Protein–RNA interactions for Protein: Q3U829

Ap5z1, AP-5 complex subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5z1Q3U829 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42.09■■■■■ 4.33
Ap5z1Q3U829 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Ap5z1Q3U829 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Ap5z1Q3U829 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Ap5z1Q3U829 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
Ap5z1Q3U829 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ap5z1Q3U829 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
Ap5z1Q3U829 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Ap5z1Q3U829 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ap5z1Q3U829 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
Ap5z1Q3U829 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Ap5z1Q3U829 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Ap5z1Q3U829 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Ap5z1Q3U829 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Ap5z1Q3U829 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
Ap5z1Q3U829 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
Ap5z1Q3U829 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ap5z1Q3U829 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Ap5z1Q3U829 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Ap5z1Q3U829 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Ap5z1Q3U829 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ap5z1Q3U829 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ap5z1Q3U829 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ap5z1Q3U829 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ap5z1Q3U829 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ap5z1Q3U829 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ap5z1Q3U829 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ap5z1Q3U829 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ap5z1Q3U829 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ap5z1Q3U829 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ap5z1Q3U829 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ap5z1Q3U829 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ap5z1Q3U829 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ap5z1Q3U829 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ap5z1Q3U829 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ap5z1Q3U829 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ap5z1Q3U829 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ap5z1Q3U829 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Ap5z1Q3U829 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ap5z1Q3U829 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Ap5z1Q3U829 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ap5z1Q3U829 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ap5z1Q3U829 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ap5z1Q3U829 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ap5z1Q3U829 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ap5z1Q3U829 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ap5z1Q3U829 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ap5z1Q3U829 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ap5z1Q3U829 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ap5z1Q3U829 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ap5z1Q3U829 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ap5z1Q3U829 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Ap5z1Q3U829 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ap5z1Q3U829 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ap5z1Q3U829 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Ap5z1Q3U829 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ap5z1Q3U829 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Ap5z1Q3U829 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ap5z1Q3U829 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Ap5z1Q3U829 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ap5z1Q3U829 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ap5z1Q3U829 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ap5z1Q3U829 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ap5z1Q3U829 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ap5z1Q3U829 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ap5z1Q3U829 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Ap5z1Q3U829 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ap5z1Q3U829 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Ap5z1Q3U829 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
Ap5z1Q3U829 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ap5z1Q3U829 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ap5z1Q3U829 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ap5z1Q3U829 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Ap5z1Q3U829 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
Ap5z1Q3U829 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Ap5z1Q3U829 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ap5z1Q3U829 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Ap5z1Q3U829 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ap5z1Q3U829 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ap5z1Q3U829 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ap5z1Q3U829 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ap5z1Q3U829 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ap5z1Q3U829 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ap5z1Q3U829 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
Ap5z1Q3U829 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ap5z1Q3U829 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Ap5z1Q3U829 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Ap5z1Q3U829 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ap5z1Q3U829 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ap5z1Q3U829 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ap5z1Q3U829 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ap5z1Q3U829 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ap5z1Q3U829 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ap5z1Q3U829 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ap5z1Q3U829 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ap5z1Q3U829 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ap5z1Q3U829 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ap5z1Q3U829 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ap5z1Q3U829 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ap5z1Q3U829 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms