Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC47.66■■■■■ 5.22
Itga6Q61739 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
Itga6Q61739 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
Itga6Q61739 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC41.63■■■■■ 4.25
Itga6Q61739 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
Itga6Q61739 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
Itga6Q61739 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC40.74■■■■■ 4.11
Itga6Q61739 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Itga6Q61739 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Itga6Q61739 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Itga6Q61739 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Itga6Q61739 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC39.78■■■■□ 3.96
Itga6Q61739 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Itga6Q61739 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
Itga6Q61739 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Itga6Q61739 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Itga6Q61739 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
Itga6Q61739 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
Itga6Q61739 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Itga6Q61739 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Itga6Q61739 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Itga6Q61739 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Itga6Q61739 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
Itga6Q61739 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Itga6Q61739 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Itga6Q61739 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.66
Itga6Q61739 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Itga6Q61739 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Itga6Q61739 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Itga6Q61739 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Itga6Q61739 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Itga6Q61739 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
Itga6Q61739 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
Itga6Q61739 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
Itga6Q61739 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Itga6Q61739 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Itga6Q61739 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Itga6Q61739 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
Itga6Q61739 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Itga6Q61739 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Itga6Q61739 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Itga6Q61739 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Itga6Q61739 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Itga6Q61739 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Itga6Q61739 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Itga6Q61739 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
Itga6Q61739 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Itga6Q61739 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Itga6Q61739 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Itga6Q61739 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Itga6Q61739 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Itga6Q61739 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Itga6Q61739 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Itga6Q61739 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
Itga6Q61739 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC36■■■■□ 3.35
Itga6Q61739 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Itga6Q61739 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Itga6Q61739 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Itga6Q61739 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Itga6Q61739 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
Itga6Q61739 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Itga6Q61739 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Itga6Q61739 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Itga6Q61739 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Itga6Q61739 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Itga6Q61739 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Itga6Q61739 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Itga6Q61739 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Itga6Q61739 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Itga6Q61739 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Itga6Q61739 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Itga6Q61739 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Itga6Q61739 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Itga6Q61739 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Itga6Q61739 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Itga6Q61739 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Itga6Q61739 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Itga6Q61739 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Itga6Q61739 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Itga6Q61739 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Itga6Q61739 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Itga6Q61739 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Itga6Q61739 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Itga6Q61739 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Itga6Q61739 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Itga6Q61739 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Itga6Q61739 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Itga6Q61739 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Itga6Q61739 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Itga6Q61739 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Itga6Q61739 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Itga6Q61739 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Itga6Q61739 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Itga6Q61739 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
Itga6Q61739 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Itga6Q61739 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Itga6Q61739 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Itga6Q61739 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Itga6Q61739 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Itga6Q61739 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms