RNA–Protein interactions for RNA: YMR188C

MRPS17, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene MRPS17, Length 714 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPS17	YMR188C	REV7	P38927	245 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	EMP65	P40085	556 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	BAP3	P41815	604 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	UBC11	P52492	156 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	ASM4	Q05166	528 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	TGL5	Q12043	749 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	HFI1	Q12060	488 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	SUT2	Q12286	268 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	FAT1	P38225	669 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	BCD1	P38772	366 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	YHR202W	P38887	602 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	HOS4	P40480	1083 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	YJR039W	P47107	1121 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	MET14	Q02196	202 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	GAD1	Q04792	585 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	HOF1	Q05080	669 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	YKL133C	P36066	463 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	PIP2	P52960	996 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	YMR210W	Q03649	449 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	YLR407W	Q06070	228 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	PEX15	Q08215	383 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	RPN13	O13563	156 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	GAL1	P04385	528 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	KCC4	P25389	1037 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	APN2	P38207	520 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	RIM4	P38741	713 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	ATG16	Q03818	150 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	ARO10	Q06408	635 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	BNR1	P40450	1375 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	PTP2	P29461	750 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	FUI1	P38196	639 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	DUN1	P39009	513 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	TAF3	Q12297	353 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	GPR1	Q12361	961 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
MRPS17	YMR188C	APM4	Q99186	491 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	SIR3	P06701	978 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	SWI6	P09959	803 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	ATP12	P22135	325 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	ADY2	P25613	283 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	PEX2	P32800	271 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	APT2	P36973	181 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	YJL206C	P39529	758 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	VID28	P40547	921 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	COX18	P53239	316 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	UBX4	P54730	416 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	MLC2	Q06580	163 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	SPO11	P23179	398 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	BEM4	P39011	633 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	ARG2	P40360	574 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	NDC80	P40460	691 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	HIS6	P40545	261 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	HOL1	P53389	586 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	PIF1	P07271	859 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	DGR2	P32330	852 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	VHS3	Q08438	674 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MRPS17	YMR188C	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MRPS17	YMR188C	GLG1	P36143	616 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPS17	YMR188C	CTR1	P49573	406 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPS17	YMR188C	NUR1	Q12066	484 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPS17	YMR188C	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64

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