RNA–Protein interactions for RNA: YHR039C

MSC7, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene MSC7, Length 1,935 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSC7	YHR039C	ATG20	Q07528	640 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	SRF1	Q12516	437 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	PDR18	P53756	1333 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	TRP3	P00937	484 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	CYT1	P07143	309 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	CDC15	P27636	974 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	PTP2	P29461	750 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	LOT5	P34234	306 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	TGL4	P36165	910 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	CHK1	P38147	527 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	YBL036C	P38197	257 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	RTT107	P38850	1070 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	STL1	P39932	569 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	PCI8	P40512	444 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	SYG1	P40528	902 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	YJR098C	P47139	656 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	STB4	P50104	949 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	MON1	P53129	644 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	EAR1	Q03212	550 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	ABZ2	Q03266	374 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	JIP4	Q03361	876 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	YDL144C	Q07589	356 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	RTT10	Q08924	1013 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	ATG29	Q12092	213 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	MIH1	P23748	554 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	GRR1	P24814	1151 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	CBF2	P32504	956 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	SEC66	P33754	206 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	UBS1	P38290	277 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	MNL1	P38888	796 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	PRM9	P39551	298 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	UBP9	P39967	754 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	YIL077C	P40508	320 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	AXL1	P40851	1208 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	MAD3	P47074	515 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	TAF4	P50105	388 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	PDR8	Q06149	701 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	ATG13	Q06628	738 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	YCG1	Q06680	1035 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	MRL1	Q06815	381 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	RRT8	Q08219	342 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	TY3A-G	Q12173	290 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	SFI1	Q12369	946 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	TY3A-I	Q99219	290 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
MSC7	YHR039C	ALG1	P16661	449 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	MRM1	P25270	412 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	KCC4	P25389	1037 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	SFP1	P32432	683 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	PMT1	P33775	817 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	EAP1	P36041	632 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	RIM4	P38741	713 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	VMA22	P38784	181 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	KHA1	P40309	873 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	MND2	P40577	368 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	YDL183C	P48569	320 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	MNT2	P53059	558 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	MEP3	P53390	489 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	DSE4	P53753	1117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	ESBP6	P53918	673 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	YNL035C	P53962	389 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	SML1	Q04964	104 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	GRS2	Q06817	618 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	BRE4	Q07660	1125 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	YPD1	Q07688	167 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	PET122	P10355	254 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	CLB3	P24870	427 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	DBF4	P32325	704 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	SMI1	P32566	505 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	YME1	P32795	747 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	SRL3	P36167	246 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	SEA4	P38164	1038 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	YBR071W	P38243	211 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	SOH1	P38633	127 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	JLP2	P40206	208 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	COX16	P47081	118 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	GOR1	P53839	350 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	YNL108C	P53929	270 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSC7	YHR039C	SSL2	Q00578	843 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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