Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESJ0

Xpo4, Exportin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xpo4Q9ESJ0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Xpo4Q9ESJ0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
Xpo4Q9ESJ0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Xpo4Q9ESJ0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Xpo4Q9ESJ0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
Xpo4Q9ESJ0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Xpo4Q9ESJ0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Xpo4Q9ESJ0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Xpo4Q9ESJ0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Xpo4Q9ESJ0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Xpo4Q9ESJ0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Xpo4Q9ESJ0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Xpo4Q9ESJ0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Xpo4Q9ESJ0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Xpo4Q9ESJ0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Xpo4Q9ESJ0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Xpo4Q9ESJ0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Xpo4Q9ESJ0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Xpo4Q9ESJ0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Xpo4Q9ESJ0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Xpo4Q9ESJ0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Xpo4Q9ESJ0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Xpo4Q9ESJ0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Xpo4Q9ESJ0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Xpo4Q9ESJ0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Xpo4Q9ESJ0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
Xpo4Q9ESJ0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Xpo4Q9ESJ0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Xpo4Q9ESJ0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Xpo4Q9ESJ0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Xpo4Q9ESJ0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Xpo4Q9ESJ0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Xpo4Q9ESJ0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Xpo4Q9ESJ0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Xpo4Q9ESJ0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Xpo4Q9ESJ0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Xpo4Q9ESJ0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Xpo4Q9ESJ0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Xpo4Q9ESJ0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Xpo4Q9ESJ0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Xpo4Q9ESJ0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Xpo4Q9ESJ0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Xpo4Q9ESJ0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Xpo4Q9ESJ0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Xpo4Q9ESJ0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Xpo4Q9ESJ0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Xpo4Q9ESJ0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Xpo4Q9ESJ0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Xpo4Q9ESJ0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Xpo4Q9ESJ0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Xpo4Q9ESJ0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Xpo4Q9ESJ0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Xpo4Q9ESJ0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
Xpo4Q9ESJ0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Xpo4Q9ESJ0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Xpo4Q9ESJ0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Xpo4Q9ESJ0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Xpo4Q9ESJ0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Xpo4Q9ESJ0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Xpo4Q9ESJ0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Xpo4Q9ESJ0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Xpo4Q9ESJ0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
Xpo4Q9ESJ0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Xpo4Q9ESJ0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
Xpo4Q9ESJ0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Xpo4Q9ESJ0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Xpo4Q9ESJ0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Xpo4Q9ESJ0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Xpo4Q9ESJ0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Xpo4Q9ESJ0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Xpo4Q9ESJ0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Xpo4Q9ESJ0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Xpo4Q9ESJ0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Xpo4Q9ESJ0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Xpo4Q9ESJ0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Xpo4Q9ESJ0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Xpo4Q9ESJ0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Xpo4Q9ESJ0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Xpo4Q9ESJ0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Xpo4Q9ESJ0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Xpo4Q9ESJ0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Xpo4Q9ESJ0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Xpo4Q9ESJ0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Xpo4Q9ESJ0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Xpo4Q9ESJ0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Xpo4Q9ESJ0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Xpo4Q9ESJ0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Xpo4Q9ESJ0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Xpo4Q9ESJ0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Xpo4Q9ESJ0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Xpo4Q9ESJ0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Xpo4Q9ESJ0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Xpo4Q9ESJ0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Xpo4Q9ESJ0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Xpo4Q9ESJ0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Xpo4Q9ESJ0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Xpo4Q9ESJ0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Xpo4Q9ESJ0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Xpo4Q9ESJ0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Xpo4Q9ESJ0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms