RNA–Protein interactions for RNA: YOL083W

ATG34, Transcript of Receptor protein involved in selective autophagy during starvation, yeast

Gene ATG34, Length 1,239 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG34	YOL083W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	OMS1	Q06668	471 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	POM34	Q12445	299 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.82	□□□□□ -1.64	not detected
ATG34	YOL083W	ATP12	P22135	325 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	SFB3	P38810	929 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	DAS1	P47005	663 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	TEL2	P53038	688 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	MUK1	Q02866	612 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	YMR206W	Q03695	313 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	HXT4	P32467	576 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	REV7	P38927	245 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	FHN1	P53279	174 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	RIA1	P53893	1110 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	NSE5	Q03718	556 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	GIS1	Q03833	894 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected
ATG34	YOL083W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	KIN82	P25341	720 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	BCS1	P32839	456 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	PHO11	P35842	467 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	PHO12	P38693	467 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	PXA1	P41909	870 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	TAF4	P50105	388 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	SPC105	P53148	917 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	SPO1	P53541	631 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	KAR1	P11927	433 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	YHL017W	P38745	532 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	PIG2	P40187	538 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	YIL077C	P40508	320 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	RFX1	P48743	811 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	PEX8	P53248	589 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	YAP1802	P53309	568 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	YNL034W	P53963	612 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	YNL018C	P53976	612 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	PPN1	Q04119	674 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	PHM6	Q05637	104 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	PEX15	Q08215	383 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	MLH3	Q12083	715 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	PNS1	Q12412	539 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	ZRT2	Q12436	422 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	PCL5	P38794	229 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	SLD3	P53135	668 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	CTF4	Q01454	927 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	ACF2	Q12168	779 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	SEC15	P22224	910 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	PRP28	P23394	588 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	PRE4	P30657	266 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	MTC7	P32633	139 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	MOH1	P38191	138 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	COS111	P38308	924 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	EMP65	P40085	556 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	PEA2	P40091	420 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	IRC5	P43610	853 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	STB4	P50104	949 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	TGL2	P54857	326 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	SND1	Q04007	877 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	YFT2	Q06676	274 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	USV1	Q12132	391 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	DGR2	P32330	852 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	OAR1	P35731	278 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	GRX7	P38068	203 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	YHR033W	P38690	423 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	PRM2	P40534	656 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	MPS3	P47069	682 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	SSL2	Q00578	843 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	MCH5	Q08777	521 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	TUP1	P16649	713 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	SET3	P36124	751 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	CDS1	P38221	457 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.74	□□□□□ -1.65	not detected
ATG34	YOL083W	EAF5	P39995	279 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	SDS3	P40505	327 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	TIM44	Q01852	431 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	SLX4	Q12098	748 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	HMG2	P12684	1045 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG34	YOL083W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65

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