RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000034876.9

Tspan3-201, Transcript of Tetraspanin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Tspan3, Length 1,716 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Pkp1P97350 728 aaKnown RBP30.64■■■□□ 2.5
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Fam83bQ0VBM2 1012 aa30.63■■■□□ 2.49
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Olfm5Q8BU90 496 aa30.63■■■□□ 2.49
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Tbc1d7Q9D0K0 293 aa30.63■■■□□ 2.49
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Dmrtc1Q9D9R7 182 aa30.63■■■□□ 2.49
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Carmil3Q3UFQ8 1375 aa30.63■■■□□ 2.49
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Krt24A1L317 512 aa30.62■■■□□ 2.49
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Frmd7A2AD83 703 aa30.62■■■□□ 2.49
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Rsph3aQ3UFY4 516 aa30.62■■■□□ 2.49
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Krt40Q6IFX3 439 aa30.62■■■□□ 2.49
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Alx1Q8C8B0 326 aa30.62■■■□□ 2.49
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Tceanc2Q8R2M0 207 aa30.62■■■□□ 2.49
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Mast3Q3U214 1321 aa30.62■■■□□ 2.49
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Fbxl16A2RT62 479 aa30.61■■■□□ 2.49
Tspan3-201ENSMUST00000034876 1700006A11RikB9EHI3 544 aa30.61■■■□□ 2.49
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Spg7Q3ULF4 781 aa30.61■■■□□ 2.49
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Best3Q6H1V1 669 aa30.61■■■□□ 2.49
Tspan3-201ENSMUST00000034876 WaslQ91YD9 501 aa30.61■■■□□ 2.49
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Usp42B2RQC2 1324 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Siah1aP61092 282 aa30.61■■■□□ 2.49
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Cyp24a1Q64441 514 aa30.61■■■□□ 2.49
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Kcnq3Q8K3F6 873 aa30.61■■■□□ 2.49
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Pof1bQ8K4L4 587 aa30.61■■■□□ 2.49
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Gdf11Q9Z1W4 405 aa30.61■■■□□ 2.49
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ercc3P49135 783 aa30.6■■■□□ 2.49
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Hand2Q61039 217 aa30.6■■■□□ 2.49
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ccdc158Q8CDI6 1109 aa30.6■■■□□ 2.49
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Spty2d1Q68FG3 682 aa30.59■■■□□ 2.49
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Myh13B1AR69 1938 aa30.59■■■□□ 2.49
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Mtcl1Q3UHU5 1945 aa30.59■■■□□ 2.49
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Cfap69Q8BH53 942 aa30.59■■■□□ 2.49
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Mrpl50Q8VDT9 159 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
Tspan3-201ENSMUST00000034876 NsmfQ99NF2 532 aa30.59■■■□□ 2.49
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Cyp2ab1S4R196 498 aa30.59■■■□□ 2.49
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ddx19aQ61655 478 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
Tspan3-201ENSMUST00000034876 CrcpO35427 148 aa30.57■■■□□ 2.48
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Shisa4Q8CA71 197 aa30.57■■■□□ 2.48
Tspan3-201ENSMUST00000034876 ImmtQ8CAQ8 757 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
Tspan3-201ENSMUST00000034876 SfswapQ3USH5 945 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
Tspan3-201ENSMUST00000034876 RarsQ9D0I9 660 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Cxcl11Q9JHH5 100 aa30.56■■■□□ 2.48
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Elmsan1E9Q2I4 1089 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Htatsf1Q8BGC0 757 aa30.56■■■□□ 2.48
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Zkscan1Q8BGS3 561 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Pold4Q9CWP8 107 aa30.56■■■□□ 2.48
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Atad2Q8CDM1 1040 aa30.55■■■□□ 2.48
Tspan3-201ENSMUST00000034876 OscarQ8VBT3 265 aa30.55■■■□□ 2.48
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ces1dQ8VCT4 565 aa30.55■■■□□ 2.48
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Tbc1d8Q9Z1A9 1134 aa30.55■■■□□ 2.48
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Syt1P46096 421 aa30.54■■■□□ 2.48
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Tango6Q8C3S2 1079 aa30.54■■■□□ 2.48
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Slc4a4O88343 1079 aa30.53■■■□□ 2.48
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Csrnp1P59054 583 aa30.53■■■□□ 2.48
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Gm21985Q6P6P5 1106 aa30.53■■■□□ 2.48
Tspan3-201ENSMUST00000034876 PnnO35691 725 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Gnat2P50149 354 aa30.52■■■□□ 2.48
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Rbm43Q99J64 343 aa30.52■■■□□ 2.48
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Atp2b4Q6Q477 1205 aa30.51■■■□□ 2.47
Tspan3-201ENSMUST00000034876 NapbP28663 298 aa30.5■■■□□ 2.47
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Dynll1P63168 89 aa30.5■■■□□ 2.47
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Kif22Q3V300 660 aa30.5■■■□□ 2.47
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Acap3Q6NXL5 833 aa30.5■■■□□ 2.47
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Cnot6lQ8VEG6 555 aa30.5■■■□□ 2.47
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Gdpd2Q9ESM6 539 aa30.5■■■□□ 2.47
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Exosc10P56960 887 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Kif20aP97329 887 aa30.5■■■□□ 2.47
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Trmt44Q9D2Q2 713 aa30.5■■■□□ 2.47
Tspan3-201ENSMUST00000034876 FAM186AQ9D9R9 1790 aa30.49■■■□□ 2.47
Tspan3-201ENSMUST00000034876 WdpcpQ8C456 722 aa30.49■■■□□ 2.47
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Lmnb1P14733 588 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Atp6v1aP50516 617 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Chrna5Q2MKA5 467 aa30.48■■■□□ 2.47
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Zfp831A2ADM8 1628 aa30.48■■■□□ 2.47
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Cyp2d34L7N463 504 aa30.47■■■□□ 2.47
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Agtpbp1Q641K1 1218 aa30.47■■■□□ 2.47
Tspan3-201ENSMUST00000034876 St18Q80TY4 1045 aa30.47■■■□□ 2.47
Tspan3-201ENSMUST00000034876 IarsQ8BU30 1262 aa30.47■■■□□ 2.47
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Slc51aQ8R000 340 aa30.47■■■□□ 2.47
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Trpc5Q9QX29 975 aa30.47■■■□□ 2.47
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Gm29094F6Q785 221 aa30.47■■■□□ 2.47
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Pald1P70261 859 aa30.47■■■□□ 2.47
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Cdcp1Q5U462 833 aa30.47■■■□□ 2.47
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Uba5Q8VE47 403 aa30.47■■■□□ 2.47
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Slc44a4Q91VA1 707 aa30.47■■■□□ 2.47
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Zswim8Q3UHH1 1832 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Tmem179Q8BHH9 233 aa30.46■■■□□ 2.47
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Eaf2Q91ZD6 262 aa30.46■■■□□ 2.47
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Tubb6Q922F4 447 aa30.45■■■□□ 2.47
Tspan3-201ENSMUST00000034876 CpdO89001 1377 aa30.45■■■□□ 2.47
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Col20a1Q923P0 1320 aa30.45■■■□□ 2.46
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Gm3893E9Q1I1 302 aa30.44■■■□□ 2.46
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Znf326O88291 580 aa30.44■■■□□ 2.46
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ncaph2Q8BSP2 607 aa30.44■■■□□ 2.46
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Stag1Q9D3E6 1258 aa30.44■■■□□ 2.46
Tspan3-201ENSMUST00000034876 ErmnQ5EBJ4 281 aa30.44■■■□□ 2.46
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Pla2g12bQ99P27 195 aa30.44■■■□□ 2.46
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Chd5A2A8L1 1946 aa30.44■■■□□ 2.46
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Frmpd3A0A140LIW3 1774 aa30.43■■■□□ 2.46
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Cfap70D3YVL2 1141 aa30.43■■■□□ 2.46
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Pcdhb22Q91XZ8 794 aa30.43■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24.3 ms