Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE47

Uba5, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 5, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba5Q8VE47 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC46.34■■■■■ 5.01
Uba5Q8VE47 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
Uba5Q8VE47 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
Uba5Q8VE47 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
Uba5Q8VE47 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
Uba5Q8VE47 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Uba5Q8VE47 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
Uba5Q8VE47 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Uba5Q8VE47 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Uba5Q8VE47 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Uba5Q8VE47 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
Uba5Q8VE47 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38.64■■■■□ 3.78
Uba5Q8VE47 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Uba5Q8VE47 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
Uba5Q8VE47 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Uba5Q8VE47 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Uba5Q8VE47 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
Uba5Q8VE47 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
Uba5Q8VE47 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Uba5Q8VE47 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Uba5Q8VE47 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Uba5Q8VE47 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Uba5Q8VE47 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Uba5Q8VE47 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Uba5Q8VE47 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Uba5Q8VE47 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Uba5Q8VE47 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Uba5Q8VE47 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Uba5Q8VE47 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Uba5Q8VE47 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Uba5Q8VE47 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
Uba5Q8VE47 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Uba5Q8VE47 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
Uba5Q8VE47 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Uba5Q8VE47 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Uba5Q8VE47 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
Uba5Q8VE47 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Uba5Q8VE47 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Uba5Q8VE47 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Uba5Q8VE47 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Uba5Q8VE47 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Uba5Q8VE47 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Uba5Q8VE47 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Uba5Q8VE47 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Uba5Q8VE47 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Uba5Q8VE47 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Uba5Q8VE47 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Uba5Q8VE47 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Uba5Q8VE47 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Uba5Q8VE47 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Uba5Q8VE47 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Uba5Q8VE47 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Uba5Q8VE47 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Uba5Q8VE47 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Uba5Q8VE47 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
Uba5Q8VE47 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Uba5Q8VE47 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Uba5Q8VE47 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Uba5Q8VE47 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Uba5Q8VE47 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Uba5Q8VE47 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Uba5Q8VE47 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Uba5Q8VE47 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Uba5Q8VE47 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Uba5Q8VE47 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Uba5Q8VE47 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Uba5Q8VE47 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Uba5Q8VE47 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Uba5Q8VE47 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
Uba5Q8VE47 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Uba5Q8VE47 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Uba5Q8VE47 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Uba5Q8VE47 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Uba5Q8VE47 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Uba5Q8VE47 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Uba5Q8VE47 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Uba5Q8VE47 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Uba5Q8VE47 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Uba5Q8VE47 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Uba5Q8VE47 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Uba5Q8VE47 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Uba5Q8VE47 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Uba5Q8VE47 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Uba5Q8VE47 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Uba5Q8VE47 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Uba5Q8VE47 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Uba5Q8VE47 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Uba5Q8VE47 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Uba5Q8VE47 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Uba5Q8VE47 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Uba5Q8VE47 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Uba5Q8VE47 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Uba5Q8VE47 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Uba5Q8VE47 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Uba5Q8VE47 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Uba5Q8VE47 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Uba5Q8VE47 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Uba5Q8VE47 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Uba5Q8VE47 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
Uba5Q8VE47 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms