Protein–RNA interactions for Protein: Q3U829

Ap5z1, AP-5 complex subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5z1Q3U829 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42,09■■■■■ 4,33
Ap5z1Q3U829 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39,15■■■■□ 3,86
Ap5z1Q3U829 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,63■■■■□ 3,77
Ap5z1Q3U829 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,89■■■■□ 3,66
Ap5z1Q3U829 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36,74■■■■□ 3,47
Ap5z1Q3U829 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,43■■■■□ 3,42
Ap5z1Q3U829 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36,29■■■■□ 3,4
Ap5z1Q3U829 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,39
Ap5z1Q3U829 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,96■■■■□ 3,35
Ap5z1Q3U829 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35,73■■■■□ 3,31
Ap5z1Q3U829 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35,71■■■■□ 3,31
Ap5z1Q3U829 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,59■■■■□ 3,29
Ap5z1Q3U829 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,48■■■■□ 3,27
Ap5z1Q3U829 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,47■■■■□ 3,27
Ap5z1Q3U829 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35,32■■■■□ 3,24
Ap5z1Q3U829 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35,15■■■■□ 3,22
Ap5z1Q3U829 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,94■■■■□ 3,18
Ap5z1Q3U829 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34,42■■■■□ 3,1
Ap5z1Q3U829 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,34■■■■□ 3,09
Ap5z1Q3U829 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,08
Ap5z1Q3U829 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34,19■■■■□ 3,06
Ap5z1Q3U829 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Ap5z1Q3U829 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Ap5z1Q3U829 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34,02■■■■□ 3,04
Ap5z1Q3U829 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
Ap5z1Q3U829 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
Ap5z1Q3U829 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,81■■■■□ 3
Ap5z1Q3U829 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,74■■■□□ 2,99
Ap5z1Q3U829 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,73■■■□□ 2,99
Ap5z1Q3U829 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33,65■■■□□ 2,98
Ap5z1Q3U829 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33,54■■■□□ 2,96
Ap5z1Q3U829 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
Ap5z1Q3U829 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,53■■■□□ 2,96
Ap5z1Q3U829 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,53■■■□□ 2,96
Ap5z1Q3U829 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,49■■■□□ 2,95
Ap5z1Q3U829 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,45■■■□□ 2,95
Ap5z1Q3U829 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33,42■■■□□ 2,94
Ap5z1Q3U829 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33,35■■■□□ 2,93
Ap5z1Q3U829 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
Ap5z1Q3U829 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32,99■■■□□ 2,87
Ap5z1Q3U829 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32,8■■■□□ 2,84
Ap5z1Q3U829 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
Ap5z1Q3U829 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
Ap5z1Q3U829 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,72■■■□□ 2,83
Ap5z1Q3U829 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Ap5z1Q3U829 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
Ap5z1Q3U829 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,63■■■□□ 2,81
Ap5z1Q3U829 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
Ap5z1Q3U829 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,56■■■□□ 2,8
Ap5z1Q3U829 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,46■■■□□ 2,79
Ap5z1Q3U829 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Ap5z1Q3U829 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,36■■■□□ 2,77
Ap5z1Q3U829 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32,35■■■□□ 2,77
Ap5z1Q3U829 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32,35■■■□□ 2,77
Ap5z1Q3U829 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32,34■■■□□ 2,77
Ap5z1Q3U829 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32,34■■■□□ 2,77
Ap5z1Q3U829 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32,26■■■□□ 2,75
Ap5z1Q3U829 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,23■■■□□ 2,75
Ap5z1Q3U829 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32,18■■■□□ 2,74
Ap5z1Q3U829 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
Ap5z1Q3U829 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
Ap5z1Q3U829 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,06■■■□□ 2,72
Ap5z1Q3U829 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,05■■■□□ 2,72
Ap5z1Q3U829 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
Ap5z1Q3U829 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,03■■■□□ 2,72
Ap5z1Q3U829 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
Ap5z1Q3U829 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31,97■■■□□ 2,71
Ap5z1Q3U829 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31,93■■■□□ 2,7
Ap5z1Q3U829 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31,83■■■□□ 2,69
Ap5z1Q3U829 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
Ap5z1Q3U829 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31,8■■■□□ 2,68
Ap5z1Q3U829 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
Ap5z1Q3U829 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31,79■■■□□ 2,68
Ap5z1Q3U829 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31,76■■■□□ 2,67
Ap5z1Q3U829 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31,74■■■□□ 2,67
Ap5z1Q3U829 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31,74■■■□□ 2,67
Ap5z1Q3U829 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31,69■■■□□ 2,66
Ap5z1Q3U829 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,67■■■□□ 2,66
Ap5z1Q3U829 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Ap5z1Q3U829 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
Ap5z1Q3U829 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,55■■■□□ 2,64
Ap5z1Q3U829 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,55■■■□□ 2,64
Ap5z1Q3U829 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,63
Ap5z1Q3U829 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31,51■■■□□ 2,63
Ap5z1Q3U829 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31,5■■■□□ 2,63
Ap5z1Q3U829 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,62
Ap5z1Q3U829 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31,43■■■□□ 2,62
Ap5z1Q3U829 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,42■■■□□ 2,62
Ap5z1Q3U829 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Ap5z1Q3U829 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
Ap5z1Q3U829 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
Ap5z1Q3U829 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Ap5z1Q3U829 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Ap5z1Q3U829 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Ap5z1Q3U829 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31,16■■■□□ 2,58
Ap5z1Q3U829 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,15■■■□□ 2,58
Ap5z1Q3U829 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Ap5z1Q3U829 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC31,05■■■□□ 2,56
Ap5z1Q3U829 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30,98■■■□□ 2,55
Ap5z1Q3U829 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,8 ms