Protein–RNA interactions for Protein: Q66X03

Nlrp9a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9aQ66X03 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC46,19■■■■■ 4,98
Nlrp9aQ66X03 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42,62■■■■■ 4,41
Nlrp9aQ66X03 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,04■■■■■ 4,32
Nlrp9aQ66X03 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,64■■■■■ 4,1
Nlrp9aQ66X03 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC40,53■■■■■ 4,08
Nlrp9aQ66X03 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39,96■■■■□ 3,99
Nlrp9aQ66X03 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,83■■■■□ 3,97
Nlrp9aQ66X03 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39,7■■■■□ 3,95
Nlrp9aQ66X03 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,31■■■■□ 3,88
Nlrp9aQ66X03 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,23■■■■□ 3,87
Nlrp9aQ66X03 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,98■■■■□ 3,83
Nlrp9aQ66X03 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38,64■■■■□ 3,78
Nlrp9aQ66X03 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38,58■■■■□ 3,77
Nlrp9aQ66X03 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,38■■■■□ 3,73
Nlrp9aQ66X03 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,28■■■■□ 3,72
Nlrp9aQ66X03 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37,93■■■■□ 3,66
Nlrp9aQ66X03 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,82■■■■□ 3,64
Nlrp9aQ66X03 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,65■■■■□ 3,62
Nlrp9aQ66X03 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,54■■■■□ 3,6
Nlrp9aQ66X03 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37,49■■■■□ 3,59
Nlrp9aQ66X03 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,44■■■■□ 3,58
Nlrp9aQ66X03 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37,4■■■■□ 3,58
Nlrp9aQ66X03 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,37■■■■□ 3,57
Nlrp9aQ66X03 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,31■■■■□ 3,56
Nlrp9aQ66X03 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,25■■■■□ 3,55
Nlrp9aQ66X03 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,21■■■■□ 3,55
Nlrp9aQ66X03 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37,19■■■■□ 3,54
Nlrp9aQ66X03 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37,09■■■■□ 3,53
Nlrp9aQ66X03 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36,99■■■■□ 3,51
Nlrp9aQ66X03 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,94■■■■□ 3,5
Nlrp9aQ66X03 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36,72■■■■□ 3,47
Nlrp9aQ66X03 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,55■■■■□ 3,44
Nlrp9aQ66X03 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,55■■■■□ 3,44
Nlrp9aQ66X03 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,54■■■■□ 3,44
Nlrp9aQ66X03 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36,47■■■■□ 3,43
Nlrp9aQ66X03 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36,42■■■■□ 3,42
Nlrp9aQ66X03 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,41■■■■□ 3,42
Nlrp9aQ66X03 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,34■■■■□ 3,41
Nlrp9aQ66X03 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36,33■■■■□ 3,41
Nlrp9aQ66X03 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,21■■■■□ 3,39
Nlrp9aQ66X03 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,05■■■■□ 3,36
Nlrp9aQ66X03 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,03■■■■□ 3,36
Nlrp9aQ66X03 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,8■■■■□ 3,32
Nlrp9aQ66X03 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35,78■■■■□ 3,32
Nlrp9aQ66X03 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,72■■■■□ 3,31
Nlrp9aQ66X03 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35,69■■■■□ 3,3
Nlrp9aQ66X03 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,68■■■■□ 3,3
Nlrp9aQ66X03 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35,63■■■■□ 3,29
Nlrp9aQ66X03 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,6■■■■□ 3,29
Nlrp9aQ66X03 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35,58■■■■□ 3,29
Nlrp9aQ66X03 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35,52■■■■□ 3,28
Nlrp9aQ66X03 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,44■■■■□ 3,26
Nlrp9aQ66X03 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35,36■■■■□ 3,25
Nlrp9aQ66X03 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,3■■■■□ 3,24
Nlrp9aQ66X03 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35,3■■■■□ 3,24
Nlrp9aQ66X03 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35,23■■■■□ 3,23
Nlrp9aQ66X03 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35,18■■■■□ 3,22
Nlrp9aQ66X03 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,17■■■■□ 3,22
Nlrp9aQ66X03 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35,17■■■■□ 3,22
Nlrp9aQ66X03 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,03■■■■□ 3,2
Nlrp9aQ66X03 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,01■■■■□ 3,2
Nlrp9aQ66X03 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34,99■■■■□ 3,19
Nlrp9aQ66X03 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,94■■■■□ 3,18
Nlrp9aQ66X03 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34,94■■■■□ 3,18
Nlrp9aQ66X03 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,91■■■■□ 3,18
Nlrp9aQ66X03 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,88■■■■□ 3,17
Nlrp9aQ66X03 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,86■■■■□ 3,17
Nlrp9aQ66X03 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,85■■■■□ 3,17
Nlrp9aQ66X03 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,83■■■■□ 3,17
Nlrp9aQ66X03 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,81■■■■□ 3,16
Nlrp9aQ66X03 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34,81■■■■□ 3,16
Nlrp9aQ66X03 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,79■■■■□ 3,16
Nlrp9aQ66X03 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34,79■■■■□ 3,16
Nlrp9aQ66X03 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,77■■■■□ 3,16
Nlrp9aQ66X03 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34,75■■■■□ 3,15
Nlrp9aQ66X03 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,68■■■■□ 3,14
Nlrp9aQ66X03 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34,66■■■■□ 3,14
Nlrp9aQ66X03 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34,63■■■■□ 3,13
Nlrp9aQ66X03 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,55■■■■□ 3,12
Nlrp9aQ66X03 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34,53■■■■□ 3,12
Nlrp9aQ66X03 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34,48■■■■□ 3,11
Nlrp9aQ66X03 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34,47■■■■□ 3,11
Nlrp9aQ66X03 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,46■■■■□ 3,11
Nlrp9aQ66X03 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34,45■■■■□ 3,11
Nlrp9aQ66X03 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34,35■■■■□ 3,09
Nlrp9aQ66X03 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,29■■■■□ 3,08
Nlrp9aQ66X03 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,28■■■■□ 3,08
Nlrp9aQ66X03 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Nlrp9aQ66X03 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Nlrp9aQ66X03 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34,21■■■■□ 3,07
Nlrp9aQ66X03 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34,18■■■■□ 3,06
Nlrp9aQ66X03 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
Nlrp9aQ66X03 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,11■■■■□ 3,05
Nlrp9aQ66X03 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Nlrp9aQ66X03 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Nlrp9aQ66X03 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34,03■■■■□ 3,04
Nlrp9aQ66X03 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
Nlrp9aQ66X03 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,91■■■■□ 3,02
Nlrp9aQ66X03 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33,89■■■■□ 3,02
Nlrp9aQ66X03 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33,89■■■■□ 3,02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms