RNA–Protein interactions for RNA: YDR093W

DNF2, Transcript of Aminophospholipid translocase (flippase), yeast

Gene DNF2, Length 4,839 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DNF2	YDR093W	YIH1	P25637	258 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	CHA4	P43634	648 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	YGR016W	P53209	190 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	HOT1	Q03213	719 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	GNT1	Q12096	491 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	YOS9	Q99220	542 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	TAO3	P40468	2376 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	GAL10	P04397	699 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	MSS51	P32335	436 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	PEP7	P32609	515 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	SMF1	P38925	575 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	LDB18	Q07887	179 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	MGT1	P26188	188 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	GSY2	P27472	705 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	APD1	P38281	316 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	EFM1	P38732	585 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	APE4	P38821	490 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	YNL140C	P53910	189 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	FMP30	Q02883	468 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	PDR1	P12383	1068 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	TDA3	P38758	523 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	YHI9	P38765	294 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	YHR078W	P38799	552 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	CSM2	P40465	213 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	CEP3	P40969	608 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	ALT1	P52893	592 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	TOF2	Q02208	771 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	EAR1	Q03212	550 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	ERV41	Q04651	352 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	HDA3	Q06623	655 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	CYM1	P32898	989 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	FMO1	P38866	432 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	RGA1	P39083	1007 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	HAT2	P39984	401 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	NUT1	P53114	1132 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	GTB1	Q04924	702 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	HEM2	P05373	342 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	PRT1	P06103	763 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	CKI1	P20485	582 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	MRPL32	P25348	183 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	SSO1	P32867	290 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	CSE2	P33308	149 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	TGL4	P36165	910 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	NPP2	P39997	493 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	TCB2	P48231	1178 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	VPS62	P53285	467 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	EMP46	Q12396	444 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	SEC6	P32844	805 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	RTT107	P38850	1070 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	ARO80	Q04052	950 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	ADY4	Q05955	493 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	LAG2	Q92325	660 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.04	□□□□□ -1.6	RIP-Chip
DNF2	YDR093W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	TOS1	P38288	455 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	EXO1	P39875	702 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	RMD8	P43620	662 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	RSM26	P47141	266 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	RET3	P53600	189 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	CCE1	Q03702	353 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	MGR3	Q04472	501 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	YLL007C	Q07799	665 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	SPS1	P08458	490 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	APE1	P14904	514 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	KTR2	P33550	425 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	ASH1	P34233	588 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	TDA11	P38854	504 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	YGR021W	P53212	290 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	GPA2	P10823	449 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	CHS3	P29465	1165 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	STB6	P36085	766 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DNF2	YDR093W	BCD1	P38772	366 aa		5.03	□□□□□ -1.6

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