Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZT6

Zkscan4, MCG23028, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan4Q5SZT6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Zkscan4Q5SZT6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
Zkscan4Q5SZT6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Zkscan4Q5SZT6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Zkscan4Q5SZT6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Zkscan4Q5SZT6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Zkscan4Q5SZT6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Zkscan4Q5SZT6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Zkscan4Q5SZT6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Zkscan4Q5SZT6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Zkscan4Q5SZT6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Zkscan4Q5SZT6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Zkscan4Q5SZT6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Zkscan4Q5SZT6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Zkscan4Q5SZT6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Zkscan4Q5SZT6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Zkscan4Q5SZT6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Zkscan4Q5SZT6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Zkscan4Q5SZT6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Zkscan4Q5SZT6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Zkscan4Q5SZT6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Zkscan4Q5SZT6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Zkscan4Q5SZT6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Zkscan4Q5SZT6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Zkscan4Q5SZT6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Zkscan4Q5SZT6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Zkscan4Q5SZT6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Zkscan4Q5SZT6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Zkscan4Q5SZT6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Zkscan4Q5SZT6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Zkscan4Q5SZT6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Zkscan4Q5SZT6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Zkscan4Q5SZT6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
Zkscan4Q5SZT6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Zkscan4Q5SZT6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Zkscan4Q5SZT6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Zkscan4Q5SZT6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Zkscan4Q5SZT6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Zkscan4Q5SZT6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Zkscan4Q5SZT6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Zkscan4Q5SZT6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Zkscan4Q5SZT6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Zkscan4Q5SZT6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Zkscan4Q5SZT6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
Zkscan4Q5SZT6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Zkscan4Q5SZT6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Zkscan4Q5SZT6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Zkscan4Q5SZT6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Zkscan4Q5SZT6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Zkscan4Q5SZT6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Zkscan4Q5SZT6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Zkscan4Q5SZT6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Zkscan4Q5SZT6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Zkscan4Q5SZT6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Zkscan4Q5SZT6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Zkscan4Q5SZT6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Zkscan4Q5SZT6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Zkscan4Q5SZT6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Zkscan4Q5SZT6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Zkscan4Q5SZT6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Zkscan4Q5SZT6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Zkscan4Q5SZT6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Zkscan4Q5SZT6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Zkscan4Q5SZT6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Zkscan4Q5SZT6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Zkscan4Q5SZT6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Zkscan4Q5SZT6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
Zkscan4Q5SZT6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Zkscan4Q5SZT6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Zkscan4Q5SZT6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Zkscan4Q5SZT6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Zkscan4Q5SZT6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Zkscan4Q5SZT6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Zkscan4Q5SZT6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Zkscan4Q5SZT6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Zkscan4Q5SZT6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Zkscan4Q5SZT6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Zkscan4Q5SZT6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Zkscan4Q5SZT6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Zkscan4Q5SZT6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Zkscan4Q5SZT6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Zkscan4Q5SZT6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Zkscan4Q5SZT6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Zkscan4Q5SZT6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Zkscan4Q5SZT6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Zkscan4Q5SZT6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Zkscan4Q5SZT6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Zkscan4Q5SZT6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Zkscan4Q5SZT6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Zkscan4Q5SZT6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Zkscan4Q5SZT6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Zkscan4Q5SZT6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Zkscan4Q5SZT6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Zkscan4Q5SZT6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Zkscan4Q5SZT6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Zkscan4Q5SZT6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Zkscan4Q5SZT6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Zkscan4Q5SZT6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Zkscan4Q5SZT6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Zkscan4Q5SZT6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
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