Protein–RNA interactions for Protein: P61092

Siah1a, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1A, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1aP61092 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC45,88■■■■■ 4,94
Siah1aP61092 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42,38■■■■■ 4,37
Siah1aP61092 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,73■■■■■ 4,27
Siah1aP61092 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC40,11■■■■■ 4,01
Siah1aP61092 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,03■■■■■ 4
Siah1aP61092 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39,8■■■■□ 3,96
Siah1aP61092 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39,36■■■■□ 3,89
Siah1aP61092 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,24■■■■□ 3,87
Siah1aP61092 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,82■■■■□ 3,8
Siah1aP61092 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,73■■■■□ 3,79
Siah1aP61092 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,71■■■■□ 3,79
Siah1aP61092 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38,25■■■■□ 3,71
Siah1aP61092 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38,23■■■■□ 3,71
Siah1aP61092 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,08■■■■□ 3,69
Siah1aP61092 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,72■■■■□ 3,63
Siah1aP61092 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,5■■■■□ 3,59
Siah1aP61092 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37,46■■■■□ 3,59
Siah1aP61092 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,23■■■■□ 3,55
Siah1aP61092 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,15■■■■□ 3,54
Siah1aP61092 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37,05■■■■□ 3,52
Siah1aP61092 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37,02■■■■□ 3,52
Siah1aP61092 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36,95■■■■□ 3,51
Siah1aP61092 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,94■■■■□ 3,5
Siah1aP61092 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,87■■■■□ 3,49
Siah1aP61092 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,86■■■■□ 3,49
Siah1aP61092 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36,84■■■■□ 3,49
Siah1aP61092 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,8■■■■□ 3,48
Siah1aP61092 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,79■■■■□ 3,48
Siah1aP61092 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36,65■■■■□ 3,46
Siah1aP61092 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36,5■■■■□ 3,43
Siah1aP61092 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,42■■■■□ 3,42
Siah1aP61092 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,4■■■■□ 3,42
Siah1aP61092 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,39■■■■□ 3,42
Siah1aP61092 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,3■■■■□ 3,4
Siah1aP61092 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36,26■■■■□ 3,4
Siah1aP61092 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36,05■■■■□ 3,36
Siah1aP61092 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35,97■■■■□ 3,35
Siah1aP61092 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,9■■■■□ 3,34
Siah1aP61092 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,78■■■■□ 3,32
Siah1aP61092 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,77■■■■□ 3,32
Siah1aP61092 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,75■■■■□ 3,31
Siah1aP61092 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,56■■■■□ 3,28
Siah1aP61092 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,44■■■■□ 3,26
Siah1aP61092 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35,41■■■■□ 3,26
Siah1aP61092 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,34■■■■□ 3,25
Siah1aP61092 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35,33■■■■□ 3,25
Siah1aP61092 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,3■■■■□ 3,24
Siah1aP61092 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35,24■■■■□ 3,23
Siah1aP61092 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35,22■■■■□ 3,23
Siah1aP61092 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35,13■■■■□ 3,21
Siah1aP61092 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35,1■■■■□ 3,21
Siah1aP61092 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
Siah1aP61092 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35,03■■■■□ 3,2
Siah1aP61092 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,96■■■■□ 3,19
Siah1aP61092 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,91■■■■□ 3,18
Siah1aP61092 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,86■■■■□ 3,17
Siah1aP61092 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34,85■■■■□ 3,17
Siah1aP61092 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34,77■■■■□ 3,16
Siah1aP61092 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34,75■■■■□ 3,15
Siah1aP61092 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,67■■■■□ 3,14
Siah1aP61092 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34,6■■■■□ 3,13
Siah1aP61092 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,53■■■■□ 3,12
Siah1aP61092 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34,53■■■■□ 3,12
Siah1aP61092 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,49■■■■□ 3,11
Siah1aP61092 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,47■■■■□ 3,11
Siah1aP61092 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34,47■■■■□ 3,11
Siah1aP61092 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,45■■■■□ 3,11
Siah1aP61092 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,38■■■■□ 3,09
Siah1aP61092 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,36■■■■□ 3,09
Siah1aP61092 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34,35■■■■□ 3,09
Siah1aP61092 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34,34■■■■□ 3,09
Siah1aP61092 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34,33■■■■□ 3,09
Siah1aP61092 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,32■■■■□ 3,09
Siah1aP61092 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,32■■■■□ 3,09
Siah1aP61092 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34,29■■■■□ 3,08
Siah1aP61092 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,28■■■■□ 3,08
Siah1aP61092 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34,27■■■■□ 3,08
Siah1aP61092 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Siah1aP61092 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,07
Siah1aP61092 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,17■■■■□ 3,06
Siah1aP61092 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34,16■■■■□ 3,06
Siah1aP61092 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34,15■■■■□ 3,06
Siah1aP61092 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34,07■■■■□ 3,05
Siah1aP61092 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
Siah1aP61092 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34,03■■■■□ 3,04
Siah1aP61092 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,03■■■■□ 3,04
Siah1aP61092 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33,97■■■■□ 3,03
Siah1aP61092 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,96■■■■□ 3,03
Siah1aP61092 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Siah1aP61092 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33,89■■■■□ 3,02
Siah1aP61092 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Siah1aP61092 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
Siah1aP61092 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
Siah1aP61092 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,81■■■■□ 3
Siah1aP61092 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33,81■■■■□ 3
Siah1aP61092 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
Siah1aP61092 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33,62■■■□□ 2,97
Siah1aP61092 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
Siah1aP61092 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33,55■■■□□ 2,96
Siah1aP61092 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33,53■■■□□ 2,96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms