Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,69■■■■□ 3,46
Cbx1P83917 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,4■■■■□ 3,42
Cbx1P83917 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,7■■■■□ 3,31
Cbx1P83917 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,22■■■■□ 3,23
Cbx1P83917 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34,92■■■■□ 3,18
Cbx1P83917 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,75■■■■□ 3,15
Cbx1P83917 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,41■■■□□ 2,94
Cbx1P83917 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
Cbx1P83917 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33,23■■■□□ 2,91
Cbx1P83917 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Cbx1P83917 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
Cbx1P83917 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,87
Cbx1P83917 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32,82■■■□□ 2,84
Cbx1P83917 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,76■■■□□ 2,84
Cbx1P83917 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,71■■■□□ 2,83
Cbx1P83917 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,68■■■□□ 2,82
Cbx1P83917 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,64■■■□□ 2,82
Cbx1P83917 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32,64■■■□□ 2,82
Cbx1P83917 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Cbx1P83917 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,45■■■□□ 2,79
Cbx1P83917 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,36■■■□□ 2,77
Cbx1P83917 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32,12■■■□□ 2,73
Cbx1P83917 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,94■■■□□ 2,7
Cbx1P83917 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31,94■■■□□ 2,7
Cbx1P83917 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,9■■■□□ 2,7
Cbx1P83917 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
Cbx1P83917 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31,62■■■□□ 2,65
Cbx1P83917 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
Cbx1P83917 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC31,47■■■□□ 2,63
Cbx1P83917 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
Cbx1P83917 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Cbx1P83917 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31,31■■■□□ 2,6
Cbx1P83917 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Cbx1P83917 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,1■■■□□ 2,57
Cbx1P83917 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Cbx1P83917 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,04■■■□□ 2,56
Cbx1P83917 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Cbx1P83917 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,55
Cbx1P83917 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Cbx1P83917 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30,86■■■□□ 2,53
Cbx1P83917 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Cbx1P83917 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30,7■■■□□ 2,51
Cbx1P83917 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,69■■■□□ 2,5
Cbx1P83917 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
Cbx1P83917 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Cbx1P83917 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC30,64■■■□□ 2,49
Cbx1P83917 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Cbx1P83917 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Cbx1P83917 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30,47■■■□□ 2,47
Cbx1P83917 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,44■■■□□ 2,46
Cbx1P83917 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Cbx1P83917 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Cbx1P83917 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Cbx1P83917 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Cbx1P83917 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30,2■■■□□ 2,43
Cbx1P83917 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Cbx1P83917 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,17■■■□□ 2,42
Cbx1P83917 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30,17■■■□□ 2,42
Cbx1P83917 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30,15■■■□□ 2,42
Cbx1P83917 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Cbx1P83917 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,41
Cbx1P83917 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Cbx1P83917 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Cbx1P83917 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Cbx1P83917 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Cbx1P83917 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Cbx1P83917 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Cbx1P83917 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Cbx1P83917 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29,82■■■□□ 2,36
Cbx1P83917 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Cbx1P83917 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Cbx1P83917 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
Cbx1P83917 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Cbx1P83917 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Cbx1P83917 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Cbx1P83917 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Cbx1P83917 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Cbx1P83917 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Cbx1P83917 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Cbx1P83917 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,6■■■□□ 2,33
Cbx1P83917 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29,53■■■□□ 2,32
Cbx1P83917 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Cbx1P83917 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Cbx1P83917 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29,48■■■□□ 2,31
Cbx1P83917 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,46■■■□□ 2,31
Cbx1P83917 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,3
Cbx1P83917 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,3
Cbx1P83917 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Cbx1P83917 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Cbx1P83917 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Cbx1P83917 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Cbx1P83917 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Cbx1P83917 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Cbx1P83917 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Cbx1P83917 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Cbx1P83917 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29,26■■■□□ 2,27
Cbx1P83917 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Cbx1P83917 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Cbx1P83917 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Cbx1P83917 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms