Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESJ0

Xpo4, Exportin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xpo4Q9ESJ0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,62■■■■□ 3,77
Xpo4Q9ESJ0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38,2■■■■□ 3,71
Xpo4Q9ESJ0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,22■■■■□ 3,55
Xpo4Q9ESJ0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,22■■■■□ 3,55
Xpo4Q9ESJ0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36,19■■■■□ 3,38
Xpo4Q9ESJ0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,66■■■■□ 3,3
Xpo4Q9ESJ0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,4■■■■□ 3,26
Xpo4Q9ESJ0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,23■■■■□ 3,23
Xpo4Q9ESJ0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,09■■■■□ 3,21
Xpo4Q9ESJ0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34,82■■■■□ 3,16
Xpo4Q9ESJ0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,62■■■■□ 3,13
Xpo4Q9ESJ0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,58■■■■□ 3,13
Xpo4Q9ESJ0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,52■■■■□ 3,12
Xpo4Q9ESJ0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,5■■■■□ 3,11
Xpo4Q9ESJ0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Xpo4Q9ESJ0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34,4■■■■□ 3,1
Xpo4Q9ESJ0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34,3■■■■□ 3,08
Xpo4Q9ESJ0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,03
Xpo4Q9ESJ0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Xpo4Q9ESJ0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Xpo4Q9ESJ0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33,87■■■■□ 3,01
Xpo4Q9ESJ0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
Xpo4Q9ESJ0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
Xpo4Q9ESJ0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33,47■■■□□ 2,95
Xpo4Q9ESJ0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,39■■■□□ 2,94
Xpo4Q9ESJ0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,32■■■□□ 2,93
Xpo4Q9ESJ0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,3■■■□□ 2,92
Xpo4Q9ESJ0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33,27■■■□□ 2,92
Xpo4Q9ESJ0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,23■■■□□ 2,91
Xpo4Q9ESJ0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33,22■■■□□ 2,91
Xpo4Q9ESJ0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,9
Xpo4Q9ESJ0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
Xpo4Q9ESJ0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33,06■■■□□ 2,88
Xpo4Q9ESJ0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33,01■■■□□ 2,88
Xpo4Q9ESJ0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,99■■■□□ 2,87
Xpo4Q9ESJ0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
Xpo4Q9ESJ0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,72■■■□□ 2,83
Xpo4Q9ESJ0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32,67■■■□□ 2,82
Xpo4Q9ESJ0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32,65■■■□□ 2,82
Xpo4Q9ESJ0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
Xpo4Q9ESJ0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
Xpo4Q9ESJ0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,59■■■□□ 2,81
Xpo4Q9ESJ0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32,53■■■□□ 2,8
Xpo4Q9ESJ0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32,45■■■□□ 2,78
Xpo4Q9ESJ0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
Xpo4Q9ESJ0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32,37■■■□□ 2,77
Xpo4Q9ESJ0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32,25■■■□□ 2,75
Xpo4Q9ESJ0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
Xpo4Q9ESJ0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
Xpo4Q9ESJ0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
Xpo4Q9ESJ0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,13■■■□□ 2,73
Xpo4Q9ESJ0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,03■■■□□ 2,72
Xpo4Q9ESJ0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32,01■■■□□ 2,71
Xpo4Q9ESJ0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
Xpo4Q9ESJ0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,95■■■□□ 2,71
Xpo4Q9ESJ0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31,93■■■□□ 2,7
Xpo4Q9ESJ0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,88■■■□□ 2,69
Xpo4Q9ESJ0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31,85■■■□□ 2,69
Xpo4Q9ESJ0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,82■■■□□ 2,68
Xpo4Q9ESJ0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,81■■■□□ 2,68
Xpo4Q9ESJ0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,81■■■□□ 2,68
Xpo4Q9ESJ0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31,71■■■□□ 2,67
Xpo4Q9ESJ0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,71■■■□□ 2,67
Xpo4Q9ESJ0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,7■■■□□ 2,66
Xpo4Q9ESJ0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,62■■■□□ 2,65
Xpo4Q9ESJ0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31,62■■■□□ 2,65
Xpo4Q9ESJ0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31,55■■■□□ 2,64
Xpo4Q9ESJ0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
Xpo4Q9ESJ0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31,51■■■□□ 2,63
Xpo4Q9ESJ0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
Xpo4Q9ESJ0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,47■■■□□ 2,63
Xpo4Q9ESJ0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
Xpo4Q9ESJ0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
Xpo4Q9ESJ0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
Xpo4Q9ESJ0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
Xpo4Q9ESJ0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Xpo4Q9ESJ0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Xpo4Q9ESJ0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31,19■■■□□ 2,58
Xpo4Q9ESJ0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,09■■■□□ 2,57
Xpo4Q9ESJ0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Xpo4Q9ESJ0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Xpo4Q9ESJ0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Xpo4Q9ESJ0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,04■■■□□ 2,56
Xpo4Q9ESJ0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,92■■■□□ 2,54
Xpo4Q9ESJ0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Xpo4Q9ESJ0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Xpo4Q9ESJ0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30,85■■■□□ 2,53
Xpo4Q9ESJ0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Xpo4Q9ESJ0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Xpo4Q9ESJ0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Xpo4Q9ESJ0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30,7■■■□□ 2,51
Xpo4Q9ESJ0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Xpo4Q9ESJ0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30,65■■■□□ 2,5
Xpo4Q9ESJ0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Xpo4Q9ESJ0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Xpo4Q9ESJ0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30,61■■■□□ 2,49
Xpo4Q9ESJ0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Xpo4Q9ESJ0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Xpo4Q9ESJ0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Xpo4Q9ESJ0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms