Protein–RNA interactions for Protein: P70261

Pald1, Paladin, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pald1P70261 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43,7■■■■■ 4,59
Pald1P70261 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,25■■■■■ 4,03
Pald1P70261 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40,15■■■■■ 4,02
Pald1P70261 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,63■■■■□ 3,93
Pald1P70261 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,23■■■■□ 3,87
Pald1P70261 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,91■■■■□ 3,82
Pald1P70261 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38,66■■■■□ 3,78
Pald1P70261 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37,96■■■■□ 3,67
Pald1P70261 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37,69■■■■□ 3,62
Pald1P70261 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,56■■■■□ 3,6
Pald1P70261 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37,36■■■■□ 3,57
Pald1P70261 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,25■■■■□ 3,55
Pald1P70261 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36,95■■■■□ 3,51
Pald1P70261 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,86■■■■□ 3,49
Pald1P70261 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,83■■■■□ 3,49
Pald1P70261 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,77■■■■□ 3,48
Pald1P70261 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36,53■■■■□ 3,44
Pald1P70261 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36,36■■■■□ 3,41
Pald1P70261 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,35■■■■□ 3,41
Pald1P70261 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,33■■■■□ 3,41
Pald1P70261 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,32■■■■□ 3,4
Pald1P70261 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,24■■■■□ 3,39
Pald1P70261 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,15■■■■□ 3,38
Pald1P70261 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,09■■■■□ 3,37
Pald1P70261 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36,05■■■■□ 3,36
Pald1P70261 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,05■■■■□ 3,36
Pald1P70261 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,04■■■■□ 3,36
Pald1P70261 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,98■■■■□ 3,35
Pald1P70261 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,92■■■■□ 3,34
Pald1P70261 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,84■■■■□ 3,33
Pald1P70261 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35,6■■■■□ 3,29
Pald1P70261 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35,56■■■■□ 3,28
Pald1P70261 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35,48■■■■□ 3,27
Pald1P70261 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,43■■■■□ 3,26
Pald1P70261 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,41■■■■□ 3,26
Pald1P70261 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,24■■■■□ 3,23
Pald1P70261 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,17■■■■□ 3,22
Pald1P70261 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
Pald1P70261 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
Pald1P70261 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34,9■■■■□ 3,18
Pald1P70261 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,89■■■■□ 3,18
Pald1P70261 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34,81■■■■□ 3,16
Pald1P70261 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34,61■■■■□ 3,13
Pald1P70261 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,59■■■■□ 3,13
Pald1P70261 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,53■■■■□ 3,12
Pald1P70261 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34,5■■■■□ 3,11
Pald1P70261 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,47■■■■□ 3,11
Pald1P70261 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,46■■■■□ 3,11
Pald1P70261 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34,41■■■■□ 3,1
Pald1P70261 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34,39■■■■□ 3,1
Pald1P70261 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34,36■■■■□ 3,09
Pald1P70261 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,35■■■■□ 3,09
Pald1P70261 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Pald1P70261 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,23■■■■□ 3,07
Pald1P70261 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34,2■■■■□ 3,07
Pald1P70261 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Pald1P70261 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,17■■■■□ 3,06
Pald1P70261 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Pald1P70261 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Pald1P70261 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34,01■■■■□ 3,03
Pald1P70261 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
Pald1P70261 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,9■■■■□ 3,02
Pald1P70261 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33,9■■■■□ 3,02
Pald1P70261 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33,84■■■■□ 3,01
Pald1P70261 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33,83■■■■□ 3,01
Pald1P70261 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,82■■■■□ 3
Pald1P70261 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33,81■■■■□ 3
Pald1P70261 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33,8■■■■□ 3
Pald1P70261 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33,8■■■■□ 3
Pald1P70261 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,77■■■■□ 3
Pald1P70261 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33,73■■■□□ 2,99
Pald1P70261 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,99
Pald1P70261 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33,67■■■□□ 2,98
Pald1P70261 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
Pald1P70261 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
Pald1P70261 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Pald1P70261 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,4■■■□□ 2,94
Pald1P70261 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33,36■■■□□ 2,93
Pald1P70261 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33,33■■■□□ 2,93
Pald1P70261 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33,25■■■□□ 2,91
Pald1P70261 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33,24■■■□□ 2,91
Pald1P70261 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33,21■■■□□ 2,91
Pald1P70261 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,91
Pald1P70261 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,19■■■□□ 2,9
Pald1P70261 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,11■■■□□ 2,89
Pald1P70261 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Pald1P70261 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,08■■■□□ 2,89
Pald1P70261 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,06■■■□□ 2,88
Pald1P70261 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33,03■■■□□ 2,88
Pald1P70261 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,03■■■□□ 2,88
Pald1P70261 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2,87
Pald1P70261 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,98■■■□□ 2,87
Pald1P70261 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32,96■■■□□ 2,87
Pald1P70261 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,94■■■□□ 2,86
Pald1P70261 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
Pald1P70261 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32,88■■■□□ 2,85
Pald1P70261 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32,84■■■□□ 2,85
Pald1P70261 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,83■■■□□ 2,85
Pald1P70261 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,82■■■□□ 2,84
Pald1P70261 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,8 ms