RNA–Protein interactions for RNA: YGL238W

CSE1, Transcript of Nuclear envelope protein that mediates the nuclear export of Srp1p, yeast

Gene CSE1, Length 2,883 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSE1	YGL238W	USA1	Q03714	838 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	REH1	Q06709	432 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	NDD1	Q08887	554 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	RKI1	Q12189	258 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	YOR093C	Q12275	1648 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	CIT1	P00890	479 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	AAD3	P25612	363 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	CDS1	P38221	457 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	SPC97	P38863	823 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	BEM4	P39011	633 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	VAC8	P39968	578 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	YJR039W	P47107	1121 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	ORM2	Q06144	216 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	MAK32	P23060	363 aa		0.87	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	MEF1	P25039	761 aa		0.87	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	0.87	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	MTC7	P32633	139 aa		0.87	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	MNN4	P36044	1178 aa		0.87	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	EXO1	P39875	702 aa		0.87	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	BIT61	P47041	543 aa		0.87	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	REC102	Q02721	264 aa		0.87	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	YFT2	Q06676	274 aa		0.87	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	YOR111W	Q99210	232 aa		0.87	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	SIN3	P22579	1536 aa		0.87	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	ABF1	P14164	731 aa		0.87	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	BEM3	P32873	1128 aa		0.87	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	BUD6	P41697	788 aa		0.87	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	YDL183C	P48569	320 aa		0.87	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	PCL10	P53124	433 aa		0.87	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	CWC24	P53769	259 aa		0.87	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	SCW10	Q04951	389 aa		0.87	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	IRC3	Q06683	689 aa		0.87	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	VPS36	Q06696	566 aa		0.87	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.87	□□□□□ -2.27	not detected
CSE1	YGL238W	FLC1	Q08967	793 aa		0.87	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	ECM3	Q99252	613 aa		0.87	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	TPK2	P06245	380 aa		0.86	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	TUP1	P16649	713 aa		0.86	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	PCI8	P40512	444 aa		0.86	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	NMA2	P53204	395 aa		0.86	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	NUP53	Q03790	475 aa		0.86	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	0.86	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	AQY1	P0CD91	305 aa		0.86	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	RAD4	P14736	754 aa		0.86	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.86	□□□□□ -2.27	not detected
CSE1	YGL238W	PCL2	P25693	308 aa		0.86	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	YOX1	P34161	385 aa		0.86	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	APT2	P36973	181 aa		0.86	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	GDH3	P39708	457 aa		0.86	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	YIL152W	P40455	235 aa		0.86	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	PMT6	P42934	759 aa		0.86	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	SAE2	P46946	345 aa		0.86	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	CPR8	P53728	308 aa		0.86	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	ARR3	Q06598	404 aa		0.86	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	YDL086W	Q07505	273 aa		0.86	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	SRL1	Q08673	210 aa		0.86	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	DIF1	O13577	133 aa		0.86	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	CDC9	P04819	755 aa		0.86	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	YFL068W	P0CX99	160 aa		0.86	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		0.86	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		0.86	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	YAT2	P40017	923 aa		0.86	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	MNT3	P40549	630 aa		0.86	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	SHR5	P41912	237 aa		0.86	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	DIP5	P53388	608 aa		0.86	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	YDR514C	Q04408	483 aa		0.86	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	POM34	Q12445	299 aa		0.86	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	HOP1	P20050	605 aa		0.85	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	MRPL7	P36519	292 aa		0.85	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	BUD8	P41698	603 aa		0.85	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	ATP23	P53722	227 aa		0.85	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	YNL092W	P53934	400 aa		0.85	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	0.85	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	UFO1	Q04511	668 aa		0.85	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	YPS7	Q06325	596 aa		0.85	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	YLR001C	Q07895	862 aa		0.85	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	SNF2	P22082	1703 aa		0.85	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	BNI1	P41832	1953 aa		0.85	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	PRE4	P30657	266 aa		0.85	□□□□□ -2.27

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