Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC47,66■■■■■ 5,22
Itga6Q61739 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC44,07■■■■■ 4,65
Itga6Q61739 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,44■■■■■ 4,54
Itga6Q61739 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC41,63■■■■■ 4,25
Itga6Q61739 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC41,31■■■■■ 4,2
Itga6Q61739 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,88■■■■■ 4,13
Itga6Q61739 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC40,74■■■■■ 4,11
Itga6Q61739 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,37■■■■■ 4,05
Itga6Q61739 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,23■■■■■ 4,03
Itga6Q61739 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,18■■■■■ 4,02
Itga6Q61739 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC39,95■■■■□ 3,99
Itga6Q61739 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC39,78■■■■□ 3,96
Itga6Q61739 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,58■■■■□ 3,93
Itga6Q61739 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,56■■■■□ 3,92
Itga6Q61739 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,86■■■■□ 3,81
Itga6Q61739 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,71■■■■□ 3,79
Itga6Q61739 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC38,52■■■■□ 3,76
Itga6Q61739 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38,51■■■■□ 3,76
Itga6Q61739 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC38,44■■■■□ 3,74
Itga6Q61739 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,43■■■■□ 3,74
Itga6Q61739 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC38,28■■■■□ 3,72
Itga6Q61739 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,27■■■■□ 3,72
Itga6Q61739 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38,07■■■■□ 3,68
Itga6Q61739 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,97■■■■□ 3,67
Itga6Q61739 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,96■■■■□ 3,67
Itga6Q61739 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,95■■■■□ 3,66
Itga6Q61739 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,91■■■■□ 3,66
Itga6Q61739 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,85■■■■□ 3,65
Itga6Q61739 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,78■■■■□ 3,64
Itga6Q61739 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,73■■■■□ 3,63
Itga6Q61739 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,73■■■■□ 3,63
Itga6Q61739 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37,71■■■■□ 3,63
Itga6Q61739 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC37,63■■■■□ 3,61
Itga6Q61739 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37,59■■■■□ 3,61
Itga6Q61739 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC37,56■■■■□ 3,6
Itga6Q61739 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,48■■■■□ 3,59
Itga6Q61739 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,4■■■■□ 3,58
Itga6Q61739 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3,51
Itga6Q61739 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36,86■■■■□ 3,49
Itga6Q61739 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,76■■■■□ 3,48
Itga6Q61739 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC36,69■■■■□ 3,46
Itga6Q61739 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,68■■■■□ 3,46
Itga6Q61739 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,63■■■■□ 3,45
Itga6Q61739 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC36,59■■■■□ 3,45
Itga6Q61739 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,55■■■■□ 3,44
Itga6Q61739 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC36,49■■■■□ 3,43
Itga6Q61739 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,47■■■■□ 3,43
Itga6Q61739 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC36,43■■■■□ 3,42
Itga6Q61739 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,37■■■■□ 3,41
Itga6Q61739 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36,3■■■■□ 3,4
Itga6Q61739 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC36,24■■■■□ 3,39
Itga6Q61739 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,19■■■■□ 3,38
Itga6Q61739 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,14■■■■□ 3,38
Itga6Q61739 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36,07■■■■□ 3,37
Itga6Q61739 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC36■■■■□ 3,35
Itga6Q61739 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35,97■■■■□ 3,35
Itga6Q61739 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,92■■■■□ 3,34
Itga6Q61739 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,92■■■■□ 3,34
Itga6Q61739 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,87■■■■□ 3,33
Itga6Q61739 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC35,82■■■■□ 3,32
Itga6Q61739 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC35,71■■■■□ 3,31
Itga6Q61739 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35,68■■■■□ 3,3
Itga6Q61739 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35,65■■■■□ 3,3
Itga6Q61739 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,64■■■■□ 3,3
Itga6Q61739 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,59■■■■□ 3,29
Itga6Q61739 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,56■■■■□ 3,28
Itga6Q61739 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,56■■■■□ 3,28
Itga6Q61739 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC35,52■■■■□ 3,28
Itga6Q61739 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC35,44■■■■□ 3,26
Itga6Q61739 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC35,44■■■■□ 3,26
Itga6Q61739 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC35,42■■■■□ 3,26
Itga6Q61739 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,41■■■■□ 3,26
Itga6Q61739 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35,39■■■■□ 3,26
Itga6Q61739 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC35,38■■■■□ 3,25
Itga6Q61739 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,36■■■■□ 3,25
Itga6Q61739 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,35■■■■□ 3,25
Itga6Q61739 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35,35■■■■□ 3,25
Itga6Q61739 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,35■■■■□ 3,25
Itga6Q61739 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC35,31■■■■□ 3,24
Itga6Q61739 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,3■■■■□ 3,24
Itga6Q61739 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC35,25■■■■□ 3,23
Itga6Q61739 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,23■■■■□ 3,23
Itga6Q61739 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,22■■■■□ 3,23
Itga6Q61739 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,22■■■■□ 3,23
Itga6Q61739 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,21■■■■□ 3,23
Itga6Q61739 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,16■■■■□ 3,22
Itga6Q61739 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,12■■■■□ 3,21
Itga6Q61739 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC35,11■■■■□ 3,21
Itga6Q61739 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,1■■■■□ 3,21
Itga6Q61739 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,03■■■■□ 3,2
Itga6Q61739 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,02■■■■□ 3,2
Itga6Q61739 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC35,02■■■■□ 3,2
Itga6Q61739 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34,96■■■■□ 3,19
Itga6Q61739 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC34,94■■■■□ 3,18
Itga6Q61739 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34,93■■■■□ 3,18
Itga6Q61739 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC34,93■■■■□ 3,18
Itga6Q61739 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,93■■■■□ 3,18
Itga6Q61739 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC34,88■■■■□ 3,17
Itga6Q61739 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,84■■■■□ 3,17
Itga6Q61739 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,83■■■■□ 3,17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms