Protein–RNA interactions for Protein: Q66X03

Nlrp9a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9aQ66X03 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC46.19■■■■■ 4.98
Nlrp9aQ66X03 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
Nlrp9aQ66X03 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
Nlrp9aQ66X03 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Nlrp9aQ66X03 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC40.53■■■■■ 4.08
Nlrp9aQ66X03 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
Nlrp9aQ66X03 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Nlrp9aQ66X03 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
Nlrp9aQ66X03 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
Nlrp9aQ66X03 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Nlrp9aQ66X03 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Nlrp9aQ66X03 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Nlrp9aQ66X03 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
Nlrp9aQ66X03 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Nlrp9aQ66X03 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Nlrp9aQ66X03 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
Nlrp9aQ66X03 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Nlrp9aQ66X03 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Nlrp9aQ66X03 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Nlrp9aQ66X03 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
Nlrp9aQ66X03 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Nlrp9aQ66X03 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Nlrp9aQ66X03 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Nlrp9aQ66X03 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Nlrp9aQ66X03 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Nlrp9aQ66X03 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Nlrp9aQ66X03 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
Nlrp9aQ66X03 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
Nlrp9aQ66X03 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Nlrp9aQ66X03 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Nlrp9aQ66X03 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Nlrp9aQ66X03 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Nlrp9aQ66X03 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Nlrp9aQ66X03 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Nlrp9aQ66X03 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Nlrp9aQ66X03 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Nlrp9aQ66X03 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Nlrp9aQ66X03 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Nlrp9aQ66X03 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Nlrp9aQ66X03 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Nlrp9aQ66X03 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Nlrp9aQ66X03 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Nlrp9aQ66X03 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Nlrp9aQ66X03 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Nlrp9aQ66X03 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Nlrp9aQ66X03 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Nlrp9aQ66X03 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Nlrp9aQ66X03 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Nlrp9aQ66X03 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Nlrp9aQ66X03 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
Nlrp9aQ66X03 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Nlrp9aQ66X03 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Nlrp9aQ66X03 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Nlrp9aQ66X03 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Nlrp9aQ66X03 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Nlrp9aQ66X03 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Nlrp9aQ66X03 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Nlrp9aQ66X03 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Nlrp9aQ66X03 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Nlrp9aQ66X03 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Nlrp9aQ66X03 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Nlrp9aQ66X03 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Nlrp9aQ66X03 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Nlrp9aQ66X03 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
Nlrp9aQ66X03 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Nlrp9aQ66X03 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Nlrp9aQ66X03 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Nlrp9aQ66X03 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Nlrp9aQ66X03 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Nlrp9aQ66X03 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Nlrp9aQ66X03 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Nlrp9aQ66X03 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Nlrp9aQ66X03 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
Nlrp9aQ66X03 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Nlrp9aQ66X03 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
Nlrp9aQ66X03 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Nlrp9aQ66X03 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Nlrp9aQ66X03 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Nlrp9aQ66X03 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Nlrp9aQ66X03 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
Nlrp9aQ66X03 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Nlrp9aQ66X03 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Nlrp9aQ66X03 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Nlrp9aQ66X03 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Nlrp9aQ66X03 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Nlrp9aQ66X03 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Nlrp9aQ66X03 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Nlrp9aQ66X03 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Nlrp9aQ66X03 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Nlrp9aQ66X03 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Nlrp9aQ66X03 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Nlrp9aQ66X03 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Nlrp9aQ66X03 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Nlrp9aQ66X03 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Nlrp9aQ66X03 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Nlrp9aQ66X03 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Nlrp9aQ66X03 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Nlrp9aQ66X03 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Nlrp9aQ66X03 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Nlrp9aQ66X03 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms