RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042312.13

Trafd1-201, Transcript of TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trafd1, Length 2,503 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Slu7Q8BHJ9 585 aa25.74■■□□□ 1.71
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sept12Q9D451 317 aa25.74■■□□□ 1.71
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tbc1d7Q9D0K0 293 aa25.74■■□□□ 1.71
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fam13bQ8K2H3 851 aa25.73■■□□□ 1.71
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Card6E9PWH2 1175 aa25.73■■□□□ 1.71
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Shank3Q4ACU6 1730 aa25.73■■□□□ 1.71
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Prdm1Q60636 856 aa25.72■■□□□ 1.71
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pip4k2bQ80XI4 416 aa25.72■■□□□ 1.71
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cnot6lQ8VEG6 555 aa25.72■■□□□ 1.71
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Atp2b3Q0VF55 1220 aa25.72■■□□□ 1.71
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ap5z1Q3U829 807 aa25.72■■□□□ 1.71
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zkscan4Q5SZT6 480 aa25.72■■□□□ 1.71
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sec62Q8BU14 398 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fsd2Q8BZ52 692 aa25.72■■□□□ 1.71
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mei1Q9D4I2 1268 aa25.72■■□□□ 1.71
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ythdc1E9Q5K9 736 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Bin1O08539 588 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kiaa0754Q69ZZ9 979 aa25.71■■□□□ 1.71
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Acap3Q6NXL5 833 aa25.71■■□□□ 1.71
Trafd1-201ENSMUST00000042312 ImmtQ8CAQ8 757 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Adam1bQ8R534 806 aa25.71■■□□□ 1.71
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tcof1O08784 1320 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
Trafd1-201ENSMUST00000042312 TfrcQ62351 763 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CtifQ6PEE2 600 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tpcn2Q8BWC0 731 aa25.71■■□□□ 1.71
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sil1Q9EPK6 465 aa25.71■■□□□ 1.71
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cdc45Q9Z1X9 566 aa25.71■■□□□ 1.71
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sptlc2P97363 560 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Frmd3Q8BHD4 595 aa25.7■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Telo2Q9DC40 840 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mylk2Q8VCR8 613 aa25.69■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sipa1l3G3X9J0 1776 aa25.69■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cbx1P83917 185 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 ApobrQ8VBT6 942 aa25.69■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Col3a1P08121 1464 aa25.68■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ccng2O08918 344 aa25.68■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CebpaP53566 359 aa25.68■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Atp8a2P98200 1148 aa25.68■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fam160b2Q80YR2 744 aa25.68■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ehd2Q8BH64 543 aa25.68■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cadps2Q8BYR5 1297 aa25.68■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Srek1Q8BZX4 494 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Crb1Q8VHS2 1405 aa25.68■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Wdr19Q3UGF1 1341 aa25.68■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lipo1J3QME6 396 aa25.68■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Itga6Q61739 1091 aa25.68■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Luzp1Q8R4U7 1068 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lrrc2Q8VDB8 371 aa25.68■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Myh7Q91Z83 1935 aa25.68■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 HdgfP51859 237 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nlrp9aQ66X03 949 aa25.67■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Acnat2Q8BGG9 420 aa25.67■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gigyf1Q99MR1 1044 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nip7Q9CXK8 180 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm20425E9Q035 978 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 SrprbP47758 269 aa25.67■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sptlc3Q8BG54 563 aa25.67■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zeb2Q9R0G7 1215 aa25.67■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pard3Q99NH2 1333 aa25.67■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Llgl2Q3TJ91 1027 aa25.66■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kdm3aQ6PCM1 1323 aa25.66■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pcdhb9E9Q5G2 828 aa25.66■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cyp26a1O55127 497 aa25.66■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mtx1P47802 317 aa25.66■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Smim5Q8BT42 78 aa25.66■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 DymQ8CHY3 669 aa25.66■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CerkQ8K4Q7 531 aa25.66■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cdhr2E9Q7P9 1308 aa25.66■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zscan29E9Q5B4 869 aa25.65■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Prkag3Q8BGM7 489 aa25.65■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Slx1bQ8BX32 270 aa25.65■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zfp202Q8C879 641 aa25.65■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Yeats4Q9CR11 227 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Plcb3P51432 1234 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm28047Q3US59 414 aa25.65■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nop2Q922K7 793 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cops6O88545 324 aa25.64■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 U2af2P26369 475 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Frat1P70339 274 aa25.64■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fam170aQ66LM6 333 aa25.64■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cep135Q6P5D4 1140 aa25.64■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gnl3lQ6PGG6 577 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ints4Q8CIM8 964 aa25.64■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Xpo4Q9ESJ0 1151 aa25.64■■□□□ 1.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pfkfb1P70266 471 aa25.64■■□□□ 1.69
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Odf2lQ9D478 642 aa25.64■■□□□ 1.69
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kcnq5Q9JK45 933 aa25.64■■□□□ 1.69
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm43638A0A0J9YU36 694 aa25.63■■□□□ 1.69
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nav1Q8CH77 1875 aa25.63■■□□□ 1.69
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Bin2D3Z6Q9 489 aa25.63■■□□□ 1.69
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zbtb21E9Q444 1094 aa25.63■■□□□ 1.69
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Myl10Q62082 202 aa25.63■■□□□ 1.69
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lmod1Q8BVA4 595 aa25.63■■□□□ 1.69
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kiaa1524Q8BWY9 907 aa25.63■■□□□ 1.69
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zbtb43Q9DAI4 467 aa25.62■■□□□ 1.69
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Acot9Q9R0X4 439 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Large1Q9Z1M7 756 aa25.62■■□□□ 1.69
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cyp3a59D3Z2W7 503 aa25.62■■□□□ 1.69
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Metap2O08663 478 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nbr1P97432 988 aa25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 40.7 ms