RNA–Protein interactions for RNA: YOR197W

MCA1, Transcript of Ca2+-dependent cysteine protease, yeast

Gene MCA1, Length 1,299 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MCA1	YOR197W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
MCA1	YOR197W	ATG4	P53867	494 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MCA1	YOR197W	THI22	Q06490	572 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MCA1	YOR197W	THI73	Q07904	523 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MCA1	YOR197W	STU1	P38198	1513 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MCA1	YOR197W	ATG2	P53855	1592 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MCA1	YOR197W	MYO4	P32492	1471 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MCA1	YOR197W	MDM10	P18409	493 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MCA1	YOR197W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
MCA1	YOR197W	BCS1	P32839	456 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MCA1	YOR197W	YEL1	P34225	687 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MCA1	YOR197W	PAF1	P38351	445 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MCA1	YOR197W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
MCA1	YOR197W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
MCA1	YOR197W	RTS3	P53289	263 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MCA1	YOR197W	UME1	Q03010	460 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MCA1	YOR197W	PEP1	P32319	1579 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MCA1	YOR197W	RPO31	P04051	1460 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MCA1	YOR197W	SFL1	P20134	766 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MCA1	YOR197W	SPO11	P23179	398 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MCA1	YOR197W	APN2	P38207	520 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MCA1	YOR197W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
MCA1	YOR197W	YEL020C	P39994	560 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MCA1	YOR197W	DCS2	Q12123	353 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MCA1	YOR197W	GIN4	Q12263	1142 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MCA1	YOR197W	SMC4	Q12267	1418 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MCA1	YOR197W	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MCA1	YOR197W	SEC6	P32844	805 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MCA1	YOR197W	GRX7	P38068	203 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MCA1	YOR197W	MGS1	P40151	587 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MCA1	YOR197W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MCA1	YOR197W	COG8	Q04632	607 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MCA1	YOR197W	VPS36	Q06696	566 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MCA1	YOR197W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MCA1	YOR197W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MCA1	YOR197W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.15	□□□□□ -1.75	not detected
MCA1	YOR197W	FUB1	P25659	250 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	BIT2	P38346	545 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	ATG36	P46983	293 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	YJR039W	P47107	1121 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	YGR151C	P53287	111 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	FOL1	P53848	824 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	THI7	Q05998	598 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	TMA17	Q12513	150 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	YHR202W	P38887	602 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	RFX1	P48743	811 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	MET13	P53128	600 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	GPG1	P53130	126 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	HFD1	Q04458	532 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	COQ11	Q05892	277 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	YOR1	P53049	1477 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	MDS3	P53094	1487 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	MMS22	Q06164	1454 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	YIL077C	P40508	320 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	MPS3	P47069	682 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	GUD1	Q07729	489 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	YOL057W	Q08225	711 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	SCC2	Q04002	1493 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	TOP1	P04786	769 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	GMH1	P36125	273 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	MUP3	P38734	546 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	MIT1	P40002	666 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	PIG2	P40187	538 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	NMA2	P53204	395 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	STH1	P32597	1359 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	RPN13	O13563	156 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	PRP28	P23394	588 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	YPT7	P32939	208 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	YJR096W	P47137	282 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	YJR120W	P47157	116 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	YDL086W	Q07505	273 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	TRE2	Q08693	809 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	STE12	P13574	688 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	YMC2	P38087	329 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	CKB2	P38930	258 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	BEM4	P39011	633 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	PAC2	P39937	518 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	TPM2	P40414	161 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	PEX8	P53248	589 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	SPC98	P53540	846 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MCA1	YOR197W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75

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