RNA–Protein interactions for RNA: YCL008C

STP22, Transcript of Component of the ESCRT-I complex, yeast

Gene STP22, Length 1,158 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STP22	YCL008C	APC1	P53886	1748 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	HCM1	P25364	564 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	RAD24	P32641	659 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	YKL222C	P35995	705 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	CIN4	P39110	191 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	SSY5	P47002	699 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	PHO23	P50947	330 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	ZIP2	P53061	704 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	TIM50	Q02776	476 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	TFB2	Q02939	513 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	VPS60	Q03390	229 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	SWM1	Q12379	170 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	PEX14	P53112	341 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	ASI2	P53895	289 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	SSL2	Q00578	843 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	CRR1	Q05790	422 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	NTO1	Q12311	748 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	RAD18	P10862	487 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	PCL2	P25693	308 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	SAK1	P38990	1142 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	PZF1	P39933	429 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	VHR1	P40522	640 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	AIM21	P40563	679 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	BUL1	P48524	976 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	YLR001C	Q07895	862 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	GPR1	Q12361	961 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	MIH1	P23748	554 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	HOG1	P32485	435 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	CTF13	P35203	478 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	NPR3	P38742	1146 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	PFA3	P42836	336 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	ERG5	P54781	538 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	DNM1	P54861	757 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	ASM4	Q05166	528 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STP22	YCL008C	MRP7	P12687	371 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STP22	YCL008C	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
STP22	YCL008C	TOA1	P32773	286 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STP22	YCL008C	YEL1	P34225	687 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STP22	YCL008C	MRPS35	P53292	345 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STP22	YCL008C	YNL193W	P53870	558 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STP22	YCL008C	NHX1	Q04121	633 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STP22	YCL008C	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
STP22	YCL008C	YOL057W	Q08225	711 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STP22	YCL008C	RIM20	Q12033	661 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STP22	YCL008C	TRM11	Q12463	433 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STP22	YCL008C	YLR149C	Q99296	730 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STP22	YCL008C	PDR18	P53756	1333 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STP22	YCL008C	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
STP22	YCL008C	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
STP22	YCL008C	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
STP22	YCL008C	SFL1	P20134	766 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STP22	YCL008C	CLB1	P24868	471 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STP22	YCL008C	SWC3	P31376	625 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STP22	YCL008C	DEP1	P31385	405 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STP22	YCL008C	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
STP22	YCL008C	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
STP22	YCL008C	RPP1	P38786	293 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STP22	YCL008C	BNA2	P47125	453 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STP22	YCL008C	CTF18	P49956	741 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STP22	YCL008C	NPY1	P53164	384 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STP22	YCL008C	RNT1	Q02555	471 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STP22	YCL008C	PKH1	Q03407	766 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STP22	YCL008C	ATG33	Q06485	197 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STP22	YCL008C	HIF1	Q12373	385 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STP22	YCL008C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STP22	YCL008C	YRF1-2	P40105	1681 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STP22	YCL008C	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
STP22	YCL008C	ADR1	P07248	1323 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STP22	YCL008C	HMG1	P12683	1054 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STP22	YCL008C	MBR1	P23493	339 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STP22	YCL008C	MRC1	P25588	1096 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STP22	YCL008C	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
STP22	YCL008C	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
STP22	YCL008C	SFP1	P32432	683 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STP22	YCL008C	TRM2	P33753	639 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STP22	YCL008C	YKR051W	P36142	418 aa		4.56	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.6 ms