Protein–RNA interactions for Protein: A2AD83

Frmd7, FERM domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd7A2AD83 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC45,22■■■■■ 4,83
Frmd7A2AD83 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC41,68■■■■■ 4,26
Frmd7A2AD83 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,08■■■■■ 4,17
Frmd7A2AD83 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,19■■■■■ 4,02
Frmd7A2AD83 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39,76■■■■□ 3,96
Frmd7A2AD83 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,33■■■■□ 3,89
Frmd7A2AD83 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39,12■■■■□ 3,85
Frmd7A2AD83 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38,99■■■■□ 3,83
Frmd7A2AD83 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,88■■■■□ 3,81
Frmd7A2AD83 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,38■■■■□ 3,73
Frmd7A2AD83 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,15■■■■□ 3,7
Frmd7A2AD83 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,77■■■■□ 3,64
Frmd7A2AD83 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37,75■■■■□ 3,63
Frmd7A2AD83 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37,7■■■■□ 3,63
Frmd7A2AD83 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,57■■■■□ 3,6
Frmd7A2AD83 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37,38■■■■□ 3,57
Frmd7A2AD83 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37,14■■■■□ 3,54
Frmd7A2AD83 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,08■■■■□ 3,53
Frmd7A2AD83 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,03■■■■□ 3,52
Frmd7A2AD83 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,97■■■■□ 3,51
Frmd7A2AD83 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,93■■■■□ 3,5
Frmd7A2AD83 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,9■■■■□ 3,5
Frmd7A2AD83 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,77■■■■□ 3,48
Frmd7A2AD83 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,65■■■■□ 3,46
Frmd7A2AD83 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36,63■■■■□ 3,45
Frmd7A2AD83 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,58■■■■□ 3,45
Frmd7A2AD83 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36,56■■■■□ 3,44
Frmd7A2AD83 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36,45■■■■□ 3,43
Frmd7A2AD83 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,43■■■■□ 3,42
Frmd7A2AD83 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36,17■■■■□ 3,38
Frmd7A2AD83 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,99■■■■□ 3,35
Frmd7A2AD83 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35,94■■■■□ 3,34
Frmd7A2AD83 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,9■■■■□ 3,34
Frmd7A2AD83 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35,82■■■■□ 3,32
Frmd7A2AD83 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,76■■■■□ 3,32
Frmd7A2AD83 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,75■■■■□ 3,31
Frmd7A2AD83 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,71■■■■□ 3,31
Frmd7A2AD83 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,7■■■■□ 3,31
Frmd7A2AD83 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,69■■■■□ 3,3
Frmd7A2AD83 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35,63■■■■□ 3,29
Frmd7A2AD83 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35,49■■■■□ 3,27
Frmd7A2AD83 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,29■■■■□ 3,24
Frmd7A2AD83 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35,27■■■■□ 3,24
Frmd7A2AD83 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,16■■■■□ 3,22
Frmd7A2AD83 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,1■■■■□ 3,21
Frmd7A2AD83 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,1■■■■□ 3,21
Frmd7A2AD83 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,09■■■■□ 3,21
Frmd7A2AD83 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
Frmd7A2AD83 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35,02■■■■□ 3,2
Frmd7A2AD83 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34,92■■■■□ 3,18
Frmd7A2AD83 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34,92■■■■□ 3,18
Frmd7A2AD83 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,9■■■■□ 3,18
Frmd7A2AD83 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34,9■■■■□ 3,18
Frmd7A2AD83 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34,79■■■■□ 3,16
Frmd7A2AD83 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,63■■■■□ 3,13
Frmd7A2AD83 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,58■■■■□ 3,13
Frmd7A2AD83 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34,55■■■■□ 3,12
Frmd7A2AD83 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34,55■■■■□ 3,12
Frmd7A2AD83 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34,54■■■■□ 3,12
Frmd7A2AD83 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,54■■■■□ 3,12
Frmd7A2AD83 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34,5■■■■□ 3,11
Frmd7A2AD83 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,49■■■■□ 3,11
Frmd7A2AD83 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34,46■■■■□ 3,11
Frmd7A2AD83 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34,41■■■■□ 3,1
Frmd7A2AD83 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,38■■■■□ 3,09
Frmd7A2AD83 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,38■■■■□ 3,09
Frmd7A2AD83 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,37■■■■□ 3,09
Frmd7A2AD83 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,37■■■■□ 3,09
Frmd7A2AD83 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,35■■■■□ 3,09
Frmd7A2AD83 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,34■■■■□ 3,09
Frmd7A2AD83 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,28■■■■□ 3,08
Frmd7A2AD83 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34,25■■■■□ 3,07
Frmd7A2AD83 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Frmd7A2AD83 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34,08■■■■□ 3,05
Frmd7A2AD83 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Frmd7A2AD83 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34,03■■■■□ 3,04
Frmd7A2AD83 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
Frmd7A2AD83 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34,02■■■■□ 3,04
Frmd7A2AD83 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34,01■■■■□ 3,03
Frmd7A2AD83 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Frmd7A2AD83 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33,92■■■■□ 3,02
Frmd7A2AD83 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33,91■■■■□ 3,02
Frmd7A2AD83 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
Frmd7A2AD83 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
Frmd7A2AD83 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33,78■■■■□ 3
Frmd7A2AD83 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
Frmd7A2AD83 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,71■■■□□ 2,99
Frmd7A2AD83 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33,69■■■□□ 2,98
Frmd7A2AD83 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33,65■■■□□ 2,98
Frmd7A2AD83 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
Frmd7A2AD83 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
Frmd7A2AD83 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
Frmd7A2AD83 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
Frmd7A2AD83 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33,44■■■□□ 2,94
Frmd7A2AD83 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,43■■■□□ 2,94
Frmd7A2AD83 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,42■■■□□ 2,94
Frmd7A2AD83 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,42■■■□□ 2,94
Frmd7A2AD83 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33,37■■■□□ 2,93
Frmd7A2AD83 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,36■■■□□ 2,93
Frmd7A2AD83 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms