Protein–RNA interactions for Protein: A1L317

Krt24, Keratin, type I cytoskeletal 24, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt24A1L317 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC45,63■■■■■ 4,9
Krt24A1L317 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42,14■■■■■ 4,34
Krt24A1L317 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,48■■■■■ 4,23
Krt24A1L317 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,11■■■■■ 4,01
Krt24A1L317 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39,98■■■■□ 3,99
Krt24A1L317 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39,53■■■■□ 3,92
Krt24A1L317 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,25■■■■□ 3,87
Krt24A1L317 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39,2■■■■□ 3,87
Krt24A1L317 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,73■■■■□ 3,79
Krt24A1L317 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,66■■■■□ 3,78
Krt24A1L317 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,49■■■■□ 3,75
Krt24A1L317 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38,05■■■■□ 3,68
Krt24A1L317 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38,05■■■■□ 3,68
Krt24A1L317 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,89■■■■□ 3,66
Krt24A1L317 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,74■■■■□ 3,63
Krt24A1L317 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37,4■■■■□ 3,58
Krt24A1L317 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,29■■■■□ 3,56
Krt24A1L317 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,14■■■■□ 3,54
Krt24A1L317 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,04■■■■□ 3,52
Krt24A1L317 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37■■■■□ 3,51
Krt24A1L317 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,86■■■■□ 3,49
Krt24A1L317 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,85■■■■□ 3,49
Krt24A1L317 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36,85■■■■□ 3,49
Krt24A1L317 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,84■■■■□ 3,49
Krt24A1L317 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36,78■■■■□ 3,48
Krt24A1L317 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,77■■■■□ 3,48
Krt24A1L317 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,66■■■■□ 3,46
Krt24A1L317 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36,63■■■■□ 3,45
Krt24A1L317 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36,55■■■■□ 3,44
Krt24A1L317 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,4■■■■□ 3,42
Krt24A1L317 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36,29■■■■□ 3,4
Krt24A1L317 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,15■■■■□ 3,38
Krt24A1L317 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,13■■■■□ 3,37
Krt24A1L317 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,07■■■■□ 3,36
Krt24A1L317 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36,02■■■■□ 3,36
Krt24A1L317 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35,9■■■■□ 3,34
Krt24A1L317 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35,83■■■■□ 3,33
Krt24A1L317 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,82■■■■□ 3,32
Krt24A1L317 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,81■■■■□ 3,32
Krt24A1L317 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,73■■■■□ 3,31
Krt24A1L317 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,64■■■■□ 3,3
Krt24A1L317 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,59■■■■□ 3,29
Krt24A1L317 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,3■■■■□ 3,24
Krt24A1L317 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,28■■■■□ 3,24
Krt24A1L317 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,23■■■■□ 3,23
Krt24A1L317 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35,19■■■■□ 3,22
Krt24A1L317 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35,18■■■■□ 3,22
Krt24A1L317 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35,15■■■■□ 3,22
Krt24A1L317 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,09■■■■□ 3,21
Krt24A1L317 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35,08■■■■□ 3,21
Krt24A1L317 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35,08■■■■□ 3,21
Krt24A1L317 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,96■■■■□ 3,19
Krt24A1L317 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34,91■■■■□ 3,18
Krt24A1L317 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Krt24A1L317 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34,79■■■■□ 3,16
Krt24A1L317 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34,75■■■■□ 3,15
Krt24A1L317 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34,67■■■■□ 3,14
Krt24A1L317 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,67■■■■□ 3,14
Krt24A1L317 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34,67■■■■□ 3,14
Krt24A1L317 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,55■■■■□ 3,12
Krt24A1L317 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,5■■■■□ 3,11
Krt24A1L317 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,5■■■■□ 3,11
Krt24A1L317 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34,49■■■■□ 3,11
Krt24A1L317 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,46■■■■□ 3,11
Krt24A1L317 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,46■■■■□ 3,11
Krt24A1L317 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34,38■■■■□ 3,09
Krt24A1L317 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,37■■■■□ 3,09
Krt24A1L317 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,35■■■■□ 3,09
Krt24A1L317 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,34■■■■□ 3,09
Krt24A1L317 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Krt24A1L317 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34,31■■■■□ 3,08
Krt24A1L317 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34,3■■■■□ 3,08
Krt24A1L317 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
Krt24A1L317 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,28■■■■□ 3,08
Krt24A1L317 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34,26■■■■□ 3,08
Krt24A1L317 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34,17■■■■□ 3,06
Krt24A1L317 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Krt24A1L317 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34,13■■■■□ 3,05
Krt24A1L317 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Krt24A1L317 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34,03■■■■□ 3,04
Krt24A1L317 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34,03■■■■□ 3,04
Krt24A1L317 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34,02■■■■□ 3,04
Krt24A1L317 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33,99■■■■□ 3,03
Krt24A1L317 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Krt24A1L317 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
Krt24A1L317 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Krt24A1L317 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,82■■■■□ 3,01
Krt24A1L317 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,79■■■■□ 3
Krt24A1L317 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
Krt24A1L317 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33,77■■■■□ 3
Krt24A1L317 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
Krt24A1L317 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,71■■■□□ 2,99
Krt24A1L317 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33,7■■■□□ 2,99
Krt24A1L317 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,68■■■□□ 2,98
Krt24A1L317 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
Krt24A1L317 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33,62■■■□□ 2,97
Krt24A1L317 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,52■■■□□ 2,96
Krt24A1L317 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Krt24A1L317 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33,46■■■□□ 2,95
Krt24A1L317 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33,38■■■□□ 2,93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8,7 ms