0.78□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A ASM4Q05166 528 aa0.78□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 50.2 ms