RNA–Protein interactions for RNA: YML063W

RPS1B, Transcript of Ribosomal protein 10 (rp10) of the small (40S) subunit, yeast

Gene RPS1B, Length 768 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS1B	YML063W	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	AI3	P03877	415 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	BI4	P03879	638 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	PDX1	P16451	410 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	YCL049C	P25577	312 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	AAD3	P25612	363 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	TAF5	P38129	798 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	RXT2	P38255	430 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	NPR3	P38742	1146 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	VHR1	P40522	640 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	AXL1	P40851	1208 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	GCV1	P48015	400 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	FCP1	Q03254	732 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	PSR1	Q07800	427 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	GAS5	Q08193	484 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	PGC1	Q08959	321 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	CDC16	P09798	840 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	AAC3	P18238	307 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	PHO3	P24031	467 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	NPP1	P25353	742 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	APM3	P38153	483 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	LAM1	P38851	1228 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	SPC72	P39723	622 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	MEP1	P40260	492 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	HXT16	P47185	567 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	YKE2	P52553	114 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	NNF2	P53253	936 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	RIA1	P53893	1110 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	ACM1	Q08981	209 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	FKS3	Q04952	1785 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	MET8	P15807	274 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	MIH1	P23748	554 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	RPC53	P25441	422 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	KIP1	P28742	1111 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	DBF4	P32325	704 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	CBF2	P32504	956 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	TFA2	P36145	328 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	YIL092W	P40497	633 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.71	□□□□□ -1.66	not detected
RPS1B	YML063W	RMD8	P43620	662 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	SAP4	P53036	818 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	VID22	Q05934	901 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	PSF3	Q12146	194 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	YLL054C	Q12244	843 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	RAV1	P47104	1357 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	NUC1	P08466	329 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	CKA1	P15790	372 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	SEC65	P29478	273 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	RPC82	P32349	654 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	SLA2	P33338	968 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	TGL1	P34163	548 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	MRPL36	P36531	177 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	RRM3	P38766	723 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	RRF1	P38771	230 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	YAR028W	P39548	234 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	STL1	P39932	569 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	YER010C	P40011	234 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	DJP1	P40564	432 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	CIR1	P42940	261 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	ALY2	P47029	1046 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	BFA1	P47113	574 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	CTF18	P49956	741 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	PCL10	P53124	433 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	YPL277C	Q08989	487 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	NUR1	Q12066	484 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	YIL177C	P40434	1758 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPS1B	YML063W	YJL225C	P40889	1758 aa		4.7	□□□□□ -1.66

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.5 ms