Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG6

Cnot6l, CCR4-NOT transcription complex subunit 6-like, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6lQ8VEG6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44.22■■■■■ 4.67
Cnot6lQ8VEG6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
Cnot6lQ8VEG6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Cnot6lQ8VEG6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Cnot6lQ8VEG6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Cnot6lQ8VEG6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
Cnot6lQ8VEG6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
Cnot6lQ8VEG6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
Cnot6lQ8VEG6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
Cnot6lQ8VEG6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Cnot6lQ8VEG6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Cnot6lQ8VEG6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Cnot6lQ8VEG6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
Cnot6lQ8VEG6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
Cnot6lQ8VEG6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
Cnot6lQ8VEG6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Cnot6lQ8VEG6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Cnot6lQ8VEG6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Cnot6lQ8VEG6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Cnot6lQ8VEG6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Cnot6lQ8VEG6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Cnot6lQ8VEG6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Cnot6lQ8VEG6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Cnot6lQ8VEG6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Cnot6lQ8VEG6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Cnot6lQ8VEG6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Cnot6lQ8VEG6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Cnot6lQ8VEG6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Cnot6lQ8VEG6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Cnot6lQ8VEG6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Cnot6lQ8VEG6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Cnot6lQ8VEG6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Cnot6lQ8VEG6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Cnot6lQ8VEG6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Cnot6lQ8VEG6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Cnot6lQ8VEG6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Cnot6lQ8VEG6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Cnot6lQ8VEG6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Cnot6lQ8VEG6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Cnot6lQ8VEG6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Cnot6lQ8VEG6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Cnot6lQ8VEG6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Cnot6lQ8VEG6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Cnot6lQ8VEG6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Cnot6lQ8VEG6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Cnot6lQ8VEG6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Cnot6lQ8VEG6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Cnot6lQ8VEG6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cnot6lQ8VEG6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Cnot6lQ8VEG6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Cnot6lQ8VEG6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Cnot6lQ8VEG6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Cnot6lQ8VEG6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Cnot6lQ8VEG6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cnot6lQ8VEG6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Cnot6lQ8VEG6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cnot6lQ8VEG6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Cnot6lQ8VEG6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cnot6lQ8VEG6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cnot6lQ8VEG6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cnot6lQ8VEG6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cnot6lQ8VEG6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Cnot6lQ8VEG6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
Cnot6lQ8VEG6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Cnot6lQ8VEG6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cnot6lQ8VEG6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Cnot6lQ8VEG6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Cnot6lQ8VEG6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cnot6lQ8VEG6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cnot6lQ8VEG6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Cnot6lQ8VEG6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cnot6lQ8VEG6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Cnot6lQ8VEG6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Cnot6lQ8VEG6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cnot6lQ8VEG6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cnot6lQ8VEG6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cnot6lQ8VEG6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cnot6lQ8VEG6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cnot6lQ8VEG6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Cnot6lQ8VEG6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Cnot6lQ8VEG6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
Cnot6lQ8VEG6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Cnot6lQ8VEG6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cnot6lQ8VEG6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Cnot6lQ8VEG6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Cnot6lQ8VEG6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cnot6lQ8VEG6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cnot6lQ8VEG6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cnot6lQ8VEG6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cnot6lQ8VEG6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cnot6lQ8VEG6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cnot6lQ8VEG6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Cnot6lQ8VEG6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Cnot6lQ8VEG6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Cnot6lQ8VEG6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Cnot6lQ8VEG6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Cnot6lQ8VEG6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Cnot6lQ8VEG6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Cnot6lQ8VEG6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Cnot6lQ8VEG6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms