Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC45.91■■■■■ 4.94
Nbr1P97432 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
Nbr1P97432 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Nbr1P97432 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
Nbr1P97432 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39.58■■■■□ 3.93
Nbr1P97432 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Nbr1P97432 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Nbr1P97432 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Nbr1P97432 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Nbr1P97432 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
Nbr1P97432 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
Nbr1P97432 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Nbr1P97432 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
Nbr1P97432 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Nbr1P97432 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Nbr1P97432 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Nbr1P97432 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Nbr1P97432 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Nbr1P97432 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Nbr1P97432 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Nbr1P97432 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Nbr1P97432 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Nbr1P97432 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Nbr1P97432 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Nbr1P97432 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Nbr1P97432 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
Nbr1P97432 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Nbr1P97432 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Nbr1P97432 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Nbr1P97432 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Nbr1P97432 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Nbr1P97432 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Nbr1P97432 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Nbr1P97432 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Nbr1P97432 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Nbr1P97432 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Nbr1P97432 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Nbr1P97432 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
Nbr1P97432 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Nbr1P97432 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Nbr1P97432 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Nbr1P97432 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Nbr1P97432 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Nbr1P97432 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Nbr1P97432 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Nbr1P97432 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Nbr1P97432 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Nbr1P97432 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Nbr1P97432 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Nbr1P97432 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Nbr1P97432 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Nbr1P97432 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
Nbr1P97432 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Nbr1P97432 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Nbr1P97432 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Nbr1P97432 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Nbr1P97432 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Nbr1P97432 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Nbr1P97432 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Nbr1P97432 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Nbr1P97432 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Nbr1P97432 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Nbr1P97432 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Nbr1P97432 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Nbr1P97432 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Nbr1P97432 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Nbr1P97432 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Nbr1P97432 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Nbr1P97432 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
Nbr1P97432 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
Nbr1P97432 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Nbr1P97432 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Nbr1P97432 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Nbr1P97432 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Nbr1P97432 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Nbr1P97432 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Nbr1P97432 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Nbr1P97432 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Nbr1P97432 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Nbr1P97432 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Nbr1P97432 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Nbr1P97432 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Nbr1P97432 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Nbr1P97432 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Nbr1P97432 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Nbr1P97432 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Nbr1P97432 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Nbr1P97432 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Nbr1P97432 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Nbr1P97432 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Nbr1P97432 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Nbr1P97432 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Nbr1P97432 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Nbr1P97432 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Nbr1P97432 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Nbr1P97432 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Nbr1P97432 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Nbr1P97432 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Nbr1P97432 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Nbr1P97432 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms